El miembro 4 de la subfamilia D de cassette de unión a ATP es una proteína que en humanos está codificada por el gen ABCD4 . [4] [5] [6]
La proteína codificada por este gen es un miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC) . Las proteínas ABC transportan diversas moléculas a través de membranas extra e intracelulares. Los genes ABC se dividen en siete subfamilias distintas (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Esta proteína es miembro de la subfamilia ALD, que participa en la importación peroxisomal de ácidos grasos y / o acil-CoAs grasos.En el orgánulo. Todos los transportadores ABC peroxisomales conocidos son medios transportadores que requieren una molécula media transportadora asociada para formar un transportador homodimérico o heterodimérico funcional. Se desconoce la función de esta proteína de membrana peroxisomal. Sin embargo, se especula que puede funcionar como un heterodímero para otro transportador ABC peroxisómico y, por lo tanto, puede modificar el fenotipo de la adrenoleucodistrofia. También puede desempeñar un papel en el proceso de biogénesis de peroxisomas. El empalme alternativo da como resultado al menos dos variantes de transcripción diferentes, una que codifica proteínas y otra que probablemente no codifica proteínas.
| ABCD4 | |||||||||||||||
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| Identificadores | |||||||||||||||
| Alias | ABCD4 , ABC41, EST352188, MAHCJ, P70R, P79R, PMP69, PXMP1L, miembro de la subfamilia D del cassette de unión a ATP 4 | ||||||||||||||
| ID externos | OMIM: 603214 MGI: 1349217 HomoloGene: 3703 GeneCards: ABCD4 | ||||||||||||||
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| Ortólogos | |||||||||||||||
| Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||
| RefSeq (ARNm) | |||||||||||||||
| RefSeq (proteína) |
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| Ubicación (UCSC) | n / A | Capítulo 12: 84.6 - 84.62 Mb | |||||||||||||
El miembro 1 de la subfamilia E de cassette de unión a ATP (ABCE1) también conocido como inhibidor de RNasa L (RLI) es una enzima que en los humanos está codificada por el gen ABCE1 .
ABCE1 es una ATPasa que es miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC) y la subfamilia OABP . [5]
ABCE1 inhibe la acción de la ribonucleasa L . La ribonucleasa L normalmente se une a 2-5A (5'-fosforilados 2 ', 5'-ligados a oligoadenilatos) e inhibe la vía 2-5A / RNasa L regulada por interferón, que es utilizada por los virus. ABCE1 se heterodimeriza con ribonucleasa L y evita su interacción con 2-5A, antagonizando las propiedades antivirales de la ribonucleasa L [6] y permite que el virus sintetice proteínas virales. También se ha implicado que tiene un efecto en la proliferación de células tumorales y la antiapoptosis . [7]
ABCE1 es una proteína esencial y altamente conservada que se requiere tanto para el inicio de la traducción eucariota como para la biogénesis de los ribosomas . Los homólogos más estudiados son Rli1p en levadura y Pixie en Drosophila .
| ABCE1 | |||||||||||||||||||||||||
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| Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
| Alias | ABCE1 , ABC38, OABP, RLI, RNASEL1, RNASELI, RNS4I, miembro 1 de la subfamilia E del casete de unión a ATP, RLI1 | ||||||||||||||||||||||||
| ID externos | OMIM: 601213 MGI: 1195458 HomoloGene: 2205 GeneCards: ABCE1 | ||||||||||||||||||||||||
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| Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
| Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (ARNm) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (proteína) | |||||||||||||||||||||||||
| Ubicación (UCSC) | Capítulo 4: 145.1 - 145.13 Mb | Chr 8: 79.68 - 79.71 Mb | |||||||||||||||||||||||
Estructura [ editar ]
El RLI es una proteína citoplasmática de 68 kDa que se encuentra en la mayoría de las eucariotas y arqueas . Dado que la estructura cristalina para RLI aún no se ha determinado, todo lo que se sabe se ha inferido de la secuenciación de proteínas. Las secuencias de proteínas entre especies están muy bien conservadas, por ejemplo, Pixie y Rli1p de levadura son 66% idénticos, y Rli1p y RLI humano son 67% idénticos.
RLI pertenece a la familia ABCE de proteínas de casete de unión a ATP (ABC). Las proteínas ABC generalmente también contienen una región transmembrana y utilizan ATP para transportar sustratos a través de una membrana, sin embargo, RLI es único en el sentido de que es una proteína soluble que contiene dominios ABC. RLI tiene dos dominios ABC C-terminales; Al unirse al ATP, forman un "sándwich de ATP" característico, con dos moléculas de ATP intercaladas entre los dos dominios ABC dimerizados. La hidrólisis de ATP permite que el dímero se disocie en un proceso totalmente reversible. La incubación de la proteína con un análogo de ATP no hidrolizable o una mutación del dominio ABC provoca una pérdida completa de la función de la proteína.
RLI también tiene una región N-terminal rica en cisteína que se predice que se unirá estrechamente a dos grupos [4Fe-4S]. La mutación de esta región, o el agotamiento de los grupos de Fe / S disponibles , hace que la proteína no pueda funcionar y la pérdida de la viabilidad celular, lo que convierte a RLI en la única proteína citoplasmática esencial conocida que depende de la biosíntesis de grupos de Fe / S en las mitocondrias . Se desconoce la función de los grupos Fe / S, aunque se ha sugerido que regulan los dominios ABC en respuesta a un cambio en el entorno redox, por ejemplo, en presencia de especies reactivas de oxígeno. [8]
Función [ editar ]
RLI y sus homólogos en levadura y Drosophila tienen dos funciones principales identificadas: iniciación de la traducción y biogénesis de ribosomas. Además, el RLI humano es un inhibidor conocido de RNAse L. Esta fue la primera actividad identificada y la fuente de su nombre ( inhibidor de R NAse L I ).
Iniciación a la traducción [ editar ]
El inicio de la traducción es un proceso esencial requerido para la expresión adecuada de proteínas y la viabilidad celular. Se ha encontrado que Rli1p co-purifica con factores de iniciación eucariotas, específicamente eIF2, eIF5 y eIF3, así como la subunidad 40S del ribosoma. Estos factores de iniciación deben asociarse con el ribosoma en proporciones estequiométricas, mientras que Rli1p se requiere en cantidades catalíticas. Se ha propuesto el siguiente mecanismo para el proceso: un dominio ABC se une a la subunidad 40S, mientras que el otro se une a un factor de iniciación. La unión de ATP permite la dimerización, que posteriormente lleva el factor de iniciación y la subunidad ribosómica en contacto lo suficientemente cercano como para asociarse. La hidrólisis de ATP libera los dos sustratos y permite que el ciclo comience nuevamente. Este modelo es similar al que se ha propuesto para las enzimas de reparación de ADN con dominios ABC, en el que cada dominio se une a cada lado de una pieza rota de ADN, con la hidrólisis que permite unir las piezas y repararlas posteriormente.[9]
Biogénesis de ribosomas [ editar ]
También se cree que RLI y sus homólogos juegan un papel en la biogénesis de ribosomas , la exportación nuclear o ambas. Se han encontrado en el núcleo asociado con las subunidades 40S y 60S, así como Hcr1p, una proteína requerida para el procesamiento de rRNA . Se ha demostrado que los grupos de Fe / S son necesarios para la biogénesis de los ribosomas y / o la exportación nuclear, aunque se desconoce el mecanismo exacto.
Inhibidor de ARNasa [ editar ]
El RLI humano se identificó por primera vez debido a su capacidad para inhibir la ARNasa L, que desempeña un papel crucial en la actividad antiviral en mamíferos. Esto no puede explicar la conservación de la proteína en todos los demás organismos, ya que solo los mamíferos tienen el sistema RNAse L. Se ha sugerido que el RLI en las funciones eucariotas inferiores inhibe las ARNas implicadas en la biosíntesis ribosómica, regulando así el proceso. [10]
Papel en las mitocondrias [ editar ]
Se ha establecido que las funciones energéticas y metabólicas de las mitocondrias no son esenciales para la viabilidad de las células de levadura. La única función que se ha implicado en ser necesaria para la supervivencia es la biosíntesis de los grupos de Fe / S. RLI es la única proteína citoplásmica esencial Fe / S conocida que es absolutamente dependiente de la síntesis mitocondrial de Fe / S y del sistema de exportación para una maduración adecuada. Rli1p es, por lo tanto, un nuevo vínculo entre las mitocondrias y la función ribosómica y la biosíntesis, y por lo tanto la viabilidad de la célula.
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