Se trata de una doble hélice dextrógira, al igual que el ADN-B, con un surco menor poco profundo y un poco más amplio que el surco mayor, que es más profundo. En comparación a la doble hélice del ADN-B, ésta es más abierta, tiene mayor diámetro y una disposición de las bases nitrogenadas más alejada del eje de la hélice. Las bases nitrogenadas están muy inclinadas respecto de la horizontal, más próximas entre sí y localizadas más simétricamente respecto al centro.
ADN-AADN-BADN-ZSentido de giro de la héliceDextrógiroDextrógiroLevógiroForma y tamañoMás ancha y cortaIntermediaMás estrecha y largaSurco mayorEstrecho, profundoAmplio, profundidad mediaSin profundidadSurco menorAmplio, no profundoEstrecho, profundidad mediaEstrecho, profundoDiámetro de la hélice2,55 nm2,37 nm1,84 nmUnidad estructuralPar de basesPar de basesDos pares de basesPares de bases/vuelta1110,412Distancia entre pares de bases0,23 nm0,34 nm0,53 nm (G·C) / 0,41 nm (C·G)Paso de hélice o vuelta completa2,53 nm3,54 nm4,56 nmRotación por residuo32,7º34,6º–30ºInclinación de los pares de bases19º1,2º9ºBalanceo5,9º-1º–3,4ºAlabeo15,4º11,7º4,4ºPlegamiento del azúcarE C3'-endoE C2'-endoE C2'-endo (pirimidinas) / E C3'-endo (purinas)Conformación enlace N-glucosídicoAntiAntiAnti (pirimidinas) / Syn (purinas)Conformación enlace C4'-C5'+ Sinclinal+ Sinclinal+ Sinclinal (pirimidinas) / Antiperiplanar (purinas)
ADN-Z es una forma de doble hélice levógira (con giro hacia la izquierda) con una conformación del esqueleto en zig-zag. Es una variación que puede realizar el ADN.
Es una doble hélice con enrollamiento hacia la izquierda, tiene 12 pares de bases por giro completo, se puede observar en segmentos de ADN con secuencia alternante de bases púricas y pirimidínicas (GCGCGC), debido a la conformación alternante de los residuos azúcar-fosfato sigue un curso en forma de zig-zag. Requiere una concentración de cationes superior a la del ADN-B. Los grupos fosfato se encuentran más cerca entre ellos a comparación de la forma ADN-B.
La conformación Z está favorecida por un elevado contenido en G-C. Las secuencias de ADN pueden pasar de la forma B hacia la forma Z y viceversa.
Sólo se observa un surco, el emparejamiento entre las bases (que forman el surco mayor -cercano al eje- en la forma ADN-B) está hacia un lateral, en la superficie exterior, lejos del eje.
El conjunto es una doble hélice más estrecha y alargada que el ADN-B; una diferencia notable es que las purinas están en conformación syn-, es decir, la base y la pentosa están situados del mismo lado que el enlace glicosídico: Otra diferencia estructural es que en el ADN-Z la diferencia entre los surcos disminuye, siendo más pequeño el surco mayor y más grande el surco menor. Se sigue diferenciando dichos surcos, pero con más dificultad.
Texto de encabezadoADN-ZADN-AADN-BSentido de Giro de la HéliceLevógiroDextrógiroDextrógiroForma y TamañoMás estrecha y largaMás ancha y cortaIntermediaSurco MayorSin profundidadEstrecho, profundoAmplio, profundidad mediaSurco MenorEstrecho, profundoAmplio, no profundoEstrecho, profundidad menorDiámetro de la Hélice1,84 nm2,55 nm2,37nmUnidad EstructuralDos pares de basesPar de basesPar de basesPares de bases/vuelta121110,4Distancia entre pares de bases0,53 nm (G·C) / 0,41 nm (C·G)0,23 nm0,34nmPaso de hélice o vuelta completa4,56nm2,53nm3,54nmRotación por residuo-30°32,7°34,6°Inclinación de los pares de bases9°19°1,2°Balanceo-3,4°5,9°-1°Alabeo4,4°15,4°11,7°Plegamiento del azúcarE C2'-endo (pirimidinas) / E C3'-endo (purinas)E C3'-endoE C2'-endoConformación enlace N-glucosídicoAnti (pirimidinas) / Syn (purinas)AntiAntiConformación enlace C-4'-C-5'+ Sinclinal (pirimidinas) / Antiperiplanar (purinas)+ Sinclinal+ Sinclinal
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