Microbiología

Ecosistemas microbianos

Una biopelícula o biofilm es un ecosistema microbiano organizado, conformado por uno o variosmicroorganismos asociados a una superficie viva o inerte, con características funcionales y estructuras complejas. Este tipo de conformación microbiana ocurre cuando las células planctónicas se adhieren a una superficie o sustrato, formando una comunidad, que se caracteriza por la excreción de una matriz extracelular adhesiva protectora.- ..................................................:https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Especial:Libro&bookcmd=download&collection_id=568e5da262000a73cfe22b1f52d9b1673d6e7c84&writer=rdf2latex&return_to=Biopel%C3%ADcula

: Un biofilm o biopelícula es una población de microbios asociada a una superficie y embebida en una matriz de polímeros extracelulares. 

Un biofilm puede estar formado por una sola especie o por múltiples especies de hongos y bacterias. El biofilm es un estado de crecimiento natural común para muchos microorganismos, siempre que la humedad y los nutrientes disponibles sean suficientes. Aunque la definición canónica de una biopelícula incluye su asociación con una superficie sólida y la presencia de matriz extracelular, hay estructuras multicelulares similares a biopelículas que flotan en interfases líquido - aire o carecen de matriz abundante.

Los biofilms tienen un gran impacto en la salud humana. Por ejemplo , el revestimiento de la placa que crece en los dientes, la colonización crónica de las vías respiratorias de pacientes con fibrosis quística, y la capa de microorganismos que crece en superficies mucosas, como las aftas en los bebés son todas las biopelículas. Irónicamente, muchos avances en la tecnología médica han proporcionado nuevas y peligrosos nichos para la formación de biopelículas: dispositivos médicos implantados, como catéteres y válvulas cardíacas artificiales, proporcionan superficies para el crecimiento de biopelículas, sosteniendo así una reserva de microorganisos infecciosos.

La formación de biopelículas se puede ver como un proceso de desarrollo que consta de cuatro pasos comunes: fijación y agregación, producción de matriz extracelular, comportamiento coordinado y comunicación y finalmente, generación de heterogeneidad . Los mecanismos que subyacen a estos pasos son muy diferentes de unas especies a otras, pero convergen para producir resultados muy similares.

El primer paso en la formación de biopelículas es la unión inicial o la colonización de una nueva superficie de las células primera para encontrar la superficie - estas células se denominan células “pioneras”. La adhesión es seguida por proliferación celular y agregación, generando una capa basal de microcolonias de anclaje. Para las especies móviles, este proceso requiere a menudo una transición a formas no móviles asociadas a la superficie.

Una vez que un número suficiente de células han agregado para formar microcolonias, éstas comienzan a producir una matriz extracelular. A grandes rasgos, la matriz es un material extracelular mantenido dentro de un biofilm y puede derivar de la síntesis y secreción realizada por las células que componen el biofilm,  o también de la lisis de una fracción de ésas células.En el contexto de una infección producida por un biofilm, los constituyentes de la matriz pueden derivar también del organismo infectado. Así, los componentes de unamatriz pueden variar ampliamente entre biofilms, dependiendo de la especie y el medio ambiente local.La matriz puede jugar un papel en la adhesión y la protección, preservando la integridad de la arquitectura de la biopelícula y evadiendo la respuesta inmune del huésped . Para la mayoría de las biopelículas, la matriz está compuesta principalmente de polisacáridos extracelulares.

                                                                                                                                                  
Después de la colonización de la superficie, los microbios que constituyen el biofilm comienzan a comunicarse entre sí y a coordinar su comportamiento a través de un lenguaje denominado quorum sensing, o percepción de quórum. Esta comunicación se realiza mediante la secreción de moléculas de señalización que son detectadas por las otras células del biofilm. Las células responden a estas moléculas de señalización como una población, mediante cambios globales en el comportamiento y la expresión génica. Los mecanismos de percepción de quórum también pueden coordinar funciones especializadas del biofilm e incluso pueden desempeñar un papel en el intercambio de material genético.

Biopelícula

Cuando las temperaturas son elevadas, por ejemplo, en torres de enfriamiento, puede crecer muy rápidamente una matriz de diferentes microorganismos tales como bacterias, hongos, algas, produciendo la formación de una biopelícula. Estas biopelículas también conocidas como biofilms, forman la base de subsistencia para muchos gérmenes patógenos como E. coli o la legionela y los protegen de los agentes químicos y físicos. Los microorganismos que aparecen en las biopelículas son extremadamente resistentes a los desinfectantes.

Desventajas de la formación de la biopelícula:

• Incluso una pequeña capa de biopelícula en el interior de una conducción reduce el diámetro de la tubería. Esto significa que se puede bombear menos agua por el circuito, y es necesario aumentar la energía de bombeo. Esto conlleva mayor gasto en energía y una eficacia de rendimiento inferior de la torre de refrigeración.
• Una biopelícula puede estar constituida por un 85-95% de agua y funcionar como capa aislante alrededor de las rejillas y las conducciones, reduciendo por tanto la eficiencia de enfriamiento de la torre.
• Una biopelícula puede contener gran variedad de bacterias que pueden producir sustancias químicas corrosivas . Por ejemplo, bacterias anaerobias que reducen el sulfato (BSR). Estas bacterias producen ácido sulfúrico que puede ser causa de corrosión en conducciones metálicas. También, las denominadas bacterias oxidantes del hierro pueden producir corrosión lo que desencadena costosas reparaciones.
• La biopelícula puede ser huésped bacterias patógenas como Legionella o e.Coli. Estas bacterias pueden formar aerosoles e infectar a los seres humanos cuando las inhalan produciendo graves neumonías.

La biopelícula en diferentes aplicaciones

En muchos edificios y procesos, se emplea agua como fluído de enfriamiento. En los depósitos donde se almacena esta agua pueden crecer algas y biopelícula. Estos organismos ( Legionella) se diseminan por el sistema de aire acondicionado produciendo por ejemplo el ‘síndrome del edificio enfermo’ que se transmite a través del aire.

En procesos de ósmosis inversa también hay crecimiento de biopelícula. Cuando crece una capa adherente de biopelícula sobre las membranas, la eficacia de la filtración disminuye. Es necesario hacer limpiezas químicas periódicas para evitar que haya que aplicar mayores presiones con los mismos resultados.

En general, todas las instalaciones que utilizan agua están sujetas a problemas de biopelícula. Los ejemplos son máquinas para el lavado de coches, rellenado de botellas, rociadores, sistemas de lucha contra incendios, producción de hielo, etc…

Visión general de la solución LG Sonic®

LG Sonic® utiliza novedosos equipos de ultrasonidos para combatir las algas y la biopelícula en todas estas aplicaciones industriales. Cuando se activa el dispositivo LG Sonic®, los ultrasonidos atacan las algas unicelulares y verde-azuladas así como la biopelícula y algunas otras bacterias responsables de su formación. Se reducirán las algas afectadas y se suprimirá su crecimiento. La biopelícula se deteriorará lentamente, permitiendo de esta manera una fácil limpieza y mayor efecto bactericida. Las estrategias de control de Legionella deben incluir también el control de las cianobacterias, que potencian el crecimiento de Legionella en depósitos acuáticos. El LG Sonic® y sus ondas ultrasónicas se propagan por fondo y paredes sumergidas, creando una capa protectora, desfavorable para la adhesión y/o multiplicación de patógenos.

Beneficios de la solución LG Sonic®:

• Reduce y controla la cantidad de biopelícula de una manera eficaz y económica
• Reduce la necesidad de limpiar o lavar y frotar la instalación
• No perjudica el medio ambiente
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La microbiota normal, flora microbiana normal, o microbioma humano es el conjunto demicroorganismos que se localizan de manera normal en distintos sitios del cuerpo humano.¹Puede ser definida como los microorganismos que son frecuentemente encontrados en varias partes del cuerpo, en individuos sanos.² Esta microbiota normal está en relación simbióticacomensal con el hospedador, ya que también se obtienen ventajas de ellos tanto como ellos la obtienen del individuo; estos ayudan en la digestión del alimento, producen vitaminas y protegen contra la colonización de otros microorganismos que pueden ser patógenos, lo cual es llamadoantagonismo microbiano.³ En particular, el equilibrio entre las comunidades microbianas que conforman la microbiota del tracto gastrointestinal y de la vagina es de vital importancia para la salud del ser humano.⁴ Hay pocos parámetros fisiológicos e inmunológicos que no están profundamente afectados por la presencia y naturaleza de la microbiota normal del cuerpo, siendo la resistencia del huésped a las infecciones uno de los factores más prominentes.- ...........................................................................:https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Especial:Libro&bookcmd=download&collection_id=6773c91540aa358d1a561b4321649dec22ba9f9e&writer=rdf2latex&return_to=Microbiota+normal

El cuerpo humano normalmente alberga varios cientos de especies bacterianas y un número más pequeño de virus, hongos y protozoos. La mayoría de ellos son comensales, ya que viven con nosotros sin causar daño. Su número, así como la variedad de especies, cambia permanentemente. En cada momento cada uno de nosotros posee un espectro particular e individualizado de microorganismos. El término "flora" se debe a que la gran mayoría de los microorganismos aislados de nuestro cuerpo son bacterias y estas pertenecen al reino vegetal El dilema del microbiólogo clínico es decidir cuál de los microorganismos aislados de una muestra clínica son causantes de la enfermedad. Para el clínico, por otra parte, el conocimiento de los microorganismos de la flora normal es indispensable en la interpretación de los hallazgos de los exámenes microbiológicos. Flora bacteriana normal Hablamos de flora normal para referirnos a aquellos microorganismos que habitualmente encontramos sobre la superficie o en el interior del cuerpo de las personas sanas. La flora normal se adquiere con rapidez durante y poco después del nacimiento y cambia de constitución en forma permanente a lo largo de la vida. Muchos de estos microorganismos también coexisten en algunos animales o bien pueden desarrollar una vida libre.Es por lo tanto bastante difícil definir la flora normal, puesto que depende en gran parte del medio en que nos desenvolvemos. Como ejemplo podemos citar el de los astronautas de la NASA , que antes de los vuelos espaciales fueron convertidos en seres prácticamente estériles desde el punto de vista microbiológico, mediante el uso de antibióticos. Después de su regreso a la tierra se necesitaron más de seis semanas para repoblar su organismo con una flora bacteriana, la que fue exactamente idéntica a la de sus vecinos inmediatos. De manera similar, los lactantes alimentados con pecho materno tienen estreptococos y lactobacilos en su tracto gastrointestinal, mientras que los alimentados en forma artificial muestran una variedad mayor de microorganismos. Con cierta frecuencia, la zona de demarcación de lo que consideramos flora normal no es muy clara. Como un ejemplo podemos citar a los meningococos o neumococos, ambos patógenos, capaces de producir meningitis, septicemia o neumonía. Sin embargo cada uno de ellos se puede encontrar en la faringe de un 10% de personas normales y sanas; podrían incluirse dentro de la flora de estos sujetos, pero no en el otro 90% de la población. Estos microorganismos debieran considerarse como transitorios en estos individuos. Por esto, quizás sea más adecuado hablar de flora habitual. Localización de la flora Los microorganismos se encuentran en aquellas partes del cuerpo expuestas al medio ambiente o que comunican con él como piel, nariz y boca, intestino y tracto urogenital. Los órganos y tejidos internos son habitualmente estériles. Las áreas colonizadas con el mayor número de microorganismos se muestran en la Tabla 1. Tabla 1 AREAS MAS COLONIZADAS DEL ORGANISMO Ubicación Sitio anatómico específico Piel áreas húmedas: región inguinal, región axilar, espacio interdigital de los pies. Tracto respiratorio fosas nasales, faringe Tracto digestivo boca, intestino grueso Tracto genitourinario tercio anterior, uretra, vagina Las bacterias, y en menor escala los hongos y protozoos, residen y proliferan activamente en estos sitios. Las otras partes del cuerpo humano, como el resto del tracto respiratorio y del tracto digestivo, la vejiga y el útero, tienen microorganismos en menor número y sólo están de paso El hallazgo de microorganismos patógenos en estos sitios es altamente sugerente de enfermedad, pero no lo certifica. Por otra parte, existen otros tejidos y órganos en que no existen microorganismos, son territorios estériles. La presencia de microorganismos en estos lugares es generalmente considerada de significado diagnóstico. Incluidos entre éstos están la sangre, el líquido cefalorraquídeo, los líquidos articulares (sinovial) y los tejidos profundos en general. La densidad de la población bacteriana oscila de un sitio a otro como se puede apreciar en la Tabla 2. Tabla 2. NUMERO DE BACTERIAS POR SITIO ANATOMICO Y RELACION ENTRE BACTERIAS AEROBIAS Y ANAEROBIAS Sitio anatómico Número bacterias/ml Relación aerobios/anaerobios Cisura gingival 1011 - 1012 1/1.000 Estómago 102 - 105 1/1 Colon 1011 - 1012 1/1000 Piel superficie 104 - 105 1/100 Piel intrafolicular 105 - 106 1/100 Importancia de la Flora La flora habitual juega un importante papel tanto en la salud como en la enfermedad. La manifestación más fácilmente perceptible es la producción de variados olores en las superficies epiteliales del sujeto. Rol en la nutrición y metabolismo humano. Se sabe que la flora intestinal del hombre juega un papel en la nutrición y metabolismo, pero poco se sabe cuánta es la importancia de esta función. Dado que el hombre no puede llegar a ser absolutamente libre de microorganismos, los datos obtenidos son extraídos de los experimentos hechos en animales. Se sabe que algunas especies de Bacteroides y de Escherichia coli sintetizan vitamina K, lo que puede ser una importante fuente de esta vitamina tanto para el hombre como para los animales. El metabolismo de varios compuestos clave comprende la excreción desde el hígado hacia el intestino y su vuelta al hígado. Este circuito enterohepático es importante en el metabolismo de las hormonas esteroidales sexuales y de las sales biliares, sustancias que son excretadas a través de la bilis en forma conjugada con glucurónidos o sulfatos, pero no pueden ser reabsorbidas de esta manera. Algunos integrantes de la flora intestinal son capaces de desconjugar estos compuestos mediante glucuronidasas y sulfatasas. Rol de la formación de carcinógenos. Los elementos que ingerimos pueden ser modificados por la variada actividad metabólica de la flora intestinal. Algunas de las modificaciones conocidas son efectuadas por las enzimas bacterianas. Entre las reacciones conocidas podemos dar como ejemplo la modificación que introduce una sulfatasa bacteriana sobre el edulcorante ciclamato (sulfato de ciclohexamina), transformándolo en un activo carcinógeno para la vejiga, la ciclohexamina. Estimulación inmune. Nuestro abundante repertorio de inmunoglobulinas refleja, en parte, la estimulación antigénica de la flora intestinal. En general, no existen títulos muy altos de anticuerpos contra las bacterias, virus y hongos que habitan en nuestro cuerpo. Sin embargo este bajo contenido de anticuerpos es suficiente para mantener una vigilancia suficiente contra la posible invasión de los integrantes de la flora. Este es un claro beneficio que presenta la flora intestinal. Entre los anticuerpos formados se cuentan las inmunoglobulinas de la clase IgA, que son secretadas a través de las membranas mucosas. Los anticuerpos formados por el estímulo de los antígenos de la flora intestinal a veces presentan reacciones cruzadas con los antígenos normales de los propios tejidos del individuo. Un buen ejemplo de esto lo presentan los anticuerpos frente a los grupos sanguíneos ABO. Las bacterias del tracto digestivo poseen antígenos que reaccionan en forma cruzada con las sustancias propias de los grupos A y B. Los antígenos bacterianos estimulan la formación de anticuerpos, ya que son ajenos; pero no se producen anticuerpos frente a los sanguíneos porque son inmunológicamente tolerantes a los propios. Este tipo de reactividad cruzada generalmente no produce enfermedades. En otras circunstancias, como es el caso del lupus erimatoso, se forman anticuerpos contra el ADN. Se tiene claro que estos anticuerpos no se han formado contra el propio ADN, sino por estímulo antigénico de lipopolisacáridos de las bacterias de la flora intestinal. Eliminación de invasores. En algunos sitios del cuerpo, la flora habitual se encarga de mantener el nicho ecológico ocupado, impidiendo de esta manera la colonización por parte de otras bacterias.Algunas de las bacterias son capaces de producir sustancias que inhiben el desarrollo de otras que tratan de colonizar, a través de la producción de antibióticos o proteínas letales, llamadas bacteriocinas. Cuando la flora habitual es barrida por el uso masivo de antibióticos, se está dando la oportunidad de una colonización con bacterias diferentes a las habituales, o bien la chance de que los microorganismos exógenos o endógenos produzcan enfermedad. Los pacientes tratados con antibióticos de amplio espectro tienen más oportunidades de desarrollar diarrea asociada a antibióticos, incluyendo una forma más grave de patología del intestino grueso, la "colitis pseudomembranosa". El antibiótico en este caso barre la flora intestinal y deja que el Clostridium difficile, que estaba en muy baja concentración, se desarrolle, produciendo la citotoxina responsable del cuadro. Miembros de la flora habitual La flora nativa o autóctona y los micros organismos de diferentes áreas del cuerpo han sido descritos, aunque su lista está permanentemente en crecimiento.Estos mismos microorganismos también han sido aislados de lesiones, aunque muchas veces la relación causal es tenue. Los microorganismos no incluidos como patógenos ni nativos, habitualmente son ignorados totalmente, de lo que se puede concluir que estas listas no son exhaustivas;la omisión o inclusión de una especie bacteriana en cualquiera de las categorías no implica que no pueda ser aislada de otra ubicación anatómica o que no pueda causar enfermedad, complicar una enfermedad subyacente, o colonizar anormalidades anatómicas de origen congénito,trau-mático o iatrogénico. En los hospitales, especialmente, se produce una presión ejercida por los antibióticos que permite la entrada de microorganismos resistentes en la biósfera humana íntima. Las áreas por describir se dividen en dos categorías: aquellas que generalmente albergan microorganismos y aquellas que son generalmente estériles. Tracto respiratorio Areas que generalmente albergan microorganismos. Diferentes micrococos pigmentados, Staphylococcus epidermidis taphylococcus aureusPeptostreptococcus spp. son abundantes en la saliva y en la superficie de los dientes. Los Streptococcus pyogenes están presentes en un porcentaje del 5 al 10% de los sujetos sanos. Los streptococcus pneumoniae pueden encontrarse hasta en un 25% de los individuos normales. Las Neisseria spp.pigmentadas, Branhamella catarrhalis, Veillonella spp. y Corynebacterium spp. son comunes en la saliva y en las encías La familia de las enterobacterias está bien representada, siendo Escherichia coli, Klebsiella spp. y Enterobacter spp.los más comunes en la saliva y sobre la superficie de los dientes. La distribución de los microorganismos en el tracto respiratorio se puede ver en la Tabla 3. Tabla 3 MICROORGANISMOS DEL TRACTO RESPIRATORIO Microorganismo Ubicación Enfermedad Acinetobacter spp. Nasofárinx Meningitis, neumonía bacteriana Actinomyces spp. Boca, amígdalas Actinomicosis, cálculos salivales Arachnia propionica Boca Actinomicosis Bacterionema matruchotii Sup. dentaria gingival No determinada Bacteroides spp. Boca, amígdalas Absceso pulmonar grangrena pulmonar Bacteroides pneuosintes Faringe Enfermedad crónica de las meninges (rara). Bifidobacterium spp. Boca Actinomicosis. Campylobacter sputorum Nasofárinx, encías, superficie dentaria, saliva No determinada Candida albicans Boca, faringe Algorra, neumonitis Corynebacterium spp. Boca, nariz Endocarditis bacteriana subaguda, absceso pulmonar Enterobacteriaceae Boca, faringe Neumonía, absceso pulmonar Enterococcus Boca, amígdalas, nariz Bacteremia, meningitis, neumonía, endocarditis Eubacterium spp. Boca No determinada Fusobacterium spp. Boca, amígdalas Angina de Vincent?, Absceso pulmonar Haemophilus spp Boca , nasofárinx Laringotraqueobronquitis, meningitis, neumonitis, bacteremia, conjuntivitis. Lactobacillus spp. Boca, saliva Endocarditis bacteriana (muy rara) Leptotrichia buccalis Boca, sup.dentaria No determinada Micrococcus spp. Boca, amígadalas No determinada Moraxella spp. Nasofárinx Conjuntivitis Neisseria spp. Boca, nasofárinx Meningitis Peptostreptococcus spp. Boca, amígdalas Gangrena pulmonar, faringe absceso pulmonar Propionibacterium acnes Nariz Acné, endocarditis Rothia dentocariosa Boca Absceso Selenomonas sputigena Nasofárinx No determinada Staphylococcus aureus Boca, nasofárinx, nariz Neumonía, otitis absceso Staphylococcus epidermis Boca, nasofárinx, nariz Endocarditis bacteriana subaguda Streptococcus pneumoniae Boca, amígdalas, nariz Neumonía, conjuntivitis, meningitis, otitis Torulopsis glabrata Boca Infecciones tracto urinario Treponema denticola Boca No determinada Treponema refringens Boca Angina de Vincent? Veillonella spp. Boca, amígdalas Endocarditis bacteriana Vibrio sputorum Boca No determinada Streptococcus grupoviridans Boca, faringe Endocarditis bacteriana subaguda Areas generalmente estériles. La laringe, la tráquea, los bronquios, los bronquíolos, los alvéolos y los senos accesorios de la cara son habitualmente estériles. La contaminación por algún microorganismo es ocasional, pero los mecanismos de defensa se encargan de eliminarlos eficientemente. Tracto gastrointestinal Areas que generalmente albergan microorganismos. La parte del tuvo digestivo que invariablemente alberga microorganismos es el intestino grueso, aunque ocasionalmente también pueden recuperarse de íleon bajo en sujetos normales, como se muestra en la Tabla 4. Tabla 4 MICROORGANISMOS DEL TRACTO GASTROINTESTINAL Microorganismo Ubicación Enfermedad Achromobacter spp. Intestino grueso, íleon bajo Infecciones post-operatorias, post-traumáticas Acidaminococcus frementans Intestino grueso No determinada Acinetobacter calcoaceticus Intestino grueso, íleon Infecciones post-operatorias Aeromonas spp. Intestino grueso, íleon bajo Diarrea (rara), septicemia (rara), osteomielitis Alcaligenes faecalis Intestino grueso, íleon bajo Gastroenteritis (rara), bacteremia Bacillus spp. Intestino grueso Intoxicación alimentaria, infección herida Bacteroides spp. Intestino grueso, íleon bajo Peritonitis, absceso, colecistitis, enteritis Bifidobacterium spp. Intestino grueso Diverticulitis, peritonitis Butyriviberio fibrosolvens Intestino grueso No determinada Campylobacter spp. Intestino grueso Diarrea Candida albicans Intestino grueso, íleon bajo Complicaciones post-operatorias Clostridium spp. Intestino grueso, íleon bajo Intoxicación alimentaria, coledocistis, colecistitis, enterocolitis pseudomembranosa Corynebacterium spp. Intestino grueso, íleon bajo No conocida Enterobacteriaceae Intestino grueso, íleon bajo Absceso, peritonitis, bacteremia, diarrea, fiebres entéricas, fiebretifoidea complicaciones post- operatorias y post-traumáticas, meningitis, endocarditis, intoxicación alimentaria Enterococcus Intestino grueso, íleon bajo Peritonitis, colecistitis, complicaciones , post-operatorias Eubacterium spp. Intestino grueso Diverticulitis, peritonitis Flavobacterium spp. Intestino grueso, íleon bajo Meningitis, peritonitis Fusobacterium spp. Intestino grueso, íleon bajo Absceso, bacteremia Lactobacillus spp, Intestino grueso, íleon bajo No conocida Mycobacteria spp. Intestino grueso, íleon bajo No por bacterias habituales Mycoplasma spp. Intestino grueso, íleon bajo No determinada Peptostreptococcus spp. Intestino grueso, íleon bajo Colecistitis, absceso, peritonitis, mionecrosis Propionibacterium spp. Intestino grueso Endocarditis Pseudomonas aeruginosa Intestino grueso, íleon bajo Gastroenteritis, meningitis, bacteremia, complicaciones postoperatorias Ruminococcus bromii Intestino grueso No determinada Sarcina spp. Intestino grueso No determinada Staphylococcus aureus Intestino grueso, íleon bajo Absceso pancreático, enteritis, intoxicación alimentaria, complicaciones de enterocolitis, pseudomembranosa Veillonella spp. Intestino grueso No determinada Streptococcus grupoviridans Intestino grueso, íleon bajo No conocida Vibrio spp. Intestino grueso, íleon bajo No por bacterias habituales Areas generalmente estériles. Aunque el estómago y el esófago se contaminan con bacterias cada vez que se ingiere alimento, la población bacteriana no sobrevive bien en estas dos áreas . De igual manera, el intestino delgado (excepto el íleon distal),el hígado y la vesícula están libres de bacterias o sólo las albergan transitoriamente. Lo mismo ocurre con el peritoneo. La presencia de microorganismos en estos sitios se debe a enfermedades subyacentes, como carcinoma o bien alcanzan estos sitios después de una ruptura del intestino grueso. Relación bacterias aeróbicas anaeróbicas en el colon. Existe una gran variedad de especies de bacterianas en el colon y la relación entre las bacterias aerobias y anaerobias está en favor de lasanaerobias . En la Tabla 5 se muestra la frecuencia relativa de las especies bacterianas. TABLA 5 FRECUENCIA RELATIVA DE ESPECIES BACTERIANAS EN LA FLORA FECAL Rango Porcentaje Microorganismo(s) 1 12.0 Bacteroides vulgatus 2 7.0 Fusobacterium prausnitzi 3 6.5 Bacteroides adolescentia 4 6.0 Ebacterium aerofaciens 6 4.5 Bacteroides thetaiotaomicron 7 3.6 Eubacterium eligens 9 3.2 Eubacteriumbioforme 11 2.3 Bacteroides distasonis 28 0.7 Bacteroides ovatus 29 0.6 Bacteroides fragilis 59 - 75 0.13 Enterococus faecalis 76 - 113 0.06 Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae y otras 37 especies bacterianas Tracto Genitourinario Areas que generalmente albergan microorganismos. En la superficie de los genitales externos se encuentran Staphylococcus epidermidis, Streptococcus del grupo viridans, Enterococcus, Peptostreptococcus, Corynebacterium spp.,Mycobacterium spp. , varios integrantes de la familia Enterobacteriacea, Bacteroides spp., Mycoplasma spp. y Candida albicans. Estas se detallan en la Tabla 6. TABLA 6 MICROORGANISMOS DEL TRACTO GENITOURINARIO Microorganismo Ubicación Enfermedad Acinetobacter spp. Uretra anterior, vagina Uretritis, complicaciones de la instrumentación y de la cirugía Bacteroides sp. Genitales externos Complicaciones de la cirugía (mujeres) Bifidobacterium sp. Vagina No conocida Candida albicans Genitales externos, vagina, uretra anterior Candidiasis Chlamydia spp. Uretra, vagina Uretritis, cervicitis, enfermedad recién nacido, linfogranuloma venéreo Clostridium sp. Vagina Complicaciones de la cirugía, aborto Corynebacterium spp. Genitales externos,vagina, uretra anterior No determinada Enterobacteriaceae Genitales externos, vagina, uretra anterior Pielonefritis, cistitis, Bacteriuria Enterococcus Genitales externos, vagina, uretra anterior Pielonefritis, cistitis, bacteriuria Fusobacterium spp. Genitales externos, vagina No determinada Gardnerella vaginalis Uretra anterior, vagina Vaginitis Lactobacilus spp. Vagina Ninguna Moraxella spp. Vagina Complicaciones post-parto,post-operatorias y del recién nacido (raro) Mycobacterium spp. Genitales externos, vagina, uretra anterior No por bacterias habituales Mycoplasma spp. Genitales externos, vagina, uretra anterior Uretritis inespecífica? Neisseria spp. Genitales externos, vagina, uretra anterior No por bacterias habituales Peptostreptococcus spp. Genitales externos, vagina Complicaciones post-parto, post-operatorias fiebre puerperal Sarcina spp. Genitales externos, vagina Complicaciones post-parto, post-operatorias (raras) Staphylococcus aureus Genitales externos(raro), vagina, uretra anterior Uretritis, furunculosis Staphylococcus Genitales externos (raro) No claramente establecida S. saprophyticus coagulasa negativa produce infección urinaria (mujeres jóvenes) Streptococcus agalactiae Vagina Enf. del recién nacido, endocarditis, absceso, meningitis miocarditis, osteomielitis, septicemia Trichomonas vaginalis Uretra anterior, vagina Vaginitis Streptococcusgrupo viridans Genitales externos(raro), vagina, uretra anterior Ninguna Areas generalmente estériles. Como regla general, el resto de las estructuras del tracto genitourinario se encuentran estériles. Piel, Oido y Ojos Areas que generalmente albergan microorganismos. Los microorganismos que alberga la piel refleja los contactos, hábitos, profesión, etcétera, de cada uno de los individuos. Los microorganismos se encuentran en un número relativamente bajo. Entre ellos está Stapahylococcus epidermidis, que sobrepasa a Staphylococcus aureus, ocasionalmente Streptococcus pyogenes, Corynebac-terium spp., Propionibacteriumacnes, Mycobacterium spp. y una buena variedad de levaduras no -patógenas, cuyo detalle se muestra en la Tabla 7. Tabla 7 Microorganismos de la piel, oído y ojo Microorganismo Ubicación Enfermedad Acinetobacter sup. Piel Complicaciones en pacientes inmunocomprometidos Bacillus spp Piel Iridociclitis, panoftalmitis, meningitis y bacteremia pacientes inmunocomprometidos Candida albicans Piel Paroniquia (rara) Chlamydia trachomatis Incierta Tracoma, conjuntivitis por inclusión Corynebacterium spp Piel, oído, ojo Endocarditis bacteriana, complicaciones de la cirgía cardíaca Epidermophyton floccosum Piel Infecciones de piel, pie de atleta Haemophilus aegyptius Ojo Enfermedades del ojo Haemophilus influenzae Ojo Enfermedades del ojo Micrococcus spp Piel No determinada Moraxella spp Ojo Enfermedad del ojo Mycobacterium spp Piel Micobacteriosis (Piel) Neisseria spp Ojo, piel No por bacterias habituales Peptostreptococcus spp Piel No conocida Pityrosporum ovale Piel Caspa? Propionibacterium spp Piel Acné, endicarditis bacteriana Sarcina spp Piel Complicaciones pacientes inmunodeprimidos Staphylococcus aureus Piel, oído, ojo (raro) Antrax, furúnculos, impétigo, mastitis Staphylococcus epidermidis Piel, oído, ojo Acné, endocarditis, complicaciones de la cirugía cardíaca, tromboflebitis. Sangre y Líquido Cefalorraquídeo La sangre y el líquido cefalorraquídeo de los sujetos sanos son estériles. Ocasionalmente se pueden aislar bacterias de la sangre de sujetos sanos. A menudo estas bacterias representan una contaminación de bajo nivel de lesiones inaparentes o bacteremias transitorias, como las que ocurren durante la masticación, el cepillado de dientes, etcétera. Heridas y Quemaduras La flora de las heridas depende del sitio anatómico, del modo en que se produjo (traumática o quirúrgica), del ambiente donde se produjo y del grado de contaminación de las áreas adyacentes que fueron lesionadas al producirse la herida. Las heridas traumáticas generalmente se infectan con microorganismos aeróbicos nativos, especialmente Staphylococcus aureus, Streptococcus grupo A, Enterococcus Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Proteus spp. Flavobacterium spp. y Acinetobacter spp. Entre las bacterias anaeróbicas que con mayor frecuencia infectan las heridas traumáticas se encuentran los Clostridium spp., siendo los más frecuentes los clostridios de la gangrena gaseosa, tales como Clostridium perfringens tipo A, , Clostridium septicum y Clostridium novyii, aunque pueden ser simples contaminantes de las heridas, por lo que el diagnóstico de la gangrena gaseosa es estrictamente clínico, apoyado por los hallazgos de laboratorio. Las infecciones que complican las heridas quirúrgicas pueden ser producidas de dos formas. La infección quirúrgica, generalmente es una complicación de un procedimiento de cirugía limpia. Estas heridas dan cultivos positivos para Staphylococcus aureus, Enterococcus o bacilos Gram negativos. La segunda clase de infección ocurre cuando el cirujano interviene en un área contaminada. Generalmente las bacterias que complican este tipo de cirugía son Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Proteus spp, Providencia spp., el grupo Klebsiella-Enterobacter-Serratia, Flavobacterium, Acinetobacter spp.,Bacteroides spp,entre los anerobios. Muestras de Autopsia Las muestras de autopsia pueden dar información de inmenso valor, cuando son tomadas tempranamente, en forma aséptica, cuando los cultivos son sembrados de inmediato y se acompañan de frotis para tinción. Rutinariamente las muestras de riñón, bazo, hígado y pulmón son negativas, a menos que existan lesiones claramente establecidas en estos órganos. Si han transcurrido más de 6 horas entre el deceso y la toma de muestra, los cultivos tanto de sangre de órganos sólo reflejan la contaminación postmortem o perimortem producida por los microorganismos del intestino grueso. Una inmensa variedad de microorganismos, incluso algunos inesperados, pueden ser recuperados y subsecuentemente demostrarse en los cortes de tejido. Estos varían desde los más comunes, hasta otros como Brucella, Nocardia, Penicillium, Aspergillus, Streptococcus pneumoniae, Streeptococcus grupo A, Zygomycetes, Clostridium, Salmonella y Shigella, para nombrar algunos.