Microbiología

Extremófilos

Un extremófilo (de extremo y la palabra griega φιλíα=afecto, amor, es decir "amante de -condiciones- extremas") es un microorganismoque vive en condiciones extremas, entendiéndose por tales aquellas que son muy diferentes a las que viven en la mayoría de las formas de vida en la Tierra.

Extremófilos del tipo termófilo producen algunos de los vistosos colores de la fuente termal Grand Prismatic Spring, en el Yellowstone National Park.

Hasta hace poco tiempo se pensaba que en los lugares donde crecen los extremófilos era imposible que hubiera vida. Por ejemplo, en las aguas enormemente ácidas del río Tinto; pero las hay; muchas pertenecen al dominioArchaea. Y también hay cientos de miles de virus desconocidos y por catalogar.- ..................................................:https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Especial:Libro&bookcmd=download&collection_id=c8fb7607178e125f6448fba891275d8f36530bb0&writer=rdf2latex&return_to=Extrem%C3%B3filo

Microorganismos Extremófilos

Hace algún tiempo, se pensaba que la vida sólo existía en un número muy limitado de ambientes y esto es, con las condiciones muy bien definidas.

 No obstante, este pensamiento ha sido descartado puesto que se ha encontrado vida en prácticamente todos los rincones explorados, incluso en aquellos que se consideraba no reunían las condiciones necesarias para albergar rastros de vida.

Así tenemos entonces que, estos ambientes considerados inhabitables por el hombre, son hogar de distintos microorganismos, capaces de habitar en estos nichos ecológicos y, no solos adaptarse fácilmente, sino florecer y desarrollar su metabolismo básico sin problema alguno. Es más, muchos de estos microorganismos necesitan de estas condiciones para poder subsistir.

Mediante el desarrollo del presente informe, citaremos algunos aspectos y analizaremos los aspectos de estos organismos que, por decirlo de algún modo, poseen una vida extrema.

Diferentes tipos de Extremófilos

MICROORGANISMOS EXTREMÓFILOS

En primer lugar, debemos comenzar definiendo el término: “extremófilo”

Así tenemos que, los organismos capaces de sobrevivir a condiciones extremas, fuera de las comúnmente llamadas “normales”, es decir: Temperaturas muy elevadas (44 – 121 °C) o bajas (-2 – 20°C), alta salinidad (NaCl 2-5M) y alta alcalinidad (pH arriba de 8) y/o alta acidez (pH menor de 4), son los que reciben este nombre.

Una vez ya comprendido esta definición, es importante mencionar que existen a su vez varias clases de microorganismos extremófilos. El nombre de cada clasificación estará relacionada al ambiente extremo que soportan:

Termófilos

Estos organismos tienen un crecimiento optimo en temperaturas entre los 70-80°C.

Hábitats comunes:

Fuentes termales volcánicas terrestres, termales submarinas, etc.

Termófilos

La adaptación de estos organismos es debido a la alta estabilidad térmica de sus enzimas, esta alta estabilidad se debe a las redes de interacciones iónicas y modificaciones de la membrana plasmática. En una bacteria presentan alargamiento de las cadenas de ácidos grasos, incremento de ácidos grasos saturados y presencia de ramificaciones.

Ejemplos:

-       Bacterias Thermus acuaticus: crecen a Tº mayores de 70°C

-       Sulfolobus acidocaldarius: crece a partir de 85°C

-       Pyrolobus fumarii: temp. óptima de crecimiento es de 105°C. Eucariotas

Psicrófilos

Estos organismos presentan un desarrollo óptimo a bajas temperaturas. (Desde los 20ºC hasta los -5ºC).

Las proteínas de los psicrófilos muestran disminución de interacciones iónicas y enlaces del hidrogeno, poseen menos grupos hidrofóbicos y más grupos cargados en su superficie, esto permite que las proteínas pierdan su rigidez y ganan flexibilidad en su estructura para la realización de sus funciones catalíticas.

Psychrobacter

Las membranas contienen mayor proporción de ácidos grasos no saturados, es así como su fluidez y capacidad de transporte se mantienen bajo condiciones muy frías.

Ejemplos:

- Bacterias gram negativas: Moraxella, Psychrobacter, Polaribacter, Moritella, Vibrio y Pseudomonas.

-       Bacterias gran positivas: Arthrobacter, Bacillus y Micrococcus.

-       Arqueas: Methanogenium, Methanococcoides y Halorubrum.

-       Hongos y levaduras: Penicillium, Cladosporium, Cándida y Cryptococcus

Alcalófilos

Organismos que viven en ambientes con pH por encima de 9.

Hábitat: Muy básicos como lagos sódicos y suelos muy carbonatados.

Estos organismos necesitan aislar el interior de la célula del medio alcalino exterior, ya que algunas moléculas especialmente las hechas de ARN se rompen a pH superior a 8.

Un gradiente de Na es el que suministra la energía para el transporte y la movilidad. Además, tienen en su pared celular polímeros cargado negativamente, los cuales pueden reducir la densidad de la carga en la superficie de la célula y estabilizar la membrana.

Ejemplos:

- Bacterias aeróbicas no marinas, muchas especies de Bacillus Spirulina (cianobacterias) Arqueas.

- Algunos alcalofilos son también halófilos, la mayor parte de estos pertenecen al dominio Archaea.

Halófilos

Se refiere a los organismos que habitan en medios con presencia abundante de sales.

Hábitats: Zonas litorales, salinas y lagunas salobres.

Halobacteria

Uno de los mecanismos que han desarrollado, es el albergar en el interior de sus tejidos, concentraciones de un soluto compatible a las sales (como ácido polihidroxibutírico o PHB) mayores que en el exterior. Así el agua penetra por ósmosis.

 La mayoría de estos halófilos pertenecen al dominio Archaea.

Acidófilos

Organismos que viven en medios con pH menor de 5. 

Para soportar el bajo pH, estos organismos emplean una gama de mecanismos, como una superficie de membrana cargada positivamente, una alta capacidad reguladora interna y sistemas únicos de transporte.

Acidófilos

Ejemplos:

- Ferroplasma acidarmanus, crece en ambientes de pH cercano a cero.

- Cyanidyum caldariuym, es capaz de vivir en pH cercano a cero manteniendo el interior de la célula en un nivel casi neutro.

- Acontium cylatium, Cephalosporium sp y Trichosporon cerebriae (eucariotas del reino fungí)

Conclusiones

·      Hablar de vida es abarcar un sinnúmero de organismos diversos y distintos. Millones y millones de seres que se encuentran distribuidos en diferentes partes de la tierra.

·     No todos los organismos vivientes habitan en un mismo lugar, ni dependen de las mismas condiciones físicas. Cada uno necesita de ambientes determinados para poder realizar sus funciones básicas.

·     Comprendimos que puede existir rastros de vida aún en los lugares más recónditos e inesperados. Lugares en los que cualquier otro ser (incluyendo al ser vivo) no podría sobrevivir.

·      Por último, cabe destacar un proceso fundamental en estos organismos extremófilos: La Adaptación, pues esta les permite adecuarse al ambiente, y poder desarrollarse y vivir.

La importancia de ser un extremófilo

Juan Carlos Codina Escobar.
Profesor de Educación Secundaria en el I.E.S. Los Montes de Colmenar (Málaga).

Espero que el genial Óscar Wilde sepa disculpar mi atrevimiento al plagiar como título para este artículo el de su incomparable obra, The importance of being Earnest. Pero es que la importancia de estos microorganismos está resultando tal, que semejante título venía como anillo al dedo. Los microorganismos extremófilos viven en condiciones que, consideradas desde el punto de vista humano, resultan extremas. La mayor parte de estos microorganismos pertenece al grupo de las arqueas, muy semejantes a las bacterias, pero diferentes desde el punto de vista molecular. Dentro de los extremófilos hay microorganismos que viven y se reproducen en ambientes de elevada temperatura, como las fuentes termales (organismos termófilos). Otros, por el contrario, se desarrollan en ambientes fríos, próximos al punto de congelación del agua (psicrófilos). Los hay que toleran valores extremos de pH, tanto bajos (acidófilos) como elevados (alcalófilos). Y también los hay que sobreviven en ambientes de gran salinidad (halófilos).

Pero, ¿cuál es la importancia de estos microorganismos que habitan lugares donde ningún ser humano podría vivir? La importancia de los extremófilos se basa en diversos aspectos de índole tanto básica como aplicada. De una parte, su descubrimiento y posterior estudio genético y molecular vino a confirmar la propuesta de que la vida consistía de tres líneas evolutivas principales, y no de las dos que se habían descrito de forma casi rutinaria en los libros de texto de ciencias. Estas dos líneas eran las bacterias (organismos unicelulares procariotas) y los eucariotas (organismos cuyas células presentan un núcleo verdadero). Pero un estudio comparativo de ARN ribosómico de diferentes organismos, permitió concluir en 1977 que un grupo de microorganismos, clasificados inicialmente como bacterias, pertenecían de hecho a una nueva línea, las arqueas [Madigan y Marrs. Scientific American, april number:82-87 (1997)]. La secuenciación de la primera arquea, Methanococcus jannaschii y su comparación con las bases de datos ha permitido la corroboración de tal hecho. El 44 % de sus genes se asemeja a los de las bacterias, a los de los eucariotas o a ambos, mientras que el 56 % restante son genes exclusivos de este organismo. El hecho de que M. jannaschii posea caracteres de bacterias y de eucariotas, pero al mismo tiempo presente también marcadas diferencias, permite pensar que las tres líneas tienen un ancestro común. Ya que muchas arqueas y algunas bacterias están adaptadas a condiciones de vida similares a las existentes en la Tierra en sus orígenes (especialmente elevadas temperaturas y ausencia de oxígeno), se sugiere que estos dos grupos aparecieron primero, divergiendo desde un antepasado común. Posteriormente los organismos eucariotas evolucionaron a partir de las arqueas.

El hecho de que estos microorganismos extremófilos subsistan en condiciones muy desfavorables es uno de los aspectos que ha potenciado la búsqueda de vida en otros planetas. Así, las condiciones de Marte en cuanto a temperatura, condiciones atmosféricas y otras características, son muy diferentes de las que observamos actualmente en la Tierra. Y, sin embargo, existen lugares en nuestro planeta muy diferentes de los considerados «normales» para la vida. No es de extrañar, pues, que dichos lugares se hayan convertido en laboratorios al aire libre donde investigar sobre el origen de la vida. No hay que irse muy lejos para encontrar uno de esos lugares, la cuenca del río Tinto en la provincia de Huelva, cuyas características geológicas, hidroquímicas, biológicas y botánicas lo convierten en un fecundo manantial de proyectos de investigación. Pero, ¿qué tiene este río que lo asemeja tanto al planeta vecino? El parecido está en los minerales que aparecen en ambos lugares. A pesar de que aún queda lejos el momento en el que lleguen a la Tierra muestras del planeta rojo, el pasado mes de marzo, el robot Opportunity, mediante técnicas espectroscópicas, envió a nuestro planeta indicios de la existencia de jarosita, un sulfato de hierro que para formarse necesita la presencia de aguas ácidas. Aunque este mineral ha aparecido en otros lugares de la Tierra como Chile, sólo en el río Tinto hay vida evolucionada, lo que hace pensar a los científicos que en Marte hay o ha habido vida [Recio. Andalucía Investiga, 14: 10-13 (2004)]. Hay organismos extremófilos capaces de vivir en agua con pH extremos, que esté muy caliente o muy fría, siempre y cuando aquélla se encuentre en estado líquido. Éste parece ser el requisito indispensable para la existencia de vida: la presencia de agua en estado líquido. De ahí las expectativas creadas en torno a la existencia de hielo en Marte. Si en algún momento de su larga historia ha existido agua líquida en Marte, las probabilidades de que puedan haber existido organismos vivos se ven incrementadas. Por otra parte, la existencia de organismos psicrófilos, como Polaromonas vacuolata, que viven a temperaturas cercanas al punto de congelación del agua, han llevado a los investigadores del Instituto de Astrobiología de la NASA a especular sobre la posible existencia de vida en algún momento, no sólo en Marte, sino también en Europa, una de las lunas heladas de Júpiter [Wysong. En:www.accessexcellence.com/WN/Suextremefeb04.html (2004)].

Como se ha indicado, actualmente se considera que los organismos eucariotas evolucionaron a partir de arqueas. No es pues de extrañar que su estudio esté dando resultados sorprendentes sobre la evolución. Así, recientemente se ha encontrado en un organismo extremófilo, Aeropyrum pernix, una forma primitiva de hemoglobina, denominada protoglobina, que además también presenta casi la misma estructura que la mioglobina humana, si bien no muestra una capacidad de unión al oxígeno eficaz [Wysong. En: www.accessexcellence.com/WN/SU/oxybreathjulo4.html (2004)].

Desde el punto de vista práctico, los extremófilos han supuesto una fuente potencial para multitud de aplicaciones industriales. Si tenemos en cuenta, por citar un ejemplo, que en el año 1996 las industrias biomédicas y de otro tipo gastaron más de 2 millones de euros en enzimas de uso diverso, y si consideramos que las enzimas estándar dejan de funcionar en situaciones donde sí funcionan las enzimas de los extremófilos, no es de extrañar, pues, que el uso de las denominadas extremoenzimas se haya incrementado [Madigan y Marrs. Scientific American. April number: 82-87 (1997)]. Así, la enzima Taq polimerasa, obtenida a partir de Thermus aquaticus, se emplea de forma generalizada en la técnica de PCR, una técnica utilizada de forma extensiva en investigación biológica, diagnóstico médico o investigación forense. Dicha técnica requiere de ciclos de baja y alta temperatura. Cuando Mullis diseñó esta técnica, las polimerasas utilizadas provenían de microorganismos no termófilos y dejaban de funcionar en el ciclo caliente del proceso. Ello significaba que había que reponer de forma manual las enzimas después de cada ciclo. El empleo de la Taq polimerasa vino a solucionar el problema. Recientemente, en algunos casos, laTaq polimerasa se ha reemplazado con la Pfu polimerasa. Esta enzima, aislada del hipertermófilo Pyrococcus furiosus, funciona a 100 ºC. Un uso diferente de este tipo de extremoenzimas es el de una enzima que ha incrementado la eficiencia en la producción de ciclodextrinas. Las ciclodextrinas permiten estabilizar sustancias volátiles, mejorar la toma de medicamentos y enmascarar olores no agradables de alimentos y medicinas.

Por su parte, los microorganismos psicrófilos han despertado la atención de las industrias que necesitan enzimas que operen a temperaturas propias de sistemas de refrigeración, tales como las relacionadas con el procesado de alimentos o fabricantes de perfumes y fragancias, así como productores de detergentes para lavado en frío. Las aplicaciones potenciales de las extremoenzimas de los acidófilos van desde su empleo como catalizadores para la síntesis de compuestos en solución ácida hasta su uso como aditivos para comida de animales. Estas enzimas mejoran la digestibilidad de granos de bajo coste en un ambiente ácido como es el estómago de los animales. Las enzimas de los microorganismos alcalófilos se están utilizando ampliamente para fabricar detergentes. El objetivo fundamental de un detergente es la eliminación de las manchas de comida y de otras fuentes de naturaleza grasa. Esta tarea se consigue con enzimas como las proteasas y las lipasas. Sin embargo, ambas resultan muy afectadas negativamente por el carácter básico de los detergentes. Las variantes «alcalófilas» de tales enzimas solucionan el problema. Llamativo resulta el empleo de estas enzimas en la producción de prendas vaqueras con aspecto de lavado a la piedra. Estas enzimas ablandan y decoloran los tejidos mediante la degradación de celulosa y la liberación de los tintes y colorantes.

Las extremoenzimas de los halófilos encuentran aplicación en la industria del petróleo. Se está investigando incorporar estas extremoenzimas en los procedimientos usados para incrementar la cantidad de crudo extraído de los yacimientos petroleros. Para crear canales a través de los cuales el petróleo pueda fluir al exterior, se bombea una mezcla viscosa de goma tipo guar y arena. Se fractura, mediante explosiones, la roca encajante y se fuerza a la mezcla a entrar en las nuevas grietas formadas. La goma guar facilita la dispersión de la arena en las fracturas y ésta permite el mantenimiento de la abertura de las mismas. Antes de que el petróleo pueda pasar, se debe eliminar la goma. Esto podría conseguirse incorporando en la mezcla una extremoenzima que facilitase su degradación. Teniendo en cuenta que los yacimientos de petróleo son, a menudo, lugares salinos, una extremoenzima halófila serviría para llevar a cabo tal función.

Si a todo esto le añadimos las posibilidades que supone la manipulación genética de estos microorganismos, su importancia se ve incrementada. Así, en el caso de la protoglobina aislada de A. pernix, el siguiente paso tras su descubrimiento fue la identificación de los genes responsables de su síntesis. Una vez secuenciados los genes, se ha solicitado la patente correspondiente, en anticipación a la posible obtención de un nuevo sustituto sanguíneo. No resulta, pues, sorprendente que los microorganismos extremófilos hayan adquirido ese status actual de organismos importantes.