domingo, 5 de julio de 2015

Virus

Adenoviridae

Mastadenovirus

 

Virión

Sin envoltura cápsida con un pseudo T = 25 simetría icosaédrica  . El diámetro de la cápside es de aproximadamente 90 nm. La cáscara de la cápside consta de 720 subunidades hexón dispuestos como 240 trímeros y 12 capsómeros pentónicas vértice cada uno con una fibra que sobresale de la superficie.

GENOMA

No segmentado, lineal de doble cadena de ADN de codificación 35-36kb alrededor de 40 proteínas. El genoma tiene secuencias terminales redundantes que han invertidas repeticiones terminales (ITR). La proteína terminal (TP) se une covalentemente a cada extremo del genoma.

LA EXPRESION GENICA

La transcripción es nuclear, en tres fases; temprano, intermedio (replicación) y tarde (ensamblaje del virión). Todos los genes se transcriben por el anfitrión ARN pol II excepto gen asociado a virus (VA) (s) de algunos adenovirus de primates transcritos por ARN pol III . Los genes transcritos por ARN pol II dan lugar a ARNm múltiples que se producen por corte y empalme alternativo y el uso de diferentes sitios de poli (A).

RÉPLICA

NÚCLEO
  1. Adjunto de las fibras virales al host CAR receptor de adhesión . La posterior unión de la proteína penton de acoger la integrina receptores de entrada media la internalización en la célula huésped por endocitosis mediada por clatrina del virus de vertimiento y fibra.Algunos serotipos también parecen utilizar macropinocytosis .
  2. La alteración de la membrana endosomal anfitrión por la proteína lítica VI libera la cápside viral en el citosol.
  3. Transporte microtubular hacia núcleo del genoma viral todavía protegido por la proteína del núcleo VII y una cápside parcial compuesta principalmente de hexones y proteína IX.
  4. Docking en la APN y la interrupción de la cápside.
  5. Importación del genoma viral en el núcleo de acogida mediada por la proteína núcleo VII.
  6. La transcripción de genes tempranos (genes E) por acogida ARN pol II: estas proteínas optimizar el medio celular para la replicación viral, y contrarrestar una variedad de defensas antivirales.
  7. Genes intermedios activan la replicación del ADN del genoma de ADN de desplazamiento de cadena en el núcleo.
  8. Expresión de L4-22K y L4-33K provoca pronto para interruptor de retraso. La transcripción de genes tardíos (genes L) por acogida ARN pol II, la codificación de su mayoría proteínas estructurales.
  9. Anfitrión de cierre traducción realizada por la proteína viral 100K.
  10. Asamblea de nuevos viriones en el núcleo.
  11. Los viriones son liberados por la lisis de la célula.
  12. Virion maduración por la proteasa viral.



Mastadenovirus

 

Tipo de adenovirus humano ciclo de replicación C

adhesion receptorEntry receptorClathrin endocytosisPenetration into host nucleusMicrotubular inward transportHexonProtein IXEndosome lysis proteinCell cycle modulationE1AE1B55kPML modulationtranscriptionApoptosis modulationE4orf3E4orf6Tapasis inhibitorStrand displacement replicationNuclear capsid assemblyViral genome packagingribosomal shuntAlternative splicingHost translation shutoff100kCell lysisVirion maturationProteaseADPPOLDBPsplicing factor 33KIVa222k52KPentonE318.5kE1B19kE314.7E3RIDalphaE3RIDbetaE3CR1alphaIXiVa233K

Productos virales (adenovirus humano de tipo C serotipo 2)

TipoFunción principalNombre ProteínaLas copias por virión *InducciónFunción
Replicación
shell cápsideProteína hexon720TardeT = 25 cápside icosaédrica , microtubular hacia el interior de transporte viral
Proteína Penton60TardeT = 25 cápside icosaédrica , apego Viral para acoger receptor de entrada de host , la endocitosis del virus Clathrin mediada por el anfitrión
Proteína de la fibra36TardeApego Viral para acoger receptor de adhesión
La proteína de cápsida vértice IIIa60TardeT = 25 cápside icosaédrica , estabilización de vértice y embalaje genoma viral
Pre-proteína VI, proteína de lisis Endosoma, proteasa cofactor360TardePre-proteína VI: Andamios de icosaedro / ensamblaje de la cápside Nuclear?
lisis de proteínas Endosoma: penetración viral a través de la permeabilización de la membrana endosomal anfitrión
cofactor de proteasa: maduración del virión
Hexon-linking proteína VIII120-130TardeT = 25 cápside icosaédrica
Proteínas CoreProteasa20TardeLa maduración del virión
Core-cápside puente proteína V156-158TardePuente Core-cápside, ensamblaje de la cápside Nuclear?
-Histona como nucleoproteínaVII814-852Tarde-Histona como nucleoproteína, ADN vinculante / condensación
Core proteína X125-160TardeNucleoproteína, ADN vinculante / condensación
EmbalajeProteína Packaging 1 / IVa26-8TardeEnsamblaje de la cápsida Nuclear , embalaje genoma
Proteína Packaging 2 / 22K-TardeEnsamblaje de la cápsida Nuclear , embalaje genoma
Proteína Packaging 3 / 52K?Temprano, TardíoEnsamblaje de la cápsida Nuclear , embalaje genoma
Replicación / transcripción / traducciónProteína Terminal2IntermedioADN cebado síntesis, Strand replicación desplazamiento
ADN -la proteína de unión-IntermedioReplicación de desplazamiento de cadena , cierre anfitrión transcripción
ADN polimerasa-IntermedioReplicación desplazamiento Strand
Proteína de cierre 100K-TardeAnfitrión de cierre traducción , derivación ribosomal de ARNm tardíos, Andamios (hexones trimerización)
Empalme factor de 33K-TardeEmpalme aternative Viral , envasado genoma viral
Proteína exón U?tardedesconocido
La modulación de las funciones de acogida
Hexon desentrelazado proteína IX240IntermedioLa penetración viral en el núcleo de acogida
Early E1A 32 kDa proteína-Immediate EarlyG1 / S del ciclo celular puesto de control de host disregulación por virus , la transformación celular, inhibición de la iniciación de la transcripción de acogidainhibición de STAT1 actividad
E1B 19 kDa proteína-TempranoLa inhibición de la apoptosis de acogida por viral BCL2 -como proteínas
E1B 55 kDa proteína-TempranoLa inhibición de p53 y E1A inducida por apoptosis durante la transformación oncogénica inducida por el virus
E3 12 .5k proteínaDesconocido
E3 CR1 proteína -α-Tempranoapoptosis de modulación (la supervivencia celular) por TRAIL regulación a la baja y / o regulación de ER
E3 18 0,5 kDa glicoproteína-TempranoMHC de escape: La inhibición de Tapasin acogida por el virus
Proteína proapoptótica de adenovirus / CR1 -β-Tardelisis celular
RID E3 proteína α-TempranoLa apoptosis de modulación (la supervivencia celular) por la baja regulación de los TNF receptores de muerte -familia
RID E3 proteína β-TempranoLa apoptosis de modulación (la supervivencia celular) por la baja regulación de los TNF receptores de muerte -familia
E3 14 .7k proteína-TempranoLa inhibición de la acogida NF-kappa-B?
E4 ORF1 proteína-Temprano? Modulación apretado nudo? PDZ vinculante proteínas?
E4 ORF2 proteína-TempranoDesconocido
E4 ORF3 proteína-TempranoPML inhibición cuerpos
E4 ORF4 proteína-Temprano? Splicing alternativo?
E4 ORF6 de proteínas-TempranoInhibición de la inmunidad innata Nuclear, PML inhibición cuerpos?
E4 ORF6 proteína de control / 7-Tempranocambiar a la fase intermedia, G1 / S del ciclo celular puesto de control de host disregulación por virus
VA ARN I y II~ 10 8?Potenciar traducción de ARN virales finales (a través de la unión de la secuencia líder tripartita) la inhibición de la acogida PKR  , interfiere con la exportación nuclear de los celulares precursores RNAi y miARN y procesamiento de Dicer .
Proteína I-líder?IntermedioDesconocido









Mastadenovirus

   

Adenovirus humano de tipo C genoma





Secuencia de referencia 
disponibles secuencias de adenovirus



Cascada de la transcripción de adenovirus

Inmediata Temprana:

E1A se transcribe a partir del E1A promotor temprano inmediato tan pronto como el genoma viral entra en el núcleo de la célula. El ciclo de la célula huésped se empuja en la fase S. temprano inmediato al interruptor de principios: E1A activa los promotores tempranos






Temprano:

La expresión inicial de E1A ofrece activadores de la transcripción que, con proteínas del huésped, se convierten en la expresión de los primeros promotores E1B , E2E (E2 temprano), E3, y E4 . Las proteínas tempranas optimizar el medio celular para la replicación viral, y contrarrestan una variedad de defensas antivirales. El promotor tardío principal (MLP) es débilmente activos durante esta fase con una transcripción hasta L1 (que produce principalmente la proteína i-líder y L1-52 / 55K proteínas).transcripción eficiente de los E2E resultados promotor en la acumulación de la E2A ADN proteína de unión (DBP), E2B proteína precursora del terminal, y ADN polimerasa, que sentó las bases para viralADN replicación empezar. A principios de interruptor intermedia: la acumulación de la piscina de los genomas virales activa los promotores IVA2 y IX








Intermedio temprano:

La activación de la transcripción de pIX, IVa2, y E2 finales de los promotores . La transcripción de la región E4 declina probablemente debido a la represión por el ADN -la proteína de unión. Early interruptor a finales de : proteínas de pIX y IVa2 upregulate la actividad transcripcional del promotor tardío principal (MLP) . Expresión de L4-22K del promotor L4 activa la expresión máxima de la MLP . L4-22K y L4-33K regulan el patrón de empalme de las transcripciones finales .



 

Retraso:

El MLP está totalmente activa y produce transcripciones de L1 a L5 para permite la síntesis deproteínas estructurales . 100K proteína induce traducción anfitrión de cierre, transcripciones virales tardías están traduciendo de manera eficiente a través de la derivación ribosomal. La proteína de la muerte de adenovirus (ADP) codificada por región E3 se expresa temprana pero es amplificada en gran medida en las etapas tardías de la infección. UXP también se expresa abundantemente durante las últimas etapas de la infección.







Eventos de splicing

Excepto para el polipéptido IX mRNA, todos los transcritos primarios se someten a uno o más eventos de empalme que dan lugar a unos cincuenta mRNAs distintas durante la infección lítica.




Variación de la región E3 entre las especies AdV humanos

Desde: Robinson et al. "La evolución molecular de adenovirus especies D humanos." Infect Genet Evol. 11: 1208-1217 (2011).



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