domingo, 19 de julio de 2015

Genomas

Genomas secuenciados

El orangután de Sumatra (Pongo abelii) es una de las dos especies existentes de orangutanes, la más rara. Viven sólo en la isla indonesa de Sumatra. Se diferencian de la otra especie de orangután más que nada en su tamaño, siendo esta especie más pequeña.El informe de la lista roja de especies amenazadas de la IUCN en 2006 reveló que las poblaciones del orangután de Sumatra han decaído en un 47 % durante los siete años previos a 1999 y se cree que en los ocho años anteriores la población decayó en un 50 %. Se cree que esta tendencia seguirá si las circunstancias actuales continúan.
Las principales amenazas que presentan se deben a la destrucción de su hábitat para ampliar la frontera agrícola y la explotación de maderas. Los taladores también cazan a las madres orangutanes, a las cuales dan muerte para vender a sus hijos en el mercado negro de mascotas.
Como resultado del estudio se clasificó la especie en la categoría de en peligro crítico de extinción.1 Esta categoría se reserva a las especies cuya extensión es menor a los 100 km² y su población se calcula en menos de 250 individuos maduros, o si los análisis cuantitativos indican la probabilidad de extinción en la naturaleza del 50% dentro de 10 años o en tres generaciones. Fue incluido en la publicación bianual Los 25 primates en mayor peligro del mundo, 2008-2010.Los orangutanes tienen 48 cromosomas diploides.3 El genoma del orangután de Sumatra fue secuenciado en enero 2011, sobre la base de una hembra en cautividad llamada «Susie».4 Desde la secuenciación del genoma de los seres humanos y de loschimpancés, los orangutanes de Sumatra se han convertido en la tercera especie de homínido5 en tener su genoma secuenciado.4 6
Los investigadores también publicaron menos copias completas de diez orangutanes salvajes, cinco de Borneo y cinco de Sumatra. Se encontró que la diversidad genéticafue menor en los orangutanes de Borneo (Pongo pygmaeus) que en los de Sumatra (Pongo abelii), a pesar de que en Borneo hay entre seis y siete veces más orangutanes que Sumatra. La comparación ha demostrado que estas dos especies divergieron hace unos 400 000 años, más recientemente de lo que se pensaba. También se encontró que el genoma del orangután ha evolucionado mucho más lentamente que el del chimpancé y el de los humano.
Orangután de Sumatra
Man of the woods.JPG
Estado de conservación
En peligro crítico (CR)
En peligro crítico (UICN 3.1)1
Taxonomía
Reino:Animalia
Filo:Chordata
Clase:Mammalia
Orden:Primates
Suborden:Haplorrhini
Infraorden:Simiiformes
Superfamilia:Hominoidea
Familia:Hominidae
Subfamilia:Ponginae
Género:Pongo
Especie:P. abelii
Lesson, 1827
Distribución
Sumatran Orangutan area.png

ReinoFiloClaseOrdenFamilia
ANIMALIACORDATAMAMMALIAPRIMATESHOMINIDAE

Nombre Científico:Pongo abelii
Autoridad de la especie:Lección de 1827
Nombre Común (s):
Inglés-Orangután de Sumatra
Francés-Orangután De Sumatra
Notas taxonómicas:Históricamente, los de Sumatra y Borneo orangutanes fueron considerados subespecies de Pongo pygmaeus (por ejemplo, Courtenay et al . 1988, Rijksen y Meijaard 1997).Recientes revisiones taxonómicas (Groves 2001, Brandon-Jones et al ., 2004) apoyan la aceptación del orangután de Sumatra ( Pongo abelii ) a diferencia de su pariente de Borneo ( Pongo pygmaeus ). Esta clasificación ha sido adoptado ampliamente (por ejemplo, Singleton et al . 2004).

Información de Evaluación [top]

Lista Roja de la categoría y Criterios:A2cd Peligro Crítico ver 3.1
Año de publicación:2008
Fecha evaluados:30/06/2008
Asesor (s):Singleton, I., Wich, SA y Griffiths, M.
Crítico (s):Mittermeier, RA & Williamson, EA (Autoridad de la Lista Roja de Primates)
Justificación:
Se ha producido una disminución estimada de más del 80% en los últimos 75 años (suponiendo una duración de la generación de al menos 25 años; Wich et al en prensa.). Esta disminución continúa, como los bosques dentro de su área de distribución están bajo gran amenaza. La mayoría de los orangutanes se encuentran fuera de las áreas protegidas, incluyendo dentro de las áreas de tala potenciales y los bosques de conversión.Después de un período de relativa estabilidad, la presión sobre estos bosques está aumentando una vez más, como resultado de la reciente acuerdo de paz, y un aumento espectacular de la demanda de madera y otros recursos naturales tras el tsunami de diciembre de 2004.
Historia:
2007-En Peligro Crítico
2000-En Peligro Crítico

Ámbito geográfico [top]

Rango Descripción:Pongo abelii es endémica de la isla de Sumatra, Indonesia. Por lo general, se limita a la zona norte de la isla, al norte del río Batang Toru en la costa oeste de la provincia de Sumatra del Norte (Wich et al . 2003). Alguna vez fue mucho más extendida y las poblaciones se produjo hasta el sur de Jambi y Padang hasta por lo menos la década de 1800 a mediados (ver Rijksen 1978). Hubo informes de su existencia en algunas partes de la provincia de Sumatra Occidental en fecha tan reciente como el 1960. Sin embargo, las encuestas por Wich et al . (2003) no encontraron evidencia de su supervivencia continua al sur del río Batang Toru. La mayoría de los orangutanes de Sumatra salvajes sobrevivir en la provincia de Aceh (más conocido formalmente como Nanggroe Aceh Darussalam, o NAD), en la punta más septentrional de la isla. Hay poblaciones dentro de la provincia de Sumatra del Norte, pero el mayor de ellos también está atravesada por la frontera con Aceh. Sólo dos poblaciones potencialmente viables se encuentran totalmente dentro de la provincia de Sumatra del Norte: West Batang Toru y Este Sarulla, tanto cerca, pero al sur-oeste del lago Toba (para lugares precisos ven Singleton et al2004.). Dentro de Aceh, parches de bosque casi todos los restantes de cualquier tamaño todavía albergan orangutanes en las altitudes más bajas, pero hay pocos, si alguno reproducir las poblaciones en las grandes extensiones de bosque por encima de 1000 m snm.


Países:
Nativo:
Indonesia (Sumatra)
Rango Mapa:Haga clic aquí para abrir el visor de mapas y explorar gama.

Población [top]

Población:La estimación más reciente para Pongo abelii es de alrededor de 7.300 (Singleton et al . 2004), ocupando los bosques que cubren 20.552 km², pero de la que sólo aquellas regiones por debajo de 1.000 m snm (circa 8992 km²) albergan poblaciones de orangutanes permanentes. Cada población enumerados en la Tabla 1 se considera comprender una sola población contigua, pero el aumento de la fragmentación puede dar lugar a otras subdivisiones en el futuro próximo. Todos excepto Seulawah han sido adoptadas por el PNUMA / UNESCO GRASP (Great Ape Survival Programa: ver Caldecott y Miles 2005) iniciativa como poblaciones prioritarias para la conservación.Unos pequeños fragmentos de bosque fuera de los mencionados todavía pueden contener pequeñas cantidades de orangutanes pero ninguno se considera viable en el largo plazo. (Consulte la documentación de apoyo). Siga el siguiente enlace para la Tabla 1: Pongo abelii . poblaciones Además de las poblaciones silvestres, originales anteriores, una nueva población se está estableciendo en el Parque Nacional Bukit Tigapuluh (Jambi y Riau Provincias) a través de la re- introducción de animales domésticos ilegales confiscadas. Esta población cuenta actualmente con alrededor de 70 personas y se está reproduciendo.



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Para más información sobre esta especie, ver39780_Pongo_abelii.pdf .
Un visor de PDF, como Adobe Reader es requerido.
Tendencia de Población: Decreciente

Hábitat y Ecología [top]

Hábitat y Ecología:El orangután de Sumatra es casi exclusivamente arbórea. Las mujeres casi nunca viajan en los machos adultos de tierra y hacerlo sólo en raras ocasiones. Esto está en contraste con los orangutanes de Borneo (especialmente los machos adultos) que más a menudo descienden hasta el suelo. Si bien ambas especies dependen de los bosques primarios de alta calidad, los orangutanes de Borneo parecen más capaces de tolerar la perturbación del hábitat. En Sumatra densidades caen en picado hasta un 60% con la tala selectiva, incluso (véase Rao y van Schaik 1997). orangutanes de Sumatra son principalmente frugívoros, pero también comen hojas, insectos (termitas y hormigas) y, en ocasiones, la carne de loris lento (Fox et al . 2004, Wich et al . 2006). Rangos de hogar femeninas son de 800 a 1500 ha. La verdadera medida de su tamaño masculino rango casa no se conoce totalmente, aunque los rangos de más de 3.000 hectáreas se infieren (Singleton y van Schaik 2001). Las hembras dan a luz al primero de unos 15 años de edad (Wich et al . 2004). Intervalos entre nacimientos son 8/2 a 9/3 años (en comparación con el 6.1 a 7.7 años para P. pygmaeus ; Wich et al . 2004, van Noordwijk y van Schaik 2005) y la gestación dura aproximadamente 254 días (Kingsley 1981). Los machos bimaturism exposición, por lo que los machos adultos plenamente con bridas y los machos más pequeños unflanged son ambos capaces de reproducirse, pero emplean diferentes estrategias de apareamiento para hacerlo (ver Utami Atmoko et al . 2002). La longevidad en la naturaleza se ha estimado en 58 años para los hombres y 53 años para las mujeres (Wich et al . 2004).



Sistemas:Terrestre

Amenazas [top]

Amenaza Major (s):Esta especie se encuentra seriamente amenazada por la tala (legal e ilegal), la conversión por mayor de bosques en plantaciones de palma aceitera de la tierra y la agricultura, y la fragmentación de las carreteras. Los animales también son cazados ilegalmente y capturados para el comercio internacional de mascotas, pero esto parece ser más un síntoma de conversión del hábitat, como los orangutanes son asesinados como plagas cuando atacan los cultivos de frutas en el borde del bosque. Una nueva amenaza es la red de carreteras Ladia Galaska en la provincia de Aceh, que si se legitima por el gobierno será fragmentar rápidamente la mayor parte de las poblaciones enumeradas anteriormente. Otra gran preocupación es la re-emisión de permisos de tala de grandes extensiones de bosque en Aceh. Una evaluación de la pérdida de bosques en la década de 1990 llegó a la conclusión de que los bosques de apoyo al menos 1.000 orangutanes se pierden cada año en el Leuser solo Ecosistema (van Schaik et al . 2001). Estas tasas de pérdida posteriormente cayeron dramáticamente durante gran conflicto civil en la provincia, y la imposición de una moratoria sobre la tala en Aceh. Un acuerdo de paz negociado en 2005 llevó a la estabilidad política y muchas nuevas aplicaciones para abrir las concesiones forestales y fincas de palma aceitera en el hábitat del orangután. En algunas partes de los orangutanes de Sumatra del Norte también están siendo cazados en ocasiones para la comida.




Acciones de conservación [top]

Acciones de conservación:Pongo abelii aparece en el Apéndice I de la CITES y está estrictamente protegida por la legislación nacional de Indonesia (UU 5/1990). Se necesita protección de grandes áreas de bosque primario por debajo de 1.000 m snm para asegurar su futuro a largo plazo.Una fortaleza importante es el área de conservación de Leuser Ecosistema: 2,6 millones de hectáreas de apoyo alrededor del 75% de los restantes orangutanes de Sumatra. El ecosistema de Leuser fue inaugurado por decreto presidencial en 1998 y su conservación se denomina en la Ley del Parlamento no 11/2006 relativo a la gobernanza en Aceh. Gestión del Ecosistema no excluye usos no forestales, pero hace hincapié en la importancia de la gestión sostenible con la conservación de los recursos naturales como el objetivo primario. Dentro del ecosistema de Leuser es el 900 000 hectáreas el Parque Nacional de Gunung Leuser designado, pero esta zona montañosa sólo es compatible con el 25% de los orangutanes. El Parque Nacional de Gunung Leuser es también una reserva Hombre y la Biosfera y Patrimonio de la Selva Tropical de Sumatra Sitio Cluster del Patrimonio Mundial. Fuera del ecosistema de Leuser no hay otras grandes áreas de conservación notables que albergan esta especie. A raíz del tsunami de diciembre de 2004, los esfuerzos también se está trabajando para establecer un segundo ecosistema "Ulu Masen" a lo largo de líneas similares a Leuser, incorporando el noreste y las poblaciones del noroeste de Aceh. Sin embargo, este proceso se encuentra en sus primeras etapas y ya hay amenazas para abrir al menos cuatro concesiones madereras grandes en esta área. 






Propionibacterium acnes es un bacilo Gram-positivo, de crecimiento relativamente lento, no esporulado y anaerobio estricto, aunque se cree que posee aerotolerancia. Se halla en la biota normal de la piel y es catalogado como actor secundario en la infección dérmica. Está vinculado al acné, puede causar blefaritis crónica y es el principal causante de endoftalmitis postquirúrgicas crónicas. Su genoma ha sido secuenciado, poniendo de manifiesto varios genes que podrían generar las enzimas degradantes de la piel y las proteínas inmunogénicas (que activan el sistema inmune).
La bacteria es en gran parte comensal y está presente en la piel de la mayoría de las personas alimentándose de los ácidos grasos del sebo secretado por los poros desde las glándulas sebáceas. También puede encontrarse en todo el aparato digestivo del ser humano y de muchos otros animales. Su nombre se deriva de la capacidad de la bacteria de generar ácido propiónico.Cuando un poro de la piel se bloquea, esta bacteria anaerobia prolifera y segrega sustancias químicas que rompen la pared del poro, derramando bacterias como elStaphylococcus aureus en la piel y originando una lesión de acné (foliculitis). También se la ha encontrado en úlceras de córnea. En contadas ocasiones se han reportado daños en las válvulas del corazón ocasionando endocarditis y también infecciones de las articulaciones (artritis séptica). Además, Propionibacterium se han encontrado en los puntos de inserción de ventriculostomia y en las suturas subcutáneas de pacientes que han sido sometidos a craneotomía.P. acnes es sensible al peróxido de benzoilo, al grupo de la tetraciclina, otros antibióticos y muchos preparados antibacterianos. Sin embargo, son frecuentes las cepas resistentes a la tetraciclina. La clindamicina es también de uso frecuente. Recientemente se ha mostrado que P. acnes es sensible a algunos macrólidos como la azitromicina, que tiene un amplio espectro de acción. Normalmente se prescriben 500 mg por vía oral, tres veces por semana durante 4 a 6 semanas. La azitromicina exhibe un efecto post-antibiótico concentrándose en el tejido pulmonar durante aproximadamente cinco días. De hecho, debe utilizarse alguna crema o pomada antibacteriana durante el tratamiento, lo que da un buen efecto local. Otro antibiótico es el nadifloxacino del grupo de los llamados 4-fluoroquinolonas tales como ciprofloxacinoofloxacino y levofloxacino. Tiene acción contra P. acnes y algunos otros microorganismos que pueden tomar parte en una poli-infección.

Propionibacterium acnes
Propionibacterium acnes.tif
Taxonomía
Filo:Actinobacteria
Orden:Actinomycetales
Suborden:Propionibacterineae
Familia:Propionibacteriaceae
Género:Propionibacterium
Especie:P. acnes
(Gilchrist 1900)
Douglas & Gunter 1946
El acne vulgaris acné común es la pesadilla de muchos de vosotros. Veo que sólo leyéndolo, se te ha puesto cara de asqueado y no hay para menos: parece un castigo divino. Pero es algo con lo que deberás vivir hasta que se te pase: ponerte nervioso por eso sólo lo empeora.
Hemos hablado del acné en varios posts y cómo combatirlo. Hoy quisiera explicaros qué es y porqué sale este acné, los granos y el pus. Tranquilo que no es ningun castigo divino: es un castigo hormonal injusto.
La principal causa ya la sabeis todos: se sufre principalmente en la adolescencia que es cuando las hormonas se disparan, hay un desequilibrio excesivo tipo fiesta de Carnaval y en vez de resaca sale el acné. Si no cuidas el estrés, sigue y sigue durante años.
Acne
En la foto podeis ver un hermoso pelo en su folículo piloso que recibe el sebo de la glándula sebácea. Cuando se da al mismo tiempo un taponamiento (al poro le da por cerrarse) y más células muertas de lo normal, la glándula que segrega el sebo anda perdida y echa sebo a chorros formando una bola.
Ese exceso de sebo provoca, ¿os suena? Pues sí, toma grano. Ahí es donde la bacteriaPropionibacterium acnes está en su salsa y prolifera, creando una inflamación en la zona (por eso duele). El sistema inmunológico lo detecta y planta cara creando pus: el resto ya lo conoceis.
Hay quien sufre de granitos pero no de pus: tiene suerte de que a la bacteria no le mole tanto su piel como la tuya. Eso depende de cada piel, no es nada que tú hagas mal. Debes mantener la piel limpia con un jabón especial pieles grasas y/o acneicas y la mascarilla de la misma linea.
La cosmética con el acné te puede ayudar mucho, sírvete de ella. Como siempre, infórmate primero de lo que vas a comprar y cómo utilizarlo. Y por lo que más quieras: no te toques la cara ni hagas explotar los granos.

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