miércoles, 20 de enero de 2016

Biología 2º de bachillerato

Genética molecular

 Mutaciones y evolución

Mutaciones
Las mutaciones son alteraciones en el material genético (Generalmente se considera al ADN)
Pueden producir consecuencias muy diversas dependiendo del tipo y localización:
Mutaciones en ARN; sólo cambian las proteínas hasta que el ARNm sea eliminado 
- Mutaciones en ADN; todos los ARN procedentes de la zona mutada estarán modificados

Mutaciones en una célula somática.
  • Pueden no afectarla si no se lee el gen mutado
  • Pueden alterar la célula o hacer que muera pero no tiene efectos sobre un organismo pluricelular con miles de millosnes de células
  • Puede dar lugar a una desregulación en su reproducción (tumor) y tener consecuencias importantes sobre el individuo.
Mutaciones en una célula reproductora.
Pueden ser heredadas por la descendencia, en cuyo caso, todas las células del hijo tendrán la mutación.
Las mutaciones son el origen de variabilidad genética y la evolución
Tipos de mutaciones:
GénicasAfectan a un gen.
Sustituciones, adiciones o pérdidas de nucleótidos
CromosómicasAfectan a una parte de un cromosoma
Delecciones, duplicaciones, inversiones, traslocaciones
GenómicasModifican el número de cromosomas
Haploidías, poliploidías, trisomías, ....
Mutaciones Génicas
Afectan a un gen
  • Sustituciones:
    Cambio de una base del ADN por otra diferente
  • Adiciones:
    Inclusión de una nueva base
  • Supresines o delecciones:
    Pérdida de una base
.
Sustitución
    Cambio de una base por otra
    Pueden tener varios efectos:
    • Silenciosa: Apesar de cambiar una base no hay cambio en los genes
      • Secuencias estructurales o que no se leen del ADN
      • Triplete codifica para el mismo aminoácido
      • Misma secuencia reguladora o de reconocimiento
    • Cambio de un aminoácido al modificarse un codón en el ARNm
      • Conservadora :
        Aminoácido cambiado es similar al original. No hay diferencias importantes en la proteína.
        Mutaciones neutras
      • No conservadora :
        Aminoácido cambiado tiene efectos importantes sobre la proteína
        - Cambio en su estructura tridimensional
        - Cambios en centros catalíticos, reguladores ....
    • Modificación de principio o fin de la traducción o de reconocimiento y fin de la trascripción.
      Efectos muy importantes sobre la proteína
      • Iniciacion de ARN pol - No se forma ARN mensajero
      • Bases que afectan al codon de iniciación en ARNm - No se forma la proteína
      • Bases que afectan al codon de terminación en el ARNm - Proteína más larga, generalmente no funcional.
      • Bases que afectan a códigos de principio o fin de la trascripción - Efectos semejantes a los anteriores.
    • Modificación de secuencias reguladoras
      Cambios en la regulación de la expresión del gen; más o menos proteína, no inhibición por mecanismos de regulacion ...
Adición o Inserción
Introducción de una base en un ADN
Produce cambios importantes al alterarse toda la secuencia de lectura del ARNm
Delección
Eliminación de una base
Produce cambios importantes al arterarse toda la secuencia de lectura del ARNm
Sin sentido
Cualquier tipo de mutación génica que de lugar a un triplete de fin, produciendo una proteína más corta o lo elimina produciendo una proteína más larga
Causas de las mutaciones génicas
En general la ADN polimerasas fabrica copias increiblemente fieles.
Se producen muy pocas mutaciones en un genoma (1E10).
Pueden producirse:
- Errores de lectura . Por cambios de configuración de las bases . Salto en la lectura por la ARN pol
- Lesiones o alteraciones de las bases: Reacciones normales en las células
- Trasposiciones de parte de un ADN
Para minimizar estos efectos existen enzimas reparadoras del ADN

Las tasas de mutación en el ADN aumentan si:
  • ADN polimerasa modificada con más propensión a errores
    Puede ser por alteraciones genéticas o por sustancias que modifiquen el funcionamineto de la ADNpol
  • Enzimas de la reparación del ADN modificadas
    Puede ser por alteraciones genéticas o por sustancias que modifiquen el funcionamineto de las enzimas reparadoras.
    Muchos casos de propensión al cáncer se deben a mecanismos de reparación deficientes.
  • Agentes mutágenos en el ambiente que actúen sobre el ADN
Agentes mutágenos
Procesos químicos o físicos que aumentan la tasa de mutación
  • Radiaciones ionizantes
    • Electromagnéticas de onda corta: UV, Rayos X y Gamma
    • Partículas con gran energía: electrones, neutrones y partículas alfa
  • Sustancias químicas muy variadas.
    Reaccionan con nucleótidos o los emulan
  • Algunos virus
 Video sobre mutaciones causadas por radiación y su reparación
Efectos
Las mutaciones pueden tener diferentes efectos sobre el organismo que las sufre
Compatibles con la vida
Cambio en el individuo más o menos nocivos
Letales
Dañan las células de modo que el individuo muere
Carcinógenas
Afectan al ciclo celular y al reconocimiento (metástasis)
Teratógenas
Se producen en el desarrollo embrionario.
Pueden producir malformaciones o zonas del individuo mutadas y otras no
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Evolución
Proceso evolutivo
Los seres vivos cambian a lo largo del tiempo adaptándose al medio en el que viven
Podemos entenderlo atendiendo a lo que ocure con los individuos o con lo genes que contienen sus células
Evolución en apuntes de 1º de bachillerato
Desde el punto de vista de los individuo
Los individuos de una especie se encuentran en diferentes circunstancias
- Debido a su situación física
- Debido al su historia individual (la vida que ha vivido, desarrollo, ...)
- Debido a su dotación genética (heredable)
Los que encuentran mejores condiciones se reproducen más
La dotación genética la heredan los descendientes (las otras variables no son caracteres heredables...)
Desplazan al resto de la población, se expanden los genes.
Cambia la especie
Desde el punto de vista de un gen
Los genes pasan de generación en generación mediante la reproducción
Las células son máquinas de supervivencia que permiten al gen perpetuarse
Los individuos pluricelulares son colonias de millones de células que sirven para propiciar la propagación de los genes mediante las células reproductoras
Los genes se agrupan con otros genes como equipos en competencia (genoma de un individuo)
Si el grupo encuentra condiciones adecuadas tiene más copias (descendientes)
Si el gen muta y tiene consecuencias positivas en el genoma se propaga
Si no las tiene se extingue
Mutaciones y evolución
Las mutaciones son la fuente última de variación
Son preadaptativas
No existen mecanismos que generen determinadas mutaciones
Menos aún las mutaciones adecuadas

Tasa de mutación muy baja 
Se producen en escasas ocasiones
Casi todas son perjudiciales por el grado de adaptación conseguido
Mutaciones, sexo y evolución
El sexo es un mecanismo que permite combinar dotaciones de genes de dos individuos
El mecanismo permite ir agrupando mutaciones beneficisas en el genoma de una especia acelerando su cambio evolutivo.
Captan mutaciones y las recombinan

Las células diploides llevan dos copias de cada gen: alelos
Los zigotos son siempre diploides
Los organismos pluricelulares pueden ser diploides en sus células somática (Ciclos diplobiónticos y esporofito de haplodiplobiónticos) en estos casos:
Algunos alelos pueden existir en el genomea pero no expresarse: alelos recesivos
- En otras ocasiones tiene influencia parecida: codominantes
- Otros se manifiestan con una sola copia: dominantes

Estas relaciones se producen entre casda par de alelos.
Los alelos recesivos pueden conservarse aunque sean perjudiciales cuando su frecuencia es baja.









El neodarwinismo se asienta en dos puntales que son la Selección Natural y las mutaciones genéticas.
Sobre la Selección Natural se ha revisado lo suficiente. Necesario es pues, que se analicen las mutaciones genéticas.

Antecedentes.
Los cromosomas que se pueden observar en el núcleo de las células, están formados fundamentalmente por ácido desoxirribonucleico (ADN), normalmente el ADN se halla extendido por todo el núcleo de la célula (fig.1), pero al aproximarse a la división celular, se condensa y enrolla junto con proteínas para formar los cromosomas, mocho más pequeños y compactos. Los seres humanos tenemos 46 cromosomas en cada célula, la mayoría de los cuales tienen forma de bastón (fig. 2).
Cromosomas después
de la división celular.
Cromosomas antes de la división celular.

Los cromosomas tienen como función guardar y transmitir la información (características externas e internas del individuo) a sus descendientes.
Las mutaciones son cambios en los cromo sornas, cambios que repercutirán en las características de sus descendientes.
Los cambios pueden ser por:
Supresiónfaltar un segmento del cromosoma,
Duplicaciónse repite la información en el cromosoma,
Inversiónun segmento gira dentro del mismo cromosoma.
Las mutaciones se deben a agentes mutagénicos, tales como:
rayos X
rayos gamma
rayos cósmicos
rayos ultravioleta
y otros tipos de radiación
El 99.9% de las mutaciones son desfavorables provocando cerca de mil enfermedades. Ej.:
Síndrome de Down
Distrofia muscular
Anemia falciforme
entre otros
Las supuestas mutaciones "favorables" de que hablan algunos científicos, no son verdaderas mutaciones. Son sólo una manifestación de la variabilidad genética que tiene todo organismo, que hace que en determinadas circunstancias se expresen genes que ya estaban presentes -aunque reprimidos- porque su funcionamiento no era necesario.
Las mutaciones sólo pueden alterar algo que ya existe.
No pueden crear nuevos genes.
No pueden aumentar la información.
Pero aún en el que caso de que existieran mutaciones "favorables", con eso no hacemos absolutamente nada. Pues la hipótesis evolucionista necesita, imprescindiblemente, no mutaciones favorables, sino transmutaciones.
Tratemos de visualizar por un momento, la increíble complejidad de un ojo, que consta de estructuras complicadísimas, tales como membranas exteriores, coroides, retina, cristalino, diafragma, humores, etc., que tienen que estar perfectamente desarrolladas y coordinadas para poder funcionar y cuya aparición al azar supondría obviamente la ocurrencia de miles de mutaciones "creativas" afectando el conjunto de genes que rigen ésta función.
Pero además, ¿de qué le serviría a un ser vivo desarrollar un ojo, sin desarrollar simultáneamente el nervio óptico (para transmitir el estimulo), El quiasma (para su interrelación), el tálamo óptico (para su procesamiento) y un área especifica de la corteza cerebral para la interpretación del estimulo?
Todas estas estructuras, o aparecen simultáneamente y en estado de plena perfección o no sirven para nada. Por lo contrario, son un estorbo para la supervivencia.
Recordemos también que todas las estructuras de un ser vivo están rigurosamente correlacionadas entre sí. Por consiguiente, para que un cambio significativo en una estructura o en una función sea viable, tiene que cambiar simultáneamente todo el organismo. Y para que esto ocurriera, tendría que cambiar todo el código genético, en forma simultánea y sin un sólo error. Es decir, debería ocurrir una mutación gigantesca, un reordenamiento radical de todo el genoma, dirigido y especificado hasta los más mínimos detalles para producir un ser viviente capaz de funcionar. Esto es, de vivir.
Allá por la década del 40 (sigloXX), R. Goldschmisdt ferviente evolucionista, después de haber dedicado casi toda su vida al estudio de las mutaciones concluye diciendo que es absolutamente imposible que ellas puedan explicar la transformación de las especies, explicándolo de la manera siguiente.
Según la teoría evolucionista las mutaciones originarían nuevas variedades o subespecies a partir de las especies y estas sub especies serían - siempre según el darwinismo - el origen del antecesor común de un nuevo grupo taxonómico, los mamíferos por ejemplo.
Pero este antecesor común tiene que ser - de acuerdo al evolucionismo - un organismo relativamente no especializado, para que pueda dar origen así a nuevas especies, ya que la evolución procedería de lo general a lo particular, esto es, del antecesor común a sus descendientes.
De manera que las mutaciones habrían primero diferenciado (especializado) una especie en sus variedades, y luego, esas mismas mutaciones habrían tenido que des-diferenciar (des-especializar) las sub-variedades, para formar el antecesor común - relativamente no especializado - de las nuevas especies.
Es decir que las mutaciones habrían tenido que ir primero en una dirección, y luego exactamente en la dirección opuesta.


La evolución ya desde antes del antecesor común a todos los seres vivos (también llamado LUCA, del inglés Last Universal Common Antecesor) se ha producido gracias a muchísimos cambios aleatorios en la secuencia de bases del ADNque llamamos mutaciones. Esto se origina por errores de la información genética contenida en las células –por factores químicos o físicos– y también su posterior propagación por replicación, siendo trascendentes para la evolución aquellas que luego se van a trasmitir a la descendencia: las células somáticas si la reproducción es asexual y los gametos si es sexual.
Por este motivo, decimos que las mutaciones son la fuente primaria de variabilidad génica, imprescindible para que exista evolución. Entonces, sin mutaciones no se presentaría la variabilidad genética que necesita la selección natural –además, dicha diversidad es importante para que la población se amolde (o adapte) con mayor éxito a los continuos cambios ambientales–. Permítanme hacer una analogía: si vamos a una tienda donde solo hay jerseys naranjas, no tenemos la opción de elegir cómo lo queremos, y si además este fuese el único establecimiento de la ciudad y el color naranja supusiese una desventaja , la población se va a pique. A no ser que en la tienda empiecen a vender jerseys de otros colores.
diversidad de zanahorias
Fig. 1: Toda la diversidad ha sido originada en primera instancia por mutaciones en la cadena de ADN que se han transmitido a la descendencia y han pasado el filtro de la selección natural. | Fuente: Liftarn
Estos nuevos artículos se consiguen por mutaciones aleatorias. Aunque las tasas de mutación suelen parecernos muy pequeñas (del orden de 10-8 mutaciones por célula) y, de hecho, se mantienen así gracias a la selección natural; lo cierto es que en un contexto evolutivo donde el tiempo se entiende a escala geológica, es una fuerza realmente importante.
Otro efecto destacable consiste en que la mayoría de las mutaciones sondeletéreas (suponen un perjuicio a sus portadores y son rápidamente eliminadas), por la sencilla razón que la mayoría de los genes que existen en una población han sobrevivido de entre otros muchos debido a que han adaptado mejor a sus portadores. Así, un nuevo gen que aparece por una mutación azarosa, difícilmente supondrá una ventaja, pero es necesario insistir en que la escala temporal con la que suele ocurrir la evolución es muy grande a nuestros ojos. Sin embargo, relacionado con esto, existe cierta controversia, ya que algunos autores hablan de monstruos prometedores o esperanzados (hopeful monsters), portadores de mutaciones drásticas que suponen una ventaja frente al resto y provocan evolución instantánea, aunque a penas hay evidencias de que esto ocurra.
mutante antennapedia
Fig. 2: Mutantes como Antennapedia (mosca Drosophila melanogaster con patas en lugar de antenas) son ejemplos de monstruos prometedores: una mutación artificial en un gen Hox (que determinan la identidad de cada segmento) puede desencadenar un cambio importante que, casi con toda seguridad, hará poco eficaz a su portador. | Fuente: Toony
Lo hemos dejado caer, pero no hemos hecho inciso en el carácter preadaptativode la mutación, es decir, que ocurre siempre antes de que se produzca la selección (ya que ésta no tiene telepatía, ni nada parecido, solo es una tendencia). Un caso típico de este hecho lo encontramos en los tratamientos con antibióticos. Estas sustancias atacan discriminadamente a los microorganismos, deteriorando o bloqueando ciertos punto cruciales para su proliferación. Sin embargo, su reproducción asexual hace que todos los organismos sean clones, pero su altísima tasa de duplicación hace que aparezcan mutantes que antes del tratamiento estarán en una proporción bajísima, pero las condiciones se vuelven tan estrictas que gran parte de los microorganismos mueren, aumentando la frecuencia de los mutantes resistentes, que además no tendrán el problema –al menos al principio– de competir con la población creciente. Así es como se produce la resistencia a antibióticos (y también a insecticidas) y, aunque popularmente se piense lo contrario, la mutación resistente se produce ANTES del tratamiento.
Existen dos tipos generales de mutaciones que se separan de modo más o menos arbitrario según se puedan apreciar a microscopio óptico (mutaciones cromosómicas) o no (mutaciones génicas):

— Mutaciones cromosómicas (Se pueden observar a microscopio).

Inversión: Cambio estructural en el que un segmento cromosómico cambia de sentido dentro del propio cromosoma, modificando la orientación de los genes que contiene.
Translocación: Cambio de posición relativa de un segmento cromosómico en el genoma; ya sea dentro del mismo cromosoma (t. intracromosómica), o bien en cualquier otro (t. intercromosómica). Un tipo especial de esta última es la translocación recíproca, donde dos cromosomas de un par distinto (no homólogos) intercambian sendos fragmentos.
Deleciones: Pérdida de una parte de un brazo cromosómico
Duplicaciones: Formación de una copia extra de una región, una junto a otra (d. en tándem) o en otras localizaciones (d. insercional).
Aneuploidía: El número de cromosomas aumenta o disminuye en uno o más cromosomas. Un ejemplo y conocido es Síndrome de Down o trisomía en par 21 que se produce cuando en un ser humano presenta un genoma con tres cromosomas 21.
Poliploidía: Las células del individuo tiene más de dos juegos de cromosomas. Por ejemplo, los plátanos son plantas triploides cuyas semillas son estériles y solo se pueden reproducir asexualmente.
tipos de mutaciones cromosómicas
Fig. 3: Los cuatro procesos principales que son responsables del cambio evolutivo | Fuente: Sverdrup; Traducción: EvoVagariO

— Mutaciones génicas (No se observan a microscopio).

Transición: sustitución de una purina por otra purina (A–>G, G–>A, C–>T, T–>C).
Transversión: sustitución de una purina por pirimidina (A–>C, C–>A, A–>T, T–>A, G–>T, T–>G, G–>C, C–>G).
Cambio de fase: inserción (adición) o deleción (eliminación) de uno o varios nucleótidos que, cuando no es múltiplo de tres, cambia la fase de lectura del ARNm, alterándose la secuencia aminoacidica y/o interrumpiéndose la síntesis.
No sinónimas: Cambio a otro codón que determina un aminoácido diferente.
Sinónimas: Cambio a un codón que determina el mismo aminoácido.
Sin sentido: Cambio a un codón de terminación.

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