Microbiología

Bacteriófagos

Cystoviridae es una familia de virus infectivos para bacterias Gram negativas(bacteriófagos). Presentan un genoma ARN bicatenario por lo que se incluyen en elGrupo III de la Clasificación de Baltimore. La cápside está estructuralmente definida por una simetría compleja y poseen una envoltura viral.¹ El único género de la familia esCystovirus.

Todos los cystovirus se caracterizan por sus tres cadenas (análogas a cromosomas) de ARN bicatenario, totalizando aproximadamente 14 kb, sus proteínas y una capa exteriorlipídica. No se conocen otros bacteriófagos que tengan lípidos en su cubierta exterior, aunque Tectiviridae y Corticoviridae tienen lípidos dentro de su cápside.

La mayoría de los cystovirus identificados infectan a las especies de Pseudomonas, pero esto puede ser un sesgo del método de selección y enriquecimiento.² La especie tipo es Fago Φ6 de Pseudomonas, pero se conocen muchos más miembros de esta familia, de los cuales tienen nombre Φ7, Φ8, Φ9, Φ10, Φ11, Φ12 y Φ13,³ y muchos otros han sido aislados.²

Cystoviridae parece estar íntimamente relacionado con Reoviridae,⁴ pero también comparte homologías con Totiviridae. Los cystovirus son los únicos bacteriófagos que parecen estar más relacionados con los virus de los eucariontes que con los otros fagos.

Cystoviridae

Virión

Envolvió, virión esférico de 85 nm de diámetro. El virión tiene una estructura de doble cápside: la cápside externa tiene una T = 13 simetría icosaédrica y la cápside interna tiene una T = 2 simetría icosaédrica . esquemas de maduración viriones

GENOMA

Segmentado lineal genoma ARN de doble cadena . Contiene 3 segmentos: Grande (L), Medio (M) ans Pequeño (S) que codifican 12 proteínas. Segmentos rango de tamaño de 2,9 kb a 6,4 kb. Tamaño total del genoma es 13,3 Kb.

LA EXPRESION GENICA

Cada segmentos codifican para un ARNm polycystronic, traducida a varias proteínas de la maquinaria de traducción procariótica.

RÉPLICA

CITOPLÁSMICA

1. Hay dos procesos de unión diferentes en función de las especies consideradas.Multimérica proteína P3 adsorción de acoger tipo IV pili que retrae con lo que el virión en contacto con la membrana de acogida (por ejemplo Phi6). En otras especies, el apegoaparato es un conjunto de proteínas heteromérico que utiliza el lipopolisacárido rugoso como un receptor (por ejemplo Phi8, Phi12 o Phi13).
2. P6 proteína media la fusión de membrana del virus con el anfitrión de la membrana externa, la liberación de la cápside en el espacio periplásmico.
3. El P5 enzima lítica en la superficie de la cápside digiere la capa de peptidoglicano de la acogida
4. La cápside entra en el citoplasma, posiblemente, a través de la permeabilización de la membrana plasmática de acogida. P8 proteína, que puede estar implicada en este proceso, se disocia de la cápside viral. El resto de la cápside se libera en el citoplasma de acogida.
5. Genómica dsRNA permanece cerrado por la cápside interna, con lo que "esconder" de mecanismo antiviral anfitrión.
6. Polycystronic ARNm se transcribe por el viral de ARN dependiente de ARN polimerasa P2 (RdRp) dentro de la partícula de núcleo y se libera en el citoplasma de la célula, de modo que dsRNA nunca se expone al citoplasma. De larga duración, más hebras transcripciones de cada uno de los segmentos de ARN de doble cadena se sintetizan. Estas transcripciones más filamento se utilizan como plantillas para la traducción.
7. Proteínas Neo-sintetizado ensamblan en nuevas cápsides. El embalaje NTPase P4 transloca los tres ARN de cadena simple (+) segmentos genómicos en las cápsidas donde se convierten en dsRNA por la RdRp viral P2.
8. La cápside está madurando y envuelto en el citoplasma.
9. Viriones maduros son liberados de la célula por lisis .

El Libro Grande Imagen de virus: Cystoviridae

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Taxonomía: Sinónimo (s): phif] grupo 6 fago. Descripción está en el nivel taxonómico de familia. Taxón contiene la siguiente Género cystoviridae.

Organiza: Taxón infecta bacterias.

Genoma: Lineal; doble cadena; RNA. Tripartita Genoma. Genoma encuentra en un tipo de única partícula. Genoma total 13.379 nucleótidos de largo. Número de nucleótidos del segmento más grande L 6374. Por segundo más grande M 4057. Por tercera secuencia de nucleótidos S 2948. depositado en el EMBL / GenBank bajo el número siguiente de L y S M17461 M12921. Guanina + citosina relación de 55,2%, o 56,7%, o 55,5% (para L, M y S, respectivamente).

Morfología: Los viriones uniformes en forma; esferoidal; envuelto; 86 nm de diámetro. Proyecciones de superficie de envolvente distinta; 8 puntos largos nm. Nucleocápsides isométricas; 58 nm de diámetro. Icosaédrica Simetría. Shell de virión con una sola capa. Core es un complejo polimerasa dodecaédrica de alrededor de 43 nm.

(Nota: para obtener más información sobre la taxonomía y la estructura de este virus, consulte la base de datos ICTV a continuación.)

Más Información:
Taxonomía:	ICTV datos
Sitios WWW:	No hay sitios!
Tutoriales:	Ninguno Disponible

Cystoviridae archivo:
Género	EM Imágenes	Ejemplo Nombre Virus	Descripción de la Imagen
Cystoviridae		Pseudomonas syringae fago phi6	La Figura muestra una vista de la superficie 2f de la nucleocápside de phi6 donde es de color blanco la proteína de la nucleocápside principal y las proteínas del complejo de polimerasa se muestran en naranja. Por Sarah J Carnicero en la División de Virología una asociación en la Universidad de Glasgow.

Familia Cystoviridae ) 

(Disponible como un archivo de Word)  Última modificación 11/09/2002

dsRNA (Tamaño, pb) [5,8,20,23]	Marcos de lectura abiertos (ORFs) [5,8,20,23]	Proteínas ( ' : estructura de la proteína / función)	Tamaño 'aa' (kDa) [5,8,20,23]	número de copias de proteína por partículas	ubicación	Función
L (6374)	Gen 1	P1 (T = 2)	769 (84.986)	120 [2. 6]	shell partícula interior	Auto ensambla con proteínas P2, P4 y P7 en partículas procapsid [9, 29]. Corresponde a la partícula T = 2 en BTV [11]. Controles procapsid tamaño y organización. Enlaza proteínas menores y ARN. Conservadas en los virus de ARN de doble cadena.
L	Gen 2	P2 (pol) [3, 18, 19]	664 (74.791)	12 [6]	partícula interior	Semi-conservador RNA polimerasa dependiente de RNA [34, 35]. Proteína aislada actúa sobre ss y las plantillas de dsRNA [18, 19]. Estructura tridimensional homóloga a la transcriptasa inversa y la hepatitis C polimerasa del VIH [3]. Sitios para la unión de ácidos nucleicos, PNT, Mn y Mg iones conocidos [3].
M (4063)	Gen 3	P3 (pico) [17]	648 (69.178)		se extiende desde la superficie del virión [17] y está unido a la P6 proteína integral de membrana [25]	Se une al receptor [25], el pilus IV de Pseudomonas syringae [30, 31]
L	Gen 4	P4 (NTPasa) [7, 10, 16]	331 (35.032)	72 [7]	partícula interior en 5 ejes de pliegue [7]	Hexameric NTPasa, simetría descalce [7, 10, 16]. Poderes del embalaje de ssRNA precursores genómicas y está implicado en la transcripción [27]. Nuclea la asamblea de la procapsid con P1 [29]
S (2.948)	Gen 5	P5 (mur) [4, 12, 21]	219 (24.018)		entre la membrana y NC [12]	Enzima Muralytic expuesto a la sede de la capa de peptidoglicano después de la fusión de la membrana durante la entrada viral. También se usa para lisar la célula huésped tarde en la infección para liberar el virus [4, 12, 21].
M	Gen 6	P6 (fus) [ 1 ]	167 (17.229)		Membrana [32]	Proteína integral de membrana que tiene actividad de fusión de membrana y se une la proteína de unión a receptor, P3 [1, 25, 32].
L	Gen 7	P7 (factor de montaje) [29]	160 (17.169)	60 [15]	partícula interior [15]	Dimérica, estabiliza la procapsid [15]. Aumenta la velocidad de montaje de la procapsid in vitro [29]
S	Gen 8	P8 (T = 13) [2]	148 (15.873)	600 [2, 29]	segunda capa de proteína [2]	Un trímero [29] que forma la cáscara T = 13 nucleocápside alrededor de la partícula interior dsRNA que contienen (núcleo) [2]. Durante la entrada P8 impulsa la penetración de la nucleocápside en el citoplasma [26, 28].
S	Gen 9	P9 (env) [13, 32, 33]	89 (9.482)		Membrana [32]	Proteína principal de la membrana, esencial para la formación de la membrana [13, 32, 33]
M	Gen 10	P10 (lys) [ 14 ]	42 (4.272)		Membrana [32]	Necesario para la lisis celular [14]
S	Gen 12	P12 (Asamblea) [13. 22, 25]	195 (20.293)	0	No estructural [32]	Factor activo en la morfogénesis de la membrana viral [13, 22, 25] Asamblea.
M	Gen 13	P13	72 (7.649)		Membrana [8]	Menor, la proteína no esencial de la membrana [8, 24]
L	Gen 14	P14	61 (6.810)	0	No estructural [5]	No esencial [5].

' : ': Para facilitar la comparación de proteínas a través de especies, géneros y familias, estructura de la proteína / indicadores de función se han añadido a los nombres de proteínas, por ejemplo, (pol) = ARN polimerasa; (T = 2) = proteína de la cápside organizada con icosaédrica T = 2 simetría; (T = 13) = proteína de la cápside icosaédrica organizada con T = 13 simetría.