biología - biología sistemática

Caliciviridae (del latín calix, "cáliz") es una familia de virus infectivos para animales. Los calicivirus han sido encontrados en la mayoría de los animales domésticos y muchos silvestres, como cerdos, conejos, gallinas y anfibios. Contienen un genoma ARNmonocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore.

Debido a su difícil cultivo y a la inexistencia de un modelo animal apropiado, los calicivirus no han sido bien estudiados. Recientemente los avances en biología molecular están permitiendo conocer el genoma vPoseen un genoma con ARN de cadena sencilla de sentido positivo como ácido nucleico. Albergan dicha información genética en una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría icosaédrica, de un tamaño de 35 a 40 nm. Los viriones se acumulan como partículas aisladas en disposiciones para-cristalinas en el citoplasma, formando microfibrillas en estructuras membranosas.írico.Las infecciones en humanos por el virus de Norwalk y Virus Sapporo usualmente causan gastroenteritis aguda. Los síntomas pueden incluir vómito y diarrea. Estos síntomas surgen después de un periodo de incubación de 2 días y suelen durar sólo 3 días. La mayoría de las infecciones por calicivirus no precisan de atención médica, pero los pacientes inmunocomprometidos pueden necesitar hospitalización para una terapia de rehidratación.

GENOME

Monopartite, linear ssRNA(+) genome of 7.3 to 8.3 kb. The 5’-terminus is linked to a VPg protein and the 3’-terminus has a poly(A) tract.

GENE EXPRESSION

The virion RNA is infectious and serves as both the genome and viral messenger RNA. The genome encodes a polyprotein (ORF1). One or two smaller ORFs are expressed from a subgenomic RNA. Cleavage of ORF1 polyprotein by the virus-encoded 3C-like cysteine proteinase yields the mature nonstructural proteins. The 3’-end terminal ORF encodes a basic protein (and the capsid protein) and is expressed through RNA termination-reinitiation.
Some Norovirus expressan alternative ORF by leaky scanning Vesiviruses are apparently unique among the Caliciviridae in that the ORF2 encodes a capsid precursor protein that is proteolytically processed by the viral proteinase to yield the mature capsid protein.

REPLICATION

CYTOPLASMIC

1. Attachement to host receptors mediates endocytosis of the virus into the host cell.
2. Uncoating, and release of the viral genomic RNA into the cytoplasm.
3. VPg is removed from the viral RNA, which is then translated into a processed ORF1polyprotein to yield the replication proteins.
4. Replication occurs in viral factories. A dsRNA genome is synthesized from the genomic ssRNA(+).
5. The dsRNA genome is transcribed/replicated thereby providing viral mRNAs/new ssRNA(+) genomes.
6. Subgenomic RNA translation gives rise to the capsid protein and VP2.
7. Assembly of new virus particles and release by cell lysis.

Caudovirales es un orden de virus que comprende a la mayor parte de los bacteriófagos (en torno a un 95%). En el marco del esquema de la Clasificación de Baltimore se integran en el Grupo I, ya que tienen un genoma ADN bicatenario. El tamaño del genoma está comprendido entre 18 y 500 kbp. Las partículas virales tienen una forma distintiva con una cabeza icosaedral que contiene el genoma y conectada a una cola. El orden abarca una amplia gama de virus, muchos de los cuales tienen los mismos o similares genes, mientras que la secuencia de nucleótidos puede variar considerablemente, incluso entre el mismo género. Debido a su característica estructura, se cree que comparten un origen común.Al encuentro con una bacteria huésped, la cola del virus se une a los receptores de la superficie celular bacteriana y el virus introduce su ADN en la célula mediante el uso de un mecanismo de inyección. La cola hace un agujero a través de la pared celular y de la membrana plasmática de la bacteria y el genoma pasa por la cola a la célula. Una vez dentro, los genes se expresan mediante la transcripción hecha por la maquinaria huésped, haciendo uso de los ribosomas. Típicamente, el genoma se replica haciendo uso de concatémeros.Las proteínas de la cápside se reúnen para formar una protocabeza, en el que se introduce el genoma. Una vez que esto ha ocurrido, la maduración de la protocabeza se realiza por la división de las unidades de la cápside para formar una cabeza icosaedral con simetría 5. Después de la maduración, la cola se añade por una de dos maneras: o bien la cola se construye por separado y se une con la cabeza, o bien se construye directamente sobre la cabeza del fago. La cola consiste en una hélice de proteínas con simetría 6. Después de la maduración de las partículas virales, la célula es lisada usando lisinas, holinas o una combinación de ambas.

Imagen a través de  https: //lookfordiagnosis.com/mesh_i ...

P1 fago

P1 es un templado bacteriófago (fago) que infecta a Escherichia coli y un algunas otras bacterias. Cuando se someten a un ciclo lisogénico existe el genoma del fago como un plásmido en la bacteria a diferencia de otros fagos (por ejemplo, el fago lambda ) que se integran en el ADN del huésped. * P1 tiene una "cabeza" icosaédrica que contiene el ADN unido a una cola contráctil con seis fibras de la cola. El fago P1 ha ganado interés en la investigación, ya que puede ser utilizado para transducir el fenotipo de una bacteria diana. Como se replica durante su ciclo lítico que capta fragmentos del cromosoma del huésped. Si se utilizan las partículas virales resultantes para infectar un host diferente los fragmentos de ADN capturadas se pueden integrar en el genoma del nuevo huésped. Este método de ingeniería genética en vivo fue ampliamente utilizado durante muchos años y todavía se utiliza hoy en día, aunque en menor medida. P1 también se puede utilizar para crear el cromosoma artificial derivado de P1 vector de clonación que puede llevar relativamente grandes fragmentos de ADN. Además, P1 codifica una recombinasa específica de sitio, Cre, que se utiliza ampliamente para llevar a cabo específica de la célula o por recombinación de ADN que flanquea el ADN diana específica a tiempo con loxP sitios. Imagen a través de  http: //mmbr.asm.org/content/75/3/42 ... Podoviridae Podoviridae es una familia de bacteriófagos . Esta familia se caracteriza por tener muy cortos, colas no contráctiles. Imagen a través de  http: //aem.asm.org/content/72/5/315 ... Pasteurella fago F108 F108 fago Pasteurella es un bacteriófago templado (un virus que infectabacterias ) de la familia Myoviridae , género Hp1likevirus . Su morfología es complejo, con cabeza hexagonal y una cola larga contráctil.