BOTÁNICA - HISTORIA

LA FILOGENIA MOLECULAR .-

Angiospermas	Angiospermas basales
	Mesangiospermas	Magnólidas
		Monocotiledóneas
		Eudicotiledóneas	Eudicotiledónas basales
			Eudicotiledóneas centrales (Gunnéridas)	Rósidas	Fábidas
					Málvidas
				Astéridas	Lámidas
					Campanúlidas

Sistema de clados APG II

clado angiospermas	clado magnólidas
	clado monocotiledóneas	clado commelínidas
	clado eudicotiledóneas	clado gunnéridas	clado rósidas	clado fábidas
				clado málvidas
			clado astéridas	clado lámidas
				clado campanúlidas

APG Angiosperm Phylogeny Group	1998	An ordinal classification for the families of flowering plants	Annals of the Missouri Botanical Garden 85:531–553
APG II	2003	An Update of the Angiosperm Phylogeny Group Classification for the orders and families of flowering plants: APG II.	Botanical Journal of the Linnean Society 141:399-436
APG III	2009	An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III	Botanical Journal of the Linnean Society 161:105–21

	Microsporidia
		Kickxellomycotina
		Zoopagomycotina
		Entomophthoromycotina
	Blastocladiomycota
		Mucoromycotina
	Neocallimastigomycota
	Chytridiomycota
	Gomeromycota
Dikarya	Ascomycota
	Basidiomycota

Hacia finales del siglo XX se acumuló una gran cantidad de información sobre secuencias de ADN de plantas, fundamentalmente del gen rbcL del cloroplasto. 
Los análisis cladísticos permitieron utilizar una gran cantidad de información de bases de datos, elaborando árboles filogenéticos que agrupaban diferentes clados. 
Los resultados obtenidos no sostenían los sistemas filogenéticos clásicos basados fundamentalmente en características morfológicas. 
APG 1998: se propone una nueva clasificación, 462 familias ordenadas en 40 órdenes reunidos en grupos supuestamentemonofiléticos: monocotas, commelinoides, eudicotas, eudicotas nucleares, rósidas y astéridas. 
APG II 2003: las angiospermas se agrupan en 415 familias ordenadas en 59 órdenes que se agrupan en clados. 
Se desarrolla la nomenclatura filogenética, implica que los taxones sean monofiléticos, no aparecen rangos o categorías y se propone abandonar el sistema de tipificación.