martes, 31 de marzo de 2015

genética

ELEMENTOS GENÉTICOS TRANSPONIBLES
Los elementos genéticos transponibles son secuencias de ADN que tienen la propiedad de cambiar de posición dentro del genoma, por tal causa también reciben el nombre de elementos genéticos móviles. Por tanto, cuando cambian de posición y abandonan el lugar en el que estaban, en ese sitio, se produce un deleción o pérdida de bases. Si el elemento transponible estaba insertado en el interior de un gen, puede que se recupere la función de dicho gen. De igual forma, si el elemento genético móvil al cambiar de posición se inserta dentro de un gen se produce una adición de una gran cantidad de nucleótidos que tendrá como consecuencia la pérdida de la función de dicho gen. Por consiguiente, los elementos genéticos transponibles producen mutaciones.
Su existencia fue propuesta por B. McClintock (1951 a 1957) en maíz, sin embargo, su existencia no se demostró hasta mucho más tarde en bacterias. En el fenómeno de la transposición no se ha encontrado una relación clara entre la secuencia de la sede donadora (lugar en el que está el transposón) y la sede aceptora (lugar al que se incorpora el transposón). Algunos transposones muestran una preferencia por una determinada región (zona de 2000 a 3000 pares de bases), pero dentro de ella parecen insertarse al azar.

TRANSPOSONES EN BACTERIAS
La existencia de transposones o elementos genéticos móviles se demostró en bacterias. En bacterias existen dos tipos de elementos genéticos móviles:
Tipos de transposones:
  • Transposón Simple, Secuencia de Inserción o Elemento de Inserción (IS): los transposones simples contienen una secuencia central con información para la transposasa y en los extremos una secuencia repetida en orden inverso. Esta secuencia repetida en orden inverso no es necesariamente idéntica, aunque muy parecida. Cuando un transposón simple se integra en luna determinado punto del ADN aparece una repetición directa de la secuencia diana (5-12 pb).
  • Transposón Compuesto (Tn): contienen un elemento de inserción (IS) en cada extremo en orden directo o inverso y una región central que además suele contener informaciión de otro tipo. Por ejemplo, los Factores de transferencia de resistencia (RTF), poseen información en la zona central para resistencia a antibióticos (cloranfenicol, kanamicina, tetraciclina, etc.).
Transposón simple y transposón compuestoPuntos de integración de IS1, IS2, IS3 y Tn1000
En la siguiente tabla se resumen las principales características de algunos elementos IS:
ElementoLongitudRepetición terminal invertidaRepetición directa de la dianaSelección de la diana
IS1786 pb23 pb9 pbRegional
IS21327 pb41 pb5 pbZona caliente
IS41428 pb18 pb11-12 pbAAAX20 .........XTTT
IS51195 pb16 pb4 pbZona caliente
En la siguiente tabla se resumen las principales características de algunos Transposones compuestos (Tn):
ElementoLongitudMarcador genético (resistencia)MÓDULOS TERMINALES
ISOrientaciónRelación entre ambos
Tn 109300 pbTetraciclinaIS 10InvertidaDivergencia 2,5%
Tn 55700 pbKanamicinaIS 5InvertidaDifieren en 1 pb
Tn 9033100 pbKanamicinaIS 903InvertidaIdénticos
Tn 92500 pbCloranfenicolIS 9DirectaIdénticos (?)
Tanto los elemntos IS como los trasnposones compuestos (Tn) tienen que estar integrados en otra molécula de ADN, el cromosoma principal bacteriano o en un plasmidio, nunca se encuentran libres. En la gráfica anterior se pueden ver los puntos de integración de los Elementos de Inserción IS1, IS2, IS3 y del Transposón compuesto Tn1000 en el cromosoma de E. coli.
Tipos de transposición:
En general se distinguen dos tipos o formas de transposición:
  • Transposición conservativa: el transposón sale de la sede donadora que queda vacía y se incorpora en una nueva sede (sede receptora). No aumenta el número de copiasz del transposón en el interior de la célula.
  • Transposición replicativa: el transposón permanece en la sede donadora y mediante un mecanismo combinado de replicación y recombinación se incorpora en la sede aceptora. Aumenta el número de copias del transposón en el interior de la célula.
Mecanismo de transposiciónTransposición conservativa y replicativa
TRANSPOSONES EN EUCARIONTES
Transposones en maíz
Los transposones fueron descubiertos por B. McClintock (1951 a 1957) en maíz, sin embargo, cuando postuló su existencia la comunidad científica no comprendió adecuadamente sus trabajos. Años más tarde, ella misma comparó los "elementos controladores" que había descrito (elementos cromosómicos transponibles) de maíz con los transposones de los plasmidios. Sus trabajos recibieron el Premio Nobel en 1983.
Dentro de las familias de elementos controladores de maíz hay que distinguir dos clases:
  • Los elementos autónomos: capaces de escindirse de la sede donadora y transponerse.
  • Los elementos No autónomos: son estables, y solamente se vuelven inestables en presencia de los autónomos en posición trans.
B. McClintockTransposones en maíz
En el sistema Ac-Ds (Activador-Disociación) estudiado por B. McClintock, Ac es el elemento autónomo y Ds es el elemento No autónomo. Además del sistema Ac-Ds en maíz se han descrito otros sistemas como el Mu (Mutador), sistema Spm (Supresor-Mutador), sistema R-stippled y sistema MrRm. Algunas características de estos sistemas son las siguientes:
ElementoLongitudCuadros de lectura abiertosRepetición terminal invertidaRepetición directa de la diana
Ac4563 pb311 pb8 pb
Mu1367 pb4213 pb8 pb
Spm8287 pb113 pb3 pb
Transposones en boca de dragón, petunia y soja:
También se han encontrado transposones en otras especies de plantas:
  • Boca de dragón (Anthirrhinum majus): familia de transposones Tam1 (1700 pb), Tam2 y Tam3 (5000 pb).
  • Petunia, soja (Glycine max), etc..
Transposones en levaduras:
Igualmente en levaduras también se han detectado transposones, por ejemplo, el sistema "flip-flop" de control del tipo de apareamiento en Schizosaccharomyces pombe, el modelo en "casette" de Saccharomyces cerevisiae. También, se han dscrito los transposones de la familia Ty (6300 pb).
Transposones en Drosophila melanogaster:
En Drosophila melanogaster se han descrito varias familias de transposones, siendo las más importantes los elementos "copia", elementos P y los elementos FB (foldback). Algunas de sus características son las siguientes:
ElementoCopias por genomaLongitud (pb)Repetición terminal directaRepetición terminal inversaRepetición directa de la diana
Copia20-605000267 pb13 pb5 pb
FB≈30500-5000No250-1250 pb9 pb
P≈50 ó 60500-2000No31 pb8 pb
En Drosophila melanogaster se ha descrito el fenómeno d la Disgénesis híbrida, uno de los sistemas responsables es el sistema P-M. En los cruzamientos ♂ P x ♀ M (machos P capturados en la naturaleza por hembras M del laboratorio) la descendencia híbrida es viable y aparentemente normal, aunque es estéril. En cruzamientos ♂ M x  P (machos del laboratorio por hembras capturadas en la naturaleza) la descendencia es normal y fértil en las sucesivas generaciones. Este diferente comportamiento de los híbridos en las dos direcciones del cruzamiento, se denomina Disgénesis híbrida y se debe a la activación de un elemento P en la línea germinal.
Los Retrovirus también pueden ser considerados como elementos genéticos móviles, presentando algunos una analogía con los elementos copia de Drosophila.
Parecido entre los retrovirus y transsposones de levaduras (Ty y 912) y Drosophila (Copia)
Transposones en mamíferos:
En mamíferos se conocen tres clases de secuencias que son capaces de transponerse o cambiar de posición a través de un ARN intermediario:
  • Retrovirus endógenos: semejantes a los retrovirus, no pueden infectar nuevas células y están restringidos a un genoma, pero pueden transponerse dentro de la célula. Poseen largas secuencias repetidas en los extremos (LTR), genes env (con información para la proteína de la cubierta) y genes que codifican para la trasnrciptasa inversa, como los presentes en retrovirus.
  • Retrotransposones o retroposones: carecen de LTR y de los genes env (con información para la proteína de la cubierta) de retrovirus. Contienen genes para la transcriptasa inversa y pueden transponerse. Tienen una secuencia rica en pares A-T en un extremo. Un ejemplo, son los elementos LINE-1 (elementos largos dispersos) en humanos y ratones.
  • Retropseudogenes: carecen de genes para la transcriptasa inversa y por consiguiente son incapaces de transponerse de forma independiente, aunque si pueden cambiar de posición en presencia de otros elementos móviles que posean información para la trasncriptasa inversa. Poseen una región rica en pares A-T en un extremo y los hay de dos tipos:
    • Pseudogenes procesados: están en bajo número de copias y derivan de genes transcritos por la ARN Poilimerasa II, siendo genes que codifican para polipéptidos. Estos pseudogenes procesados carecen de intrones.
    •  SINES (elementos cortos dispersos): están en alto número de copias en mamíferos. Dos ejemplos son la secuencia Alu de humanos y B1 de ratón, que derivan de genes transcritos por la ARN polimerasa III utilizando un promotor interno.
Esquema de diferentes tipos transposones en mamíferos
La secuencia Alu es la más abundante en el genoma humano, existiendo 750.000 copias dispersas por el genoma, aproximadamente existe una copia cada 4000 pb. Esta secuencia posee un contenido relativamente alto en (G+C) y presenta una elevada homología (70-80%) con la secuencia B1 de ratón. Se la denomina secuencia Alu por poseer en su interior una diana para la endonucleasa de restricción Alu. Las secuencias Alu humanas tienen alrededor de 280 pb y están flanqueadas por repeticiones directas cortas (6-18 pb). Una secuencia típica  Alu es un dímero repetido en tandem, la unidad que se repite tiene un tamaño aproximado de 120 pb y va seguida de una corta secuencia rica en pares A-T. Sin embargo, existe una asimetría en las unidades repetidas, de manera que la segunda unidad contiene una secuencia de 32 pb ausente en la primera. Las unidades repetidas de la secuencia Alu muestran un elevado parecido con la secuencia del ARN 7SL, un componente que juega un papel importante en el transporte de las proteínas a través de la membrana del retículo endoplasmático.

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