Clasificación de virus

Virus a ADN

Corticoviridae es una familia de virus infectivos para bacterias (bacteriófagos). Se caracterizan por poseer un genoma con ADN de cadena doble como ácido nucleico, por lo que pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. El [[genoma[[ no es segmentado, constituye el 13% del peso del virus y contiene una sola molécula de ADN circular, superenrollada, de 9500-12000 nucleótidos de longitud y con un contenido GCdel 43%.¹

Albergan dicha información genética en una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría compleja, con aspecto esférico o subesférico y rica en lípidos.² La cápside icosahedral tiene un diámetro de 60 nm y presenta una membrana lipídica interna situada entre las cubiertas de proteínas exterior e interior.³ Las cubiertas se componen de tres capas, con superficies que revelan un patrón con características distintivas,⁴ incluyendo protuberancias de tipo espiga en los doce vértices.

Icosahedral T=21 capsid 56 nm in diameter, composed of 1200 P1 (spike) and 60 P2 (capsid) proteins. The pentameric receptor-binding spikes are protruding from the 12 fivefold axes. The capsid encloses an internal lipid core containing the structural proteins P3 to P9.

GENOME

Circular, supercoiled dsDNA genome of about 10 kb encoding for 21 proteins. Displays a very high number of negative supercoils.

GENE EXPRESSION

The genome is organized in three operons.

REPLICATION

CYTOPLASMIC

1. Adsorption: the phage attach to target cell
2. Injection: viral DNA is injected in host cell cytoplasm
3. Transcription and translation of early genes
4. Replication of genomic DNA via a rolling-circle mechanism
5. Transcription and translation of late genes
6. Capsid proteins polymerize around a lipoprotein vesicle translocated in the cytoplasm by virion assembly factors.
7. Genomic DNA is packaged in new virions
8. Mature virions are released from the cell by lysis

Fuselloviridae es una familia de virus que comprende un sólo género, Fusellovirus, que infecta a la arquea Sulfolobus. Tiene un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenece al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. La especie tipo es Sulfolobus virus 1 (sinónimo: Sulfolobus shibatae bacteriophage SSV1, acrónimo: SSV-1.)

Análisis genómico comparativo de los virus Fuselloviridae arqueas hipertermofílicos.

Las secuencias del genoma completo de dos virus en forma de huso Sulfolobus (SSV) de aguas termales ácidas en Kamchatka (Rusia) y el Parque Nacional de Yellowstone (Estados Unidos) se han determinado. Estos virus templados nonlytic se aislaron a partir de huéspedes Sulfolobus hipertermofílicos, y ambos virus comparten la característica morfología en forma de huso de la familia Fuselloviridae. Estos dos genomas, en combinación con el genoma SSV1 previamente determinada de Japón y el genoma SSV2 de Islandia, nos han permitido llevar a cabo una comparación filogenética de estos virus hipertermales distribuidos geográficamente. Cada virus contiene un genoma de ADN de doble cadena circular de aproximadamente 15 kpb con aproximadamente 34 marcos de lectura abierta (ORFs). Estos fuselloviridae ORFs muestran poca o ninguna similitud con genes en las bases de datos públicas. En contraste, 18 ORFs son comunes a todos los cuatro aislados y pueden representar el mínimo conjunto de genes que define este grupo viral. En general, los ORFs en una media del genoma son colineales y muy conservadas, mientras que ORFs en la otra mitad no lo son. Una compartían ORF entre los cuatro genomas es una integrasa de la familia tirosina recombinasa.Todos los cuatro genomas virales se integran en sus anfitrionas genes de ARNt. El gen de tRNA específico utilizado para la integración varía, y un genoma se integra en múltiples loci. Varios ORFs únicos se encuentran en el genoma de cada aislado.