Bacteriófagos
Caudovirales es un orden de virus que comprende a la mayor parte de losbacteriófagos (en torno a un 95%). En el marco del esquema de la Clasificación de Baltimore se integran en el Grupo I, ya que tienen un genoma ADN bicatenario. El tamaño del genoma está comprendido entre 18 y 500 kbp. Las partículas virales tienen una forma distintiva con una cabeza icosaedral que contiene el genoma y conectada a una cola. El orden abarca una amplia gama de virus, muchos de los cuales tienen los mismos o similares genes, mientras que la secuencia de nucleótidos puede variar considerablemente, incluso entre el mismo género. Debido a su característica estructura, se cree que comparten un origen común.Al encuentro con una bacteria huésped, la cola del virus se une a los receptores de la superficie celular bacteriana y el virus introduce su ADN en la célula mediante el uso de un mecanismo de inyección. La cola hace un agujero a través de la pared celular y de la membrana plasmática de la bacteria y el genoma pasa por la cola a la célula. Una vez dentro, los genes se expresan mediante la transcripción hecha por la maquinaria huésped, haciendo uso de los ribosomas. Típicamente, el genoma se replica haciendo uso de concatémeros.
Ensamblado y maduración
Las proteínas de la cápside se reúnen para formar una protocabeza, en el que se introduce el genoma. Una vez que esto ha ocurrido, la maduración de la protocabeza se realiza por la división de las unidades de la cápside para formar una cabeza icosaedral con simetría 5. Después de la maduración, la cola se añade por una de dos maneras: o bien la cola se construye por separado y se une con la cabeza, o bien se construye directamente sobre la cabeza del fago. La cola consiste en una hélice de proteínas con simetría 6. Después de la maduración de las partículas virales, la célula es lisada usando lisinas, holinas o una combinación de ambas.
Bacteriófagos con cola tienen un origen común y constituyen un pedido con tres familias, nombrados Caudovirales. Su cola estructurada es único.Fagos cola comparten una serie de características taxonómicas de alto nivel y muestran muchas características facultativas que son únicos o raros en los virus, por ejemplo, los apéndices de la cola y las bases inusuales. Ellos comparten con otros virus, especialmente los herpesvirus, elementos de la morfogénesis y el estilo de vida que se atribuyen a la evolución convergente. Fagos cola presentes tres tipos de lisogenia, ejemplificados por fagos lambda, Mu, y P1. Lisogenia aparece como una propiedad secundaria adquirido por transferencia horizontal de genes.Amino alineamientos de secuencias de ácido (en particular de ADN polimerasas, integrasas y hidrolasas peptidoglicano) indican eventos frecuentes de la transferencia horizontal de genes en fagos de cola. Proteínas de la cápside común y de la cola no se han detectado. Fagos cola posiblemente evolucionaron a partir de pequeñas conchas de proteínas con unos pocos genes suficientes para un nivel basal de infección productiva. Esta etapa inicial ya no puede ser rastreada. En un momento dado, este fago precursor quedó perfeccionado. Algunas de sus características eran lo suficientemente perfecto para ser transmitida hasta hoy. Es tentador para listar las principales propiedades actuales de fagos de cola en el tiempo pasado para construir una historia tentativa de estos virus: 1. fagos Atado originó a principios del Precámbrico, mucho antes de los eucariotas y sus virus. 2. El fago ur-cola, ya un virus muy evolucionada, tenía una cabeza icosaédrica de aproximadamente 60 nm de diámetro y una cola larga no contráctil con simetría séxtuple. La cápside contiene una sola molécula de ADN de doble cadena de aproximadamente 50 kb, y la cola probablemente fue provisto de un aparato de fijación. La cabeza y la cola se mantienen unidas por un conector. a. La partícula no contenía lípidos, era más pesado que la mayoría de los virus que vienen, y tenía un alto contenido de ADN proporcional a su tamaño cápside (alrededor del 50%). b.La mayor parte de su ADN codifica para proteínas estructurales. Morphopoietic genes agrupados en un extremo del genoma, con genes de cabeza precedentes genes de la cola. Enzimas líticas fueron probablemente codifican para. Una parte del genoma del fago era no esencial y posiblemente bacteriana. Fueron cola fagos transductantes generales desde el comienzo? 3. El virus infectó su huésped desde el exterior, la inyección de su ADN. Replicación involucrados transcripción en varias oleadas y la formación de concatemers ADN. Novel fagos fueron liberados por la explosión de la célula infectada después de la lisis de las membranas de acogida por una hidrolasa peptidoglicano (y una holina?). a. Cápsides se ensamblan a partir de un punto de partida, el conector, y alrededor de un andamio. Ellos fueron sometidos a un proceso de maduración elaborado que implica corte de la proteína y la expansión de la cápside. Cara y cruz se reunieron por separado y se unieron más tarde. b. El ADN fue cortado al tamaño y entró cápsides preformados por un mecanismo de cabeza llena. 4. Los fagos Posteriormente, cola diversificadas por: a. Evolucionando contráctil o de las colas cortas y cabezas alargadas. b. El intercambio de genes o fragmentos de genes con otros fagos. c. Convertirse templado mediante la adquisición de un complejo de la integrasa escisionasa, partes de plásmidos o transposones. d. La adquisición de ADN y ARN polimerasas y otras enzimas de replicación. e. El intercambio de genes de lisina con sus anfitriones. f. La pérdida de la capacidad para formar concatemers como consecuencia de la adquisición de transposones (MU) o ADN polimerasas proteinprimed (phi 29). Hoy en día los fagos cola aparecen como quimeras, pero su origen monofilético todavía se inscriben en su morfología, la estructura del genoma, y la estrategia de replicación. También puede ser evidente en la estructura tridimensional de las proteínas de la cápside y de la cola. Es poco probable que se encuentran en las secuencias de aminoácidos porque las proteínas constitutivas deben ser tan viejo que las relaciones fueron borrados y la mayor parte o la totalidad Replicación, lysogeny- y proteínas relacionadas lisis-parecen haber sido prestado. Sin embargo, la suma de las propiedades de fagos de cola y el comportamiento es tan característico que los fagos de cola no se pueden confundir con otros virus.
| Caudovirales |
Estructura taxonómica de la Familia
Solicitar 02. CaudoviralesFamilia 02,043. Myoviridae Género 02.043.0.01.
"virus T4-como"
Género 02.043.0.02. "virus P1-como"
Género 02.043.0.03. "virus P2-como"
Género 02.043.0.04. "virus Mu-como"
Género 02.043.0.05. "virus SPO1-como"
Género 02.043.0.06. "virus φH-como"
Familia 02,066. Siphoviridae Género 02.066.0.01.
"virus-λ como"
Género 02.066.0.02. "virus-T1 como"
Género 02.066.0.03. "virus-T5 como"
Género 02.066.0.04. "virus-c2 como"
Género 02.066.0.05. "virus L5-como"
Género 02.066.0.06. "virus ψM1-como"
Familia 02,054. Podoviridae Género 02.054.0.01.
"virus-T7 como"
Género 02.054.0.02. "virus-P22 como"
Género 02.054.0.03. "virus-φ29 como"
Similitud con otros taxa
Virus bacterianos de cola se asemejan Tectiviridae por la presencia de una estructura de tipo cola para la inyección de ADN, pero se diferencian de ellos por la naturaleza permanente de sus tailes. Virus de cola se parecen Herpesviridae en la morfogénesis (uso de proteínas de andamiaje, packageging de ADN en cáscaras preformadas, maduración de procapsids por escisión proteolítica, y expansión de la cápside) y el flujo de la replicación. Además, los fagos de cola templadas y Herpesviridae son capaces de establecer infecciones latentes.
Derivación de Nombre
Caudo : del latín cauda , "cola" Myo : del griego mys , Myos , "músculo", en relación con la cola contráctil Podo : del griego Pous , "pie", de cola corta Sipho : del griego sifón , "tubo"
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Estructura taxonómica de la Familia
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| Familia 02,043. Myoviridae Género 02.043.0.01. "virus T4-como" Género 02.043.0.02. "virus-P1 como" Género 02.043.0.03. "virus-P2 como" Género 02.043.0.04. "virus-Mu como" Género 02,043 .0.05. "virus-SPO1 como" Género 02.043.0.06. "virus-φH como" Género 02.043.0.07. "virus-PBS1 como"Género 02.043.0.00. sin asignar |
02.043.0.01. "virus T4-como"
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02.043.0.01.001. Fago T4
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
Las especies difieren en la gama de huéspedes, la longitud de la cápside, propiedades serológicas, y, en la medida, la homología del ADN y de aminoácidos como secuencias conocidas. Longitud de la cápside es 137 nm para Aeromonas fago Aeh1 (Aeh1) y Vibrio fago nt-1 (nt-1) y 111 nm para una serie de otras especies. Fago T4 y Enterobacterias fagos SV14 (SV14) están en diferentes grupos de hibridación.Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(133)
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(44RR2.8t)
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(40RR2.8t)
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(Sesenta y cinco)
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(Aeh1)
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(D2A)
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(D8)
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(SV14)
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(C16)
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(F10)
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(Fsα)
| |||
(Fs alfa)
| |||
(PST)
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(SKII)
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(SKV)
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(SKX)
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(SV3)
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(T2)
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(T4)
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(T6)
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(42)
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(42)
| |||
(NT-1)
| |||
(KVP20)
| |||
(KVP40)
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Especies provisionales en el género
(E4)
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(E5)
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(Aer1)
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(25)
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(31)
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(AE1)
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(AE1)
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(11F)
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(3)
| |||
(3T +)
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(50)
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(5845)
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(66F)
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(8893)
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(36.770)
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(Α1)
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(Alfa 1)
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(DDV1)
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(F7)
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(K13)
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(RB42)
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(RB43)
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(RB49)
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(RB69)
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(SMB)
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(SMP2)
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02.043.0.02. "virus-P1 como"
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02.043.0.02.001. Enterobacterias fagos P1
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
Las especies difieren en la gama de huéspedes y la longitud de la cola (fago P1, 228 nm; fago PID, 240 nm, y fago 43, 170 nm).Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(43)
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(P1)
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(P1D)
| |||
(P7)
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Especies provisionales en el género
(PKG-2)
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(PKG-3)
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(D6)
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(ΦW39)
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(PhiW39)
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(J2)
| |||
(PP8)
| |||
(ΦVP253)
| |||
(PhiVP253)
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(P147)
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02.043.0.03. "virus-P2 como"
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02.043.0.03.001. Enterobacterias fagos P2
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
Las especies difieren en la gama de huéspedes y la homología de ADN.Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(P2)
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(HP1)
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(S2)
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Especies provisionales en el género
(29)
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(37)
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(PIIBNV6)
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(ΦCr24)
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(PhiCr24)
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(186)
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(299)
| |||
(Beccles)
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(Pk)
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(Wφ)
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(WPHI)
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(HP2)
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(HP2)
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(AU)
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(ΦCTX)
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(PhiCTX)
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(PSP3)
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(Φgal-1 / R)
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(Phigal-1 / R)
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(WT1)
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(Fels-2)
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(K139)
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(X29)
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02.043.0.04. "virus Mu-like"
| ||
02.043.0.04.001. Enterobacterias fago Mu
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
No aplica.Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(D108)
| |||
(Mu)
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(Mu-1)
|
Especies provisionales en el género
(B3)
| |||
(B39)
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(D3112)
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(PM69)
| |||
(VcA3)
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02.043.0.05. "virus-SPO1 como"
| ||
02.043.0.05.001. Bacillus fago SPO1
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
No aplica.Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(SPO1)
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(SP8)
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(SP82)
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Especies provisionales en el género
(AR1)
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(GS1)
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(I9)
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(PNL-1)
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(SP5)
| |||
(SP5)
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(SO)
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(Φe)
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(Phie)
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(Φ25)
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(Phi25)
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(2C)
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(222a)
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02.043.0.06. "virus-φH como" (virus phiH similares)
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02.043.0.06.001. Halobacterium fago φH
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
No aplica.Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(ΦH)
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(PhiH)
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Especies provisionales en el género
(HS1)
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02.043.0.07. PBS1-como virus (propuesta)
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Lista de Criterios Especies demarcación en el género
No aplica.Lista de especies en el género
El código del virus ICTVdB y los virus. Oficiales de virus nombres de las especies están en cursiva.Tentativos nombres de especies de virus, alternativas (nombres), aislamientos , cepas , serotipos ,subespecies o nombres rechazados . No se cursiva códigos de virus, nombres de virus, los números de acceso de la secuencia del genoma [] y abreviaturas () asignados, son:
Especies, sus serotipos, cepas y aislamientos
(PBS1)
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(PBS1)
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Especies provisionales en el género
(AR9)
| |||
(110)
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(PMB12)
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(3NT)
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Lista de los no asignados Los virus en la Familia
(A3 / 2)
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(A10 / 45)
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(BS46)
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(E14)
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(SK1)
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(108/016)
| |||
(AeH2)
| |||
(51)
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(59.1)
| |||
(A6)
| |||
(Bace-11)
| |||
(CP-54)
| |||
(G)
| |||
(MP13)
| |||
(PBS1)
| |||
(PBS1)
| |||
(SP3)
| |||
(SP10)
| |||
(SP15)
| |||
(SP50)
| |||
(Spy-2)
| |||
(Spy-3)
| |||
(SST)
| |||
(HM3)
| |||
(CEβ)
| |||
(CEbeta)
| |||
(A19)
| |||
(AS-1)
| |||
(N1)
| |||
(S-6 '(L))
| |||
(FC3-9)
| |||
(Kl9)
| |||
(ΦP27)
| |||
(PhiP27)
| |||
(01)
| |||
(VII)
| |||
(Φ92)
| |||
(Phi92)
| |||
(121)
| |||
(16-19)
| |||
(9266)
| |||
(HF2)
| |||
(Vie)
| |||
(Hv)
| |||
(Hw)
| |||
(A511)
| |||
(4211)
| |||
(Br1)
| |||
(I3)
| |||
(Bxz1)
| |||
(PB-1)
| |||
(PS17)
| |||
(ΦKZ)
| |||
(PhiKZ)
| |||
(ΦW-14)
| |||
(Phil-14)
| |||
(12S)
| |||
(CM1)
| |||
(CT4)
| |||
(M)
| |||
(SFV)
| |||
(SFV)
| |||
(XP5)
| |||
(Kappa)
| |||
(06N-22P)
| |||
(VP1)
| |||
(II)
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Similitud con otros taxones
Virus bacterianos de cola se asemejan Tectiviridae por la presencia de una cola de tipo de estructura para la inyección de ADN, pero se diferencian de ellos por la naturaleza permanente de sus colas. Virus de cola se parecen Herpesviridae en la morfogénesis (uso de proteínas de andamiaje, envases de ADN en cáscaras preformadas, maduración de procapsids por escisión proteolítica y la expansión de la cápside) y el flujo de la replicación. Además, los fagos de cola templadas y Herpesviridae son capaces de establecer infecciones latentes.
Derivación de los Nombres
Myo : del griego mi , Myos , "músculo", en referencia a la cola contráctil.
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