sábado, 21 de diciembre de 2019

LISTA DE GENES CODIFICADORES


El miembro 11 de la subfamilia C transportadora de casetes de unión a ATP es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ABCC11 [3] [4] [5]
El gen es responsable de la determinación del tipo de cerumen humano (cera del oído húmedo o seco) y de la presencia de osmidrosis de las axilas (olor asociado con el sudor causado por la secreción apocrina excesiva ).

ABCC11
Identificadores
AliasABCC11 , cassette de unión a ATP, subfamilia C (CFTR / MRP), miembro 11, EWWD, MRP8, WW, subfamilia C de cassette de unión a ATP 11, miembro de subfamilia C transportador de cassette de unión a ATP 1
ID externosOMIM: 607040 HomoloGene: 69511 GeneCards: ABCC11
ocultar laubicación del gen (humano)
Cromosoma 16 (humano)
Chr.Cromosoma 16 (humano) [1]
Cromosoma 16 (humano)
Ubicación genómica para ABCC11
Ubicación genómica para ABCC11
Banda16q12.1comienzo48,166,910 pb [1]
Fin48,247,568 pb [1]
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (ARNm)
n / A
RefSeq (proteína)
n / A
Ubicación (UCSC)Capítulo 16: 48.17 - 48.25 Mb



Función editar ]

La proteína codificada por este gen es un miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC). Las proteínas ABC transportan diversas moléculas a través de membranas extra e intracelulares. Los genes ABC se dividen en siete subfamilias distintas (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Este transportador completo ABC es miembro de la subfamilia MRP que participa en la resistencia a múltiples fármacos. El producto de este gen participa en procesos fisiológicos que involucran ácidos biliares, esteroides conjugados y nucleótidos cíclicos. Además, un SNP en este gen es responsable de la determinación de la cera del oído humano.tipo y presencia de olor en las axilas. Se determina que este gen y el miembro de la familia ABCC12 se derivan por duplicación y ambos se localizan en el cromosoma 16q12.1. Se han descrito múltiples variantes de transcripción empalmadas alternativamente para este gen. [5]

Genética molecular editar ]

El gen ABCC11 está presente en el genoma humano como dos alelos , que difieren en un nucleótido también conocido como polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) . [6] Un SNP en el gen ABCC11 en el cromosoma 16 en la posición base 538 de controles de guanina o adenina para múltiples fenotipos distintos [6] [7] Estos codifican respectivamente glicina y arginina en el producto proteico del gen Herencia dominantedel genotipo GG o GA se observa mientras que el genotipo AA es recesivo. Los fenotipos expresados ​​por los genotipos incluyen el tipo de cerumen (cera del oído húmedo o seco), la osmidrosis (olor asociado con el sudor causado por la secreción apocrina excesiva ) y el riesgo de cáncer de mama , aunque hay un debate en curso sobre si existe una correlación real de fenotipo de cera de oído húmedo para la susceptibilidad al cáncer de mama. [8] [9] El genotipo GG o GA produce el fenotipo de cera húmeda del oído (pegajoso y de color marrón) y olor a sudor acre y es el alelo dominante. [8] Tenga en cuenta que este fenotipo requiere solo la presencia de una guanina. losEl genotipo AA homocigoto recesivo produce el fenotipo de cera del oído seco (seco y escamoso) y sudor ligeramente oloroso. [8]
Los alelos que contienen una guanina producen una proteína que está glicosilada, pero los alelos que contienen una adenina no están glicosilados. La proteína resultante solo es parcialmente degradada por los proteasomas . [6] Este efecto se localiza en las membranas de las glándulas ceruminosas . [6] Debido a que el producto de la proteína alelo que contiene adenina se degrada solo parcialmente, la proteína funcional restante se encuentra en la membrana de la superficie celular, lo que el papel del gen ABCC11 en el olor a sudor probablemente se deba en parte a la dosis cuantitativa de la proteína ABCC11. [6]
Desde una perspectiva evolutiva , se desconocen las implicaciones del tipo de cerumen en la aptitud física , aunque se ha postulado que el sudor inodoro en las antiguas poblaciones del norte de Eurasia tiene una ventaja adaptativa para el clima frío. [7] En algunos mamíferos no humanos las señales de apareamiento mediante la liberación de un olor potenciado por una mayor secreción apocrina pueden ser un factor en la selección sexual . [7]
Los rasgos humanos físicos que están controlados por un solo gen son poco comunes . La mayoría de las características humanas son controlados por múltiples genes ( poligenes ) aunque ABCC11 es un ejemplo particular de un gen con fenotipos inequívocas que está controlado por un SNP. Además, se considera un gen pleiotrópico .

Demografía editar ]

Mapa mundial de la distribución del alelo A del polimorfismo de un solo nucleótido rs17822931 en el gen ABCC11. La proporción de alelos A en cada población está representada por el área blanca en cada círculo.
La historia de la migración de humanos se remonta usando los alelos del gen ABCC11 . La variación entre la cera del oído y el olor corporal en las etnias de todo el mundo se debe específicamente a los alelos del gen ABCC11 . [7] Se presume que hace 40,000 años, una antigua tribu mongoloide desarrolló el fenotipo de la cera del oído seco que siguió a la propagación del alelo de la cera del oído seco a otras regiones de Asia a través de la migración de la antigua tribu. [10] El gen se propagó como resultado de ser una adaptación beneficiosa o mediante un mecanismo evolutivo de mutación neutral que pasó por eventos de deriva genética . [10]
La frecuencia de los alelos para la cera del oído seco y el sudor inodoro se concentra más en el este y noreste de Asia , especialmente en Corea , China , Mongolia y el oeste de Japón . [7] Por el contrario, la frecuencia del alelo para la cera húmeda del oído y el sudor oloroso es más alta en las poblaciones afroamericanas y subsaharianas . [7] Se puede extraer un gradiente descendente de los fenotipos de alelos de cera del oído seco desde el norte de China hasta el sur de Asia y también se puede dibujar un gradiente este-oeste desde el este de Siberia hasta Europa occidental. [7] Las frecuencias alélicasdentro de las etnias se siguió manteniendo porque el gen ABCC11 se hereda como un haplotipo , un grupo de genes o alelos que tienden a heredarse como una sola unidad [7] [11]
Se descubrió que la cantidad de compuestos orgánicos volátiles (COV) en la cera del oído está relacionada con la variación en el genotipo ABCC11 , que a su vez depende del origen étnico. En particular, el genotipo rs17822931, que es especialmente frecuente en los asiáticos orientales, se correlaciona con niveles más bajos de VOC.









La proteína 9 asociada a la resistencia a múltiples fármacos es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ABCC12 

ABCC12
Identificadores
AliasABCC12 , MRP9, casete de unión a ATP subfamilia C miembro 12
ID externosOMIM: 607041 MGI: 2441679 HomoloGene: 57211 GeneCards: ABCC12
esconderUbicación del gen (humano)
Cromosoma 16 (humano)
Chr.Cromosoma 16 (humano) [1]
Cromosoma 16 (humano)
Ubicación genómica para ABCC12
Ubicación genómica para ABCC12
Banda16q12.1comienzo48,081,006 pb [1]
Fin48,156,018 pb [1]
esconderPatrón de expresión de ARN
PBB GE ABCC12 gnf1h07939 en fs.png

PBB GE ABCC12 gnf1h07938 en fs.png
Más datos de expresión de referencia
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (ARNm)
RefSeq (proteína)
Ubicación (UCSC)Chr 16: 48.08 - 48.16 Mb


Función editar ]

Este gen es miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC) y la proteína codificada contiene dos dominios de unión a ATP y 12 regiones transmembrana. Las proteínas ABC transportan diversas moléculas a través de membranas extra e intracelulares. Los genes ABC se dividen en siete subfamilias distintas: ABC1 , MDR / TAP, MRP , ALD, OABP, GCN20 y White. Este gen es miembro de la subfamilia MRP que participa en la resistencia a múltiples fármacos. Este gen y otro miembro de la subfamilia están dispuestos cabeza a cola en el cromosoma 16q12.1. El aumento de la expresión de este gen está asociado con el cáncer de mama . 

No hay comentarios:

Publicar un comentario