domingo, 20 de marzo de 2016

Clasificación de virus

Virus a ADN


Papovaviridae es una familia de virus pequeños (apróx. 50 nm) infectivos para una gran variedad de animales, incluyendo los humanos. Su nombre implica las patología que causa: papilomavirus + poliomavirus + agentevacuolante. Tienen una amplia distribución mundial.


Características

Se caracterizan por poseer un genoma con DNA de cadena doble como ácido nucleico de unos 8000 pares de bases; albergar dicha información genética en una cápside de 72 capsómetros1 y carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría icosaédrica, de un tamaño de 45 a 55 nm; y por ensamblar los viriones maduros en el núcleo como compartimento celular.

Patología

Son conocidos por su capacidad de evadir el sistema inmune, en particular por acceso a tejidos privilegiados donde la inmunidad no es muy fuerte. Ese trofismo evolutivo les ha dado la habilidad de permanecer viables en el hospedador de por vida, en la mayoría de los casos. Los Papovaviridae son virus altamente cancerígenos, causando lesiones hiperplásicas y proliferativas, tanto malignas como benignas,2 en variados tejidos.

Clasificación

A pesar de que todos los virus de esta familia son estructuralmente similares, se replican de forma diferente y tienen actividades patógenas muy distintas; por ello, actualmente se divide a estos virus en dos familias diferentes,3 cada una con un género representativo. Estas familias son;

Género Virus del Papiloma:
Virus del papiloma humano
El VPH es actualmente la más importante papovavirus. Setenta cepas del virus del papiloma humano se han identificado hasta el momento. Estos virus son conocidas por su papel en la causa verrugas (tanto las verrugas comunes y verrugas genitales), así como su asociación con el cáncer. La mayoría de personas están infectadas con alguna cepa de VPH en su vida.
Toda la verdad sobre el VPH
género poliomavirus
Virus JC
Este virus, que sólo se encuentra en los seres humanos, y se extendió por toda la población humana. La infección rara vez resulta en diseas, excepto en el caso de la inmunosuprimidos. Virus JC lleva a leucoencefalopatía multifocal progresiva , una de las principales causas de muerte para las personas con VIH y las infecciones de las vías urinarias persistentes. JC son las iniciales del primer paciente con la enfermedad. La mayoría de la gente está subclínica infectadas con el virus en la infancia.
Virus BK
BK virus fue aislado en 1971 en un paciente con trasplante renal. Es, también, se encuentra a menudo en el tracto urinario de los individuos inmunodeprimidos, pero el virus BK no está asociado con la leucoencefalopatía multifocal progresiva (LMP). La infección tiende a ocurrir temprano en la vida. Ambos virus BK y JC virus están relacionados con el cáncer.


Estos virus de ADN pequeños, de doble cadena tienen muchas propiedades únicas. Por ejemplo, el ADN es el ADN circular covalentemente cerrado solamente.
Morfología: El virión es de forma esférica, desnuda y contiene simetría icosaédrica (T = 7). El es el único virión icosohedrally simétrica que contiene la simetría asimétrica.
Replicación: replicación ocurre en el núcleo (en el que el virus utiliza la polimerasa host). Los viriones se liberan de la célula por lisis.
¿Cuál es la etimología?
La familia papovavirus fue nombrado por sus distinguidas tres virus:
Virus del papiloma humano
virus de polioma Rabbit
Agentes vacuolating Simian
¿Cuáles son las subclases?
Poliomavirus y virus del papiloma son los dos géneros de papovavirida. La siguiente tabla resume las similitudes y diferencias:

poliomavirus

el virus del papiloma
genoma
  • doble cadena
  • circular
  • ADN
  • ~ 5kbp
  • Usos superposición de genes y ambas hebras de ADN para empacar los 6 genes en un espacio pequeño
  • Códigos de 5000 nucleótidos
  • doble cadena
  • ADN circular
  • ~ 8kbp
  • Utiliza la superposición de genes y una hebra de ADN para empacar al menos 12 genes en 8kbp
  • Códigos de 8000 nucleótidos
Morfología
  • Noneveloped
  • ~ 45 nm de diámetro
  • icosaédrica, inclinación, T = 7
  • 3 proteínas de la cápside
  • sin envoltura
  • ~ Diámetro 52-55nm
  • icosaédrica, inclinación, T = 7
  • 2 proteínas de la cápside
otras diferencias
  • Antígenos específicos subfamilia
  • El virus del papiloma no se puede crecer en un cultivo, mientras que los poliomavirus a menudo se cultivan en cultivo
PatogenesiaLa mayoría son asintomáticos, aunque puede ser oncogénico en hámstersCausar varios tipos de verrugas, verruciforme epidermodysplasia
Los virus representativosVirus JC
  • Asociado a leucoencefalopatía multifocal progresiva, que se encuentra principalmente en los ancianos e inmunodeprimidos
Virus BK
  • Los resultados en la enfermedad respiratoria leve en los niños
  • Encontrado en algunos tumores
Virus Simian 40
Un virus animal completamente secuenciado utilizado con frecuencia como un vector de clonación.
Al menos 62 cepas de virus del papiloma humano
  • Extendido
  • Causar crecimientos o verrugas
  • Muchos están asociados con el cáncer


¿Cuáles son las propiedades del genoma?
Las características genómicas de Papoviridae ejemplifican la belleza y la creatividad de la naturaleza. El genoma circular utiliza genes anidados, la superposición de genes y empalme diferencial para exprimir la mayor cantidad de material genético en el mínimo espacio.
Existen dos clases cinéticos, el código de finales de los genes tempranos genes.The (E1-E8) cuanto antes y de la proteína que se necesita en el funcionamiento temprano (por ejemplo, para la replicación). THET antígeno dirige el anfitrión de la polimerasa para el genoma viral. El código de los genes tardíos (L1-2) para los mayores y menores protiens cápside. En el virus del papiloma, los genes E están codificados en Watson y los genes L se codifican en Crick.
Virus del papiloma humano codifica siete proteínas tempranas y dos proteínas tardías. La función de estas proteínas son los siguientes:
E1: la replicación viral 
E2: La replicación viral y la transcripción 
E4: destabliliation de red citoqueratina 
E5: la mediación de señales mitogénicas de los factores de crecimiento 
E6: la transformación celular 
E7: la transformación celular 
L1: principal proteína de la cubierta viral 
L2: menor Proten cubierta viral

HP16 Genoma



La imagen de arriba, que organiza el genoma (normalmente circular) de una manera lineal, demuestra las similitudes de SV40 y HP16. Como se puede ver, los genes en HP16 están en tres marcos de lectura diferentes. Varios de los genes se anidan y se superponen. 
Para obtener más información, echa un vistazo a la base de datos de secuencias de VPH .
SV40
Aquí está una foto del virus de simio 40. Este fue el primer virus que se secuenció completamente. Aunque el genoma de este poliomavirus no es exactamente el mismo que el virus del papiloma, podemos aprender mucho de sus métodos de transcripción.

Propiedades de que este virus ilustra:
Corte y empalme diferencial: El antígeno T grande es el producto de dos genes que han sido empalmados juntos.
Los genes que se superponen: Estos genes tienen secuencias que se solapan. Ejemplos son VP2 y VP3, VP3 y VP1 y VP2 y VP3.
Los genes anidados: Estos genes tienen secuencias superpuestas, pero no comparten el mismo inicio o codón de parada. VP1 y VP2 se anidan genes. genes anidados también deben tener diferentes marcos de lectura. Else, la transcripción de VP1 se intreruppted en la región de codón STOP de VP2 y VP1.
Como se puede ver, este virus codifica en ambos los hilos Watson y Crick del ADN.








Los virus del familia Papillomaviridae, entre los que se incluyen entre otros los virus del papiloma humano (o «HPV» por sus iniciales en inglés: human papilloma virus), son un grupo diverso de virus ADN que infectan la piel y membranas mucosas de humanos y de variedad de animales. Miembros de la familia Papillomaviridae según otros autores),1 su especie tipo es el virus del papiloma del conejo de cola de algodón (o CRPV, del ingléscottontail rabbit papillomavirus)2 Todos sus representantes afectan a vertebrados.
La naturaleza de su genoma los hace clasificarse en la clase I de Baltimore. Es decir, se trata de virus cuyo material genético es ADN de doble cadena, replicado por la maquinaria celular en ausencia de retrotranscriptasas. De hecho, su replicación depende incluso del tipo celular, que sólo ocurre en queratinocitos diferenciados de la piel u otrasmucosas,3 si bien producen varias clases de reguladoras trans para facilitar la consecución de su ciclo vital. Carecen de envoltura viral.




Polyomaviridae es una familia de virus que contiene un único género, Polyomavirus, que infecta animales. Los poliomavirus tienen un genoma ADN de cadena doble y por lo tanto se incluyen en el Grupo I de la Clasificación de Baltimore. El genoma es circular, de 5000 pares de bases. Los virus tienen un tamaño pequeño, 40-50 nm de diámetro, forma icosaédrica y carecen de envoltura de lipoproteína.1 Son potencialmente oncogénicos (causantes de tumores); frecuentemente persisten como infecciones latentes en un hospedante sin causar enfermedad, pero pueden producir tumores en un huésped de especie diferente, o en un huésped con un ineficiente sistema inmunitario. El nombre polioma refiere a la habilidad del virus de producir múltiples (poli) tumores (oma).
Se conocen cinco especies de poliomavirus que infectan humanos:
  • Poliomavirus BK, que puede infectar el sistema respiratorio, riñones y cerebro, puede producir cistitis hemorrágica o una nefropatía
  • Poliomavirus JC, a veces mortal al causar leucoencefalopatía multifocal progresiva.
Ambos virus están muy extendidos: el 80 por ciento de la población adulta en los Estados Unidos tienen anticuerpos frente a BK y JC.
  • Dos virus recientemente descubiertos, Poliomavirus KI (Instituto Karolinska)2 y Poliomavirus WU(Universidad de Washington)3 están estrechamente relacionados entre sí y han sido aislados de las secreciones respiratorias.
  • En enero de 2008 se describió una nueva especie, Poliomavirus de células de Merkel como el probable agente causal de cáncer de piel de Merkel.4
El Virus vacuolante del simio 40 se replica en los riñones de monos sin causar enfermedad, pero causa sarcomasen hámsters. Se desconoce si puede causar enfermedades en los seres humanos, lo que ha causado preocupaciones, ya que el virus puede haber sido introducido en la población general en la década de 1950 a través de una vacuna contra la polio contaminada. Una hipótesis similar postula que esta vacuna pudo haber sido la causa de la transmisión del virus del sida de los chimpancés a los humanos. El Virus de la enfermedad del polluelo del periquito es una causa frecuente de muerte entre las aves enjauladas.
El género Poliomavirus solía ser uno de los dos géneros dentro de la familia ahora obsoleta Papovaviridae (el otro género, el virus del papiloma, ahora se clasifica en su propia familia, Papillomaviridae).

Replicación

Antes de la replicación del genoma tienen lugar los procesos de fijación, entrada y liberación de la cubierta. Actualmente se desconocen los receptores celulares para los poliomavirus, sin embargo, la fijación del poliomavirus a la célula huésped es mediada por la proteína viral 1 (VP1). Esto se ha demostrado al comprobarse que los anticuerpos anti-VP1 previenen la unión del poliomavirus a la célula huésped.5
A continuación los viriones son endocitados y posteriormente transportados directamente al núcleo en vacuolas endocíticas en donde se produce la liberación de la cubierta del virus.
Los poliomavirus se replican en el núcleo de la célula huésped. Son capaces de utilizar la maquinaria genómica del huésped puesto que su estructura genómica es homóloga a la del huésped mamífero. La replicación viral se produce en dos fases distintas: expresión de genes inicial y final, separadas por la replicación del genoma.
La expresión de genes inicial es la responsable de la síntesis de proteínas no estructurales. Puesto que los poliomavirus confían en el huésped para el control de la expresión génica, la función de las proteínas no estructurales es la de regular los mecanismos celulares. Cerca del terminal N del genoma del poliomavirus hay elementos potenciadores que inducen la activación y transcripción de una molécula conocida como el antígeno T. El ARNm inicial codifica antígenos T que son producidos por la ARN polimerasa II del huésped. El antígeno T autorregula el ARNm inicial, que posteriormente conduce a niveles elevados del antígeno T. A altas concentraciones del antígeno T, la expresión génica inicial es reprimida, dando lugar al comienzo de la fase final de la infección viral.
La replicación genómica separa las fases inicial y final de la expresión génica. El genoma viral duplicado es sintetizado y procesado como si se tratara de ADN celular, explotando la maquinaria del huésped. Puesto que el ADN viral sintetizado se asocia con nucleosomas celulares para formar estructuras, a menudo son denominados "minicromosomas". De esta forma, el ADN es empaquetado de la manera más eficiente.
La expresión de genes final sintetiza las proteínas estructurales, responsables de la composición de las partículas virales. Esto ocurre durante y después de la replicación del genoma. Al igual que con los primeros productos de la expresión génica, la expresión génica final genera una serie de proteínas como resultado de una organización alternativa.
Dentro de cada proteína viral hay "señales de localización nuclear", que causa que las proteínas se acumulen en el núcleo. El ensamblado de las nuevas partículas virales, en consecuencia, produce en el núcleo de la célula huésped.
La liberación de las partículas de poliomavirus nuevamente sintetizadas de la célula infectada se realiza por uno de dos mecanismos. La primera y la menos frecuente es el transporte en vacuolas citoplasmáticas a la membrana plasmática, donde se produce la gemación. Con más frecuencia se liberan cuando la célula se lisa debido a la citotoxicidad de las partículas de virus presentes en la célula infectada. 

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