Los rizobios , que fijan el nitrógeno y son simbióticos con las raíces de las plantas, aparecen en varias familias diferentes. Las cuatro familias Bradyrhizobiaceae , Hyphomicrobiaceae , Phyllobacteriaceae y Rhizobiaceae contienen al menos seis géneros de bacterias microsimbióticas fijadoras de nitrógeno, noduladas de leguminosas. Ejemplos son los géneros Bradyrhizobium y Rhizobium . Las especies de Methylocystaceae son metanótrofos ; usan metanol (CH 3 OH) o metano (CH 4) como su única fuente de energía y carbono. Otros géneros importantes son los patógenos humanos Bartonella y Brucella , así como Agrobacterium (útil en ingeniería genética ).
Taxonomía [ editar ]
Familias aceptadas [ editar ]
- Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939 (Listas aprobadas 1980) enmienda. Brenner y col . 1993
- Beijerinckiaceae Garrity et al . 2006
- Bradyrhizobiaceae Garrity et al . 2006
- Brucellaceae Breed et al . 1957
- Cohaesibacteraceae Hwang y Cho 2008 emend. Gallego y col . 2010
- Mabikibacteraceae Choi et al. 2017 [1]
- Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950
- Methylobacteriaceae Garrity et al . 2006
- Methylocystaceae Bowman 2006
- Phyllobacteriaceae Mergaert y Swings 2006
- Rhizobiaceae Conn 1938
- Rhodobiaceae Garrity et al . 2006
- Roseiarcaceae Kulichevskaya et al . 2014
- Xanthobacteraceae Lee et al . 2005
Familias provisionales [ editar ]
Estas familias se han propuesto pero aún no se han publicado de manera válida de acuerdo con las reglas del Código Bacteriológico .
- " Aurantimonadaceae " Denner et al . 2003
- "Devosiaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Kaistiaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Labriaceae" Beck et al . 2015 [3]
- "Lutibaculaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Methyloligellaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Methylopilaceae" Beck et al . 2015 [3]
- "Pleomorphomonadaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Rhodomicrobiaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Stappiaceae" Yarza et al . 2014 [2]
- "Thermopetrobacteraceae" Yarza et al . 2014 [2]
Genera incertae sedis [ editar ]
Los siguientes géneros pertenecen a los Rhizobiales pero no han sido asignados a una familia.
- Alsobacter Bao et al . 2014 [4]
- Amorphus Zeevi Ben Yosef et al . 2008 [5]
- Bauldia Yee y col . 2010 [6]
- Methylobrevis Poroshina y col . 2015 [7]
- Methyloceanibacter Takeuchi et al . 2014 [8]
- Methyloligella Doronina y col . 2014 [9]
- Vasilyevaea Yee y col . 2010 [6]
Filogenia [ editar ]
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con pie en la nomenclatura [10] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica [11] y la filogenia se basa en secuencias de genoma completo. [12]
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transformación genética natural [ editar ]
Se ha informado de la transformación genética natural en al menos tres especies de Rhizobiales: Agrobacterium tumefaciens , [13] Methylobacterium organophilum , [14] y Bradyrhizobium japonicum . [15] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio, y la integración de la secuencia del donante en el genoma del receptor por recombinación homóloga .
Los agentes de transferencia génica son elementos similares a virus producidos por Rhodobacterales que transfieren ADN y pueden ser un factor importante en su evolución.
Del griego rodon , la rosa y bakterion , una vara. Esto se refiere al color de los cultivos fototróficos aeróbicos de este orden de bacterias que pueden ser rosas o rojas debido a la producción de carotenoides.
Los Rhodospirillales son un orden de Proteobacterias , con dos familias: las Acetobacteraceae y las Rhodospirillaceae . [1]
Las Acetobacteraceae comprenden las bacterias del ácido acético , que son heterotróficas y producen ácido acético durante su respiración. [2] Las Rhodospirillaceae incluyen principalmente bacterias púrpuras no azufradas , que producen energía a través de la fotosíntesis .
| Rickettsiales | |
|---|---|
 | |
| Rickettsia rickettsii (puntos rojos) en la celda de una garrapata de venado | |
clasificación cientifica | |
| Dominio: | Las bacterias |
| Filo: | Proteobacterias |
| Clase: | Alphaproteobacteria |
| Orden: | Rickettsiales Gieszczkiewicz, 1939 |
| Familias | |
| |
Los Rickettsiales , informalmente llamados rickettsias , son un orden de pequeñas alfaproteobacterias que son endosimbiontes de células eucariotas. Algunos son patógenos notables, como Rickettsia , que causa una variedad de enfermedades en humanos, y Ehrlichia , que causa enfermedades en el ganado. Otro género de Rickettsiales bien conocidos es el Wolbachia , que infecta aproximadamente dos tercios de todos los artrópodos y casi todos los nematodos filariales. [2] Los estudios genéticos apoyan la teoría endosimbiótica según la cual las mitocondrias y los orgánulos relacionadosdesarrollado a partir de miembros de este grupo. [3]
Los Rickettsiales son difíciles de cultivar, porque dependen de las células huésped eucariotas para su supervivencia.
Filogenia Rickettsiales [ editar ]
Los Rickettsiales consisten además en tres familias conocidas, Rickettsiaceae , Midichloriaceae y Anaplasmataceae . La mayoría de los estudios también respaldan la inclusión de las Holosporaceae , pero un estudio ha desafiado esta opinión. [4] Aquí, las Holosporaceae son los únicos representantes de su propio orden, los Holosporales, y como tal no forman parte de los Rickettsiales (ver el árbol esquemático a continuación). También se han descrito otros linajes, que claramente no forman parte de ninguna familia. Los ejemplos incluyen Candidatus Arcanobacter lacustris [5] y la bacteria Rickettsiales Ac37b.
| Esquema de filogenia de ARN ribosómico de alfaproteobacterias | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| El cladograma de Rickettsidae ha sido inferido por Ferla et al. [6] de la comparación de secuencias de ARN ribosómico 16S + 23S . |
Relación filogenética entre Rickettsiales y Pelagibacterales (SAR11) [ editar ]
La relación filogenética entre estos dos grupos aún no ha llegado a un consenso en la literatura científica.
Los primeros informes sugirieron que representaban clados hermanos entre sí. [7] [8] Sin embargo, estudios posteriores sugirieron que esta relación es falsa y se debió a un artefacto filogenético, que agrupa artificialmente linajes independientes ricos en AT y de rápida evolución (Rickettsiales y Pelagibacterales tienen ambas propiedades) juntos. [9] [10] Al corregir este artefacto, los Pelagibacterales forman un clado hermano de los Rhizobiales , Rhodobacterales y Caulobacterales .
Otro estudio [4] se adhiere a la relación hermana entre los dos clados (ver árbol esquemático). En su clasificación, la relación entre los dos órdenes se retiene en la subclase, los Rickettsidae, que incluyen los Rickettsiales, los Pelagibacteriales y el extinto protomitocondrio (las mitocondrias en sí no son bacterias, sino orgánulos). [4]
Evolución reductiva [ editar ]
Los genomas de Rickettsiales están experimentando una evolución reductiva y son típicamente pequeños (generalmente <1 alto="" at="" baja="" codificaci="" con="" de="" densidad="" en="" font="" gc="" generalmente="" mbp="" mero="" n="" nbsp="" pseudogenes.="" relativamente="" ricos="" un="" una="" y="">[11] La reducción en el tamaño del genoma, el% GC y la densidad de codificación y los genes generalmente se atribuyen a la deriva genética y al trinquete de Muller . La deriva genética se mejora en los genomas de Rickettsiales debido a los bajos tamaños de población (dada su naturaleza endosimbiótica) y los frecuentes cuellos de botella de la población. Del mismo modo, el trinquete de Muller se activa por la falta de recombinación y transferencia horizontal de genes (la célula huésped eucariota es una barrera natural).
No hay comentarios:
Publicar un comentario