La especie tipo, C. fieldsi, fue hallada en la formación Villavieja de Colombia, datando de mediados del Mioceno. También se ha registrado en la formación Solimões en el estado de Acre, Brasil,3 junto a la especie C. sansoai,4 C. fisheri,5 y C. mendesi(originalmente asignado a Brasilosuchus6 ). En 1969, una mandíbula inferior de un crocodiliano que databa del piso Lutetiano del período Eoceno fue encontrado en Saint James Parish, Jamaica, y fue descrito como perteneciente a una nueva especie deCharactosuchus nombrada como C. kugleri.7 8 No obstante, esta especie podría ser considerada sinónimo de Dollosuchus, de acuerdo a investigaciones recientes.9 Dientes aislados que se han considerado pertenecientes al género se han hallado enFlorida y Carolina del Sur, y son de principios del Plioceno.10 Esto se ha considerado evidencia del Gran Intercambio Biótico Americano, con el género apareciendo inicialmente en Norteamérica y luego migrando a Colombia y Brasil.11 Pero esta teoría ya no es muy aceptada,12 aunque la presencia de Charactosuchus en Jamaica bien podría sugerir un origen europeo, lo que implicaría una migración a través de los puentes terrestres de De Geer o de Thule.-
"Crocodylus" acer es una especie extinta de crocodiloide del Eoceno de Utah. Un único cráneo bien preservado fue descrito por el paleontólogo estadounidense Edward Drinker Cope en 1882 y sigue siendo el único resto fósil conocido de esta especie. Fue hallado en la formación Green River de edad del Wasatchiano. "C." acer tenía un largo y estrecho hocico en un cráneo bajo y aplanado.1
Algunos huesos poscraneales han sido atribuidos a "C." acer pero más recientemente se ha sugerido que pertenecen a la especie relacionada "C." affinis.2 Aunque ambas especies inicialmente fueron situadas en el género actual Crocodylus, "C." acery "C." affinis no son verdaderos cocodrilos. Recientes investigaciones los colocan como miembros tempranos de la superfamiliaCrocodyloidea, distantemente relacionados a Crocodylus. Aunque representan un género distinto, un nuevo nombre genérico aún no se ha propuesto para "C." acer.
"Crocodylus" affinis es una especie extinta de crocodiloide del Eoceno de Wyoming. Sus fósiles fueron descritos de la formación Bridger por el paleontólogo estadounidenseOthniel Charles Marsh en 1871. Marsh describió esta especie, junto con las otras especies de crocodiloides de la formación Bridger, bajo el género moderno Crocodylus.1Recientes estudios filogenéticos de los crocodiloides indican que "C." affinis no es una especie de Crocodylus, pero un nuevo género no se ha creado para incluir a esta especie. Otras especies de Bridger como Crocodylus clavis y Brachyuranochampsazangerli han sido sinonimizadas con "C." affinis.
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