| Por tamaño y composición |
| | Péptidos |
| Proteínas | Simples Holoproteínas | Solo aminoácidos 50% C 23% O 16% N 7% H 0-3% S |
Compuestas Conjugadas Heteroproteínas | Glucoproteínas | Glúcidos |
| Lipoproteínas | Lípidos |
| Fosfoproteínas | Fosfato |
| Nucleoproteínas | Nucleótidos |
| Hemoproteínas | Grupo Hemo |
| Flavoproteínas | Flavina |
| Metaloproteínas | Metales |
| Por su forma |
| | Fibrosas | Alargadas. aa paralelos a un eje. | Insolubles y resistentes | Elastina . Colágeno . Quratina |
| Globulares | Aproximadamente esféricas. | Generalmente solubles. | Enzimas, transportadoras, |
| Otras Estructuras más complejas | | | Anticuerpos. Miosina. Transmembranales |
| Por el tipo de cadenas polipeptídicas |
| | Cadena única | Una sola cadena polipeptídica |
| Oligoméricas | Formadas por varias cadenas iguales (protómeros) |
| Agregados o Complejos | Formadas por varias cadenas diferentes |
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