Genomas secuenciados
Nanoarchaeum equitans es una especie de pequeño microorganismo perteneciente al dominio Archaea descubierto en 2002 en una fuente hidrotermal de la costa de Islandia.1Puesto que crece a temperaturas próximas al punto de ebullición se le considera unhipertermófilo. Nanoarchaeum equitans parece ser un simbionte obligado de la archaeaIgnicoccus pues debe estar en contacto con su huésped para sobrevivir. Sus células tiene un diámetro de solamente 400 nm, lo que le hace uno de los organismos más pequeños conocidos, exceptuando posiblemente nanobacterias y nanobios, cuyos status como organismos vivos son controvertidos. Su genoma consta solamente de 490.885nucleótidos; el genoma no viral más pequeño secuenciado, próximo al de Candidatus Carsonella ruddii.
El secuenciamiento del genoma de Nanoarchaeum ha revelado una gran cantidad de información sobre la biología de este organismo.2 Parecen faltar los genes de varias rutas metabólicas vitales. Nanoarchaeum no puede sintetizar la mayoría de losnucleótidos, aminoácidos, lípidos y cofactores. La célula obtiene muy probablemente estas biomoléculas de Ignicoccus. Sin embargo, al contrario que muchos microorganismos parásitos, Nanoarchaeum tiene muchas enzimas de reparación del ADN, así como todo lo necesario para realizar la replicación de ADN, transcripción ytraducción. Esto puede explicar porqué el genoma carece de las grandes secciones no codificadoras características del ADN de otros parásitos. La capacidad del organismo de producir su propio ATP está en cuestión. Nanoarchaeum carece de la capacidad de metabolizar hidrógeno y azufre para obtener la energía que necesita, como hacen muchos termófilos. Tiene cinco subunidades de ATP-sintetasa así como las rutas para la desaminación oxidativa. Actualmente se desconoce si obtiene energía de las moléculas biológicas importadas de Ignicoccus, o por el contrario recibe ATP directamente.
En la actualidad se discute si debe clasificarse en el filo Euryarchaeota3 o si por el contrario las diferencias genómicas son lo suficientemente grandes para darle su propio filo, Nanoarchaeota.
| Nanoarchaeum | ||
|---|---|---|
 Dos Nanoarcheum equitans parasitando unIgnicoccus | ||
| Taxonomía | ||
| Dominio: | Archaea | |
| Filo: | Nanoarchaeota | |
| Género: | Nanoarchaeum | |
| Especie: | N. equitans | |
Descripción y significado
Descubierto como pequeños puntos en otro organismo, Nanoarchaeum fue publicado como un organismo en la necesidad de un nuevo phylum entre los Archaea. Ellos no han sido capaces de crecer sobre su propio y mientras un estilo de vida parasitaria no se puede excluir en la actualidad, ha habido varias observaciones que promueven un modo simbiótica de la vida. Desde la publicación original, se han nanoarchaeotal 16 secuencias S rDNA se encuentran en los biotopos de alta temperatura de todo el mundo que están relacionados con Nanoarchaeum pero necesitan ser clasificadas en diferentes familias.
Estructura Genoma
Nanoarchaeum tiene un pequeño genoma con sólo 490 kb, que representa el genoma archaeal más pequeño hasta la fecha. Comparando ss secuencias de rRNA, se señaló que las identidades de secuencia eran más como archaeon que las especies bacterianas. No hubo diferencia, sin embargo, en la secuencia de identidad a la Crenarchaeota, Euryarchaeota, y 'Korarchaeota', lo que indica que representa un nuevo phylum archaeal.
Es muy común que las bacterias simbióticas y parásitas que tienen genomas pequeños. Pueden desarrollar éstos por la eliminación de genes que no sean necesarios y la adquisición de nuevos genes por transferencia lateral de genes. Es posible que N . equitans tuvieron una reducción del tamaño durante la adaptación a Ignicoccus o podría ser un antiguo genoma ya que se supone que los genomas de los primeros microorganismos eran pequeñas.
Recientemente, el genoma de nanoarchaeum Kin4-M se secuenció.
Estructura Celular y Metabolismo
Estas células coccus sólo son 400 nm de diámetro y están cubiertos por una capa S. Requieren contacto célula-célula con un crecimiento activo Ignicoccus celular con el fin de crecer. No hay efectos negativos se han observado en Ignicoccus células con la adición de Nanoarchaeum , haciendo alusión a una posible forma de vida no parasitario.Esta nueva Ignicoccus especies que se ha encontrado como Nanoarchaeum anfitrión, es un termófilo azufre reduciendo autótrofos.
Ecología
Este nuevo microorganismo fue identificado por primera vez a partir de rocas calientes tomadas en canto Kolbeinsey, al norte de Islandia. Este sistema hidrotermal se encuentra en el subpolar del Atlántico Medio Ridge en una profundidad estimada en 106 millones. N. equitans pueden crecer en el mismo rango de temperatura como su huésped, que es 70-98 o C, un pH alrededor de 6.0, y las concentraciones de sal de aproximadamente 2% de NaCl. Crecen en Ignicoccus células en lo que es ya sea una relación simbiótica o parasitaria.
Otros 16S rRNA nanoarchaeotal genes se han obtenido de la Dorsal del Pacífico Oriental (pH 6,5), la piscina de obsidiana en el Parque Nacional de Yellowstone (80 o C, pH 6,0), y Caldera Uzon en Kamchatka, Rusia (85 o C, pH 5,5).
Nanoarchaeum es una especie de marina Archaea que fue descubierto en 2002 en un respiradero hidrotermal de la costa de Islandia en la Kolbeinsey canto por Karl Stetter . Las cepas de este microbio se encontraron también en la Sub-polar del medio oceánico canto , y en el Obsidiana piscina enParque Nacional de Yellowstone . Puesto que crece en temperaturas cercanas a ebullición, en alrededor de 80 grados Celsius, se considera para ser un termófilo . Crece mejor en entornos de un pH de 6, y una concentración de salinidad del 2%. Nanoarchaeum parece ser un obligadosimbionte en la archaeon Ignicoccus ; que debe estar en contacto con el organismo huésped para sobrevivir. Nanoarchaeum no pueden sintetizar los lípidos pero ellos obtiene de su huésped. Sus células son solamente 400 nmde diámetro, lo que es el conocido organismo vivo al lado más pequeño, excepto posiblemente las nanobacterias y nanobios , cuya condición de organismos vivos es controvertido.
N. equitans genoma 'consta de un único cromosoma circular, y tiene un contenido promedio de G + C de 31,6%. Se carece de casi todos los genes necesarios para la síntesis de aminoácidos, nucleótidos, cofactores, y lípidos, pero codifica todo lo necesario para la reparación y la replicación.95% de su ADN codifica para las proteínas para las moléculas de ARN estables.
N. equitans tiene pequeños apéndices que salen de su estructura circular. La superficie de la célula está cubierta por una, S-capa en forma de celosía delgada, que proporciona estructura y protección para toda la célula.
Pan es un género de primates homínidos que comprende las especies Pan troglodytes(chimpancé común) y Pan paniscus (bonobo o chimpancé pigmeo). Por estudios degenética e inmunología se ha podido datar la divergencia entre su línea evolutiva y la deGorilla hace 7-8 millones de años y de la de Homo hace unos 6 millones de años. Las dos especies actuales se separaron de un último ancestro común hace unos 2 millones de años, tras quedar aisladas una de la otra por el río Congo.1 Los seres humanoscomparten el 96% del genoma con el chimpancé.- .....................................:https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Especial:Libro&bookcmd=download&collection_id=60a37efa61de0c8bdfb75b0f4190e46dd9192138&writer=rdf2latex&return_to=Pan+%28animal%29
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