Thermales es un orden de bacterias que pertenecen al filo Deinococcus – Thermus . [1] Son particularmente resistentes al calor y viven en la zona bentónica del Golfo de México.
Chloroflexales es uno de los dos órdenes de bacterias en la clase Chloroflexi .
Eobacteria es un clado propuesto caracterizado por Cavalier-Smith . [1] Las especies en este grupo carecen de lipopolisacárido . [2]
Terrabacteria es un taxón que contiene aproximadamente dos tercios (6,157 sp.) De especies procariotas , incluidas las de los phyla gram positivos ( Actinobacteria y Firmicutes ), así como las Phyla Cyanobacteria , Chloroflexi y Deinococcus-Thermus . [1] [2]
Deriva su nombre ( terra = "tierra") de las presiones evolutivas de la vida en la tierra. Las terrabacterias poseen adaptaciones importantes como la resistencia a los peligros ambientales (p. Ej., Desecación, radiación ultravioleta y alta salinidad) y la fotosíntesis oxigenada . Además, las propiedades únicas de la pared celular en taxones grampositivos, que probablemente evolucionaron en respuesta a condiciones terrestres, han contribuido a la patogenicidad en muchas especies. [2] Estos resultados ahora dejan abierta la posibilidad de que las adaptaciones terrestres hayan jugado un papel más importante en la evolución procariota de lo que se entiende actualmente. [1] [2]
Terrabacteria se propuso en 2004 para Actinobacteria, Cyanobacteria y Deinococccus-Thermus [1] y se expandió más tarde para incluir Firmicutes y Chloroflexi. [2] Otros análisis filogenéticos [3] han respaldado las estrechas relaciones de estos filos. La mayoría de las especies de procariotas no colocadas en Terrabacterias fueron asignadas al taxón Hidrobacterias [2] (3,203 sp.), En referencia al ambiente húmedo inferido para el ancestro común de esas especies. Se dedujo que las Terrabacterias e Hidrobacterias divergieron hace aproximadamente 3 mil millones de años, lo que sugiere que la tierra (continentes) había sido colonizada por procariotas en ese momento. [2] Juntas, Terrabacteria e Hydrobacteria forman un gran grupo que contiene el 99% (9.360 sp.) De todas las Eubacterias, y se colocan en el taxón Selabacteria, en alusión a sus habilidades fototróficas ( selas = luz). [4]
Terrabacteria no debe confundirse con el taxón recientemente descrito " Glidobacteria ", [5] que incluye solo algunos miembros de Terrabacteria pero excluye Firmicutes y Actinobacteria, y no está respaldado por datos filogenéticos moleculares. [2]
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Sphaerobacter es un género de bacterias. Cuando se describió originalmente, se colocó en su propia subclase (Spahaerobacteridae) dentro de la clase Actinobacteria . Posteriormente, los estudios filogenéticos ahora lo han colocado en su propio orden Sphaerobacterales dentro del filo Chloroflexi . [1] [2] Hasta ahora solo se conoce una especie de este género ( Sphaerobacter thermophilus ). [3] El organismo cultivado relacionado más cercano a S. Thermophilus es el Thermomicrobium Roseum y tiene una similitud de secuencia del 87%, lo que indica que S. Thermophilus es una de las especies bacterianas más aisladas.
Las termodesulfobacterias son un filo [1] de bacterias termofílicas [2] reductoras de sulfato .
Filogenia [ editar ]
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Taxonomía [ editar ]
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con pie en la nomenclatura (LSPN) [4] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [5]
- Phylum Thermodesulfobacteria Garrity y Holt 2002 [Thermodesulfobacteraeota Oren et al. 2015 ]
- Clase Thermodesulfobacteria Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
- Orden Thermodesulfobacteriales Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
- Familia Thermodesulfobacteriaceae Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
- Género Caldimicrobium Miroshnichenko et al. 2009
- Especie C. rimae Miroshnichenko et al. 2009
- Especie C. thiodismutans Kojima, Umezawa y Fukui 2016
- Género " Geothermobacterium " ♠ Kashefi et al. 2002
- Especie " Geothermobacterium ferrireducens " ♠ Kashefi et al. 2002
- Género Thermodesulfatator Moussard et al. 2004
- Especies? T. autotrophicus Lai y col. 2016
- Especie T. atlanticus Alain et al. 2010
- Especie T. indicus Moussard et al. 2004 (tipo sp.)
- Género Thermodesulfobacterium Zeikus et al. 1995 enmend. Jeanthon y col. 2002
- Especie " T. geofontis " ♠ Hamilton-Brehm et al. 2013 (en prensa)
- Especies T. hidrogeniphilum Jeanthon et al. 2002
- Especie T. commune Zeikus et al. 1995 (tipo sp.)
- Especies T. hveragerdense Sonne-Hansen y Ahring 2000
- Especie T. thermophilum (Rozanova y Khudyakova 1974) Rozanova y Pivovarova 1995 [ Desulfovibrio thermophilus Rozanova y Khudyakova 1974 ; Thermodesulfobacterium mobile (Rozanova y Khudyakova 1974) Rozanova y Pivovarova 1991 ]
- Género Thermosulfurimonas Slobodkin et al. 2012
- Especies Thermosulfurimonas dismutans Slobodkin et al. 2012
- Género Caldimicrobium Miroshnichenko et al. 2009
- Familia Thermodesulfobacteriaceae Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
- Orden Thermodesulfobacteriales Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
- Clase Thermodesulfobacteria Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002
Notas:
♠ Cepa encontrada en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) pero no incluida en la Lista de nombres procariotas con Nomenclatura permanente (LPSN)
♠ Cepa encontrada en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) pero no incluida en la Lista de nombres procariotas con Nomenclatura permanente (LPSN)
Un termófilo es un organismo, un tipo de extremófilo , que prospera a temperaturas relativamente altas, entre 41 y 122 ° C (106 y 252 ° F) . [1] [2] Muchos termófilos son arqueas . Se sugiere que las eubacterias termofílicas se encuentran entre las primeras bacterias. [3]
Los termófilos se encuentran en varias regiones de la Tierra con calor geotérmico , como las aguas termales como las del Parque Nacional de Yellowstone (ver imagen) y las fuentes hidrotermales de aguas profundas , así como la materia vegetal en descomposición, como las turberas y el compost.
Los termófilos pueden sobrevivir a altas temperaturas, mientras que otras bacterias se dañarían y algunas veces matarían si se exponen a las mismas temperaturas.
Las enzimas en termófilos funcionan a altas temperaturas. Algunas de estas enzimas se usan en biología molecular , por ejemplo la polimerasa taq utilizada en la PCR . "Termófilo" se deriva del griego : θερμότητα ( thermotita ), que significa calor, y griego : φίλια ( philia ), amor.
Clasificación [ editar ]
Los termófilos se pueden clasificar de varias maneras. Una clasificación clasifica estos organismos de acuerdo con sus temperaturas óptimas de crecimiento: [4]
- Simplemente termófilos: 50–64 ° C
- Termófilos extremos 65–79 ° C
- Hipertermófilos a 80 ° C y más, pero no <50 c.="" font="">
En una clasificación relacionada, los termófilos se clasifican de la siguiente manera:
- Los termófilos facultativos (también llamados termófilos moderados) pueden prosperar a altas temperaturas, pero también a temperaturas más bajas (por debajo de 50 ° C (122 ° F)), mientras que
- Los termófilos obligatorios (también llamados termófilos extremos) requieren temperaturas tan altas para su crecimiento.
- Los hipertermófilos son termófilos particularmente extremos para los cuales las temperaturas óptimas son superiores a 80 ° C (176 ° F).
Muchos de los hipertermófilos Archea requieren azufre elemental para crecer. Algunos son anaerobios que usan el azufre en lugar del oxígeno como un receptor de electrones durante la respiración celular . Algunos son litótrofos que oxidan el azufre para crear ácido sulfúrico como fuente de energía, lo que requiere que el microorganismo se adapte a un pH muy bajo (es decir, es un acidófilo y un termófilo). Estos organismos son habitantes de ambientes calurosos y ricos en azufre, generalmente asociados con el vulcanismo , como aguas termales , géiseres yfumarolas . En estos lugares, especialmente en el Parque Nacional de Yellowstone, se produce la zonificación de microorganismos de acuerdo con su temperatura óptima. A menudo, estos organismos son de color, debido a la presencia de pigmentos fotosintéticos .
Termófilo versus mesófilo [ editar ]
Los termófilos pueden ser discriminados de los mesófilos de las características genómicas. Por ejemplo, los niveles de contenido de GC en las regiones de codificación de algunos genes de firmas se identificaron consistentemente como correlacionados con la condición del rango de temperatura cuando el análisis de asociación se aplicó a organismos mesofílicos y termofílicos independientemente de su filogenia, requerimiento de oxígeno, salinidad o condiciones del hábitat. . [5]
Transferencia génica e intercambio genético [ editar ]
Sulfolobus solfataricus y Sulfolobus acidocaldarius son arqueas hipertermófilas. Cuando estos organismos se exponen a los agentes que dañan el ADN, irradiación UV, bleomicina o mitomicina C, se induce la agregación celular específica de la especie. [6] [7] En S. acidocaldarius , la agregación celular inducida por UV media el intercambio de marcadores cromosómicos con alta frecuencia. [7] Las tasas de recombinación exceden las de los cultivos no inducidos en hasta tres órdenes de magnitud. Frols y col. [6] [8] y Ajon et al. [7] (2011) planteó la hipótesis de que la agregación celular mejora la transferencia de ADN específica de especie entre sulfolobuscélulas para proporcionar una mayor reparación del ADN dañado por medio de recombinación homóloga . Van Wolferen et al. [9], al analizar el intercambio de ADN en los hipertermófilos en condiciones extremas, señalaron que el intercambio de ADN probablemente desempeña un papel en la reparación del ADN mediante recombinación homóloga. Sugirieron que este proceso es crucial en condiciones que dañan el ADN, como la alta temperatura. También se ha sugerido que la transferencia de ADN en Sulfolobus puede ser una forma primitiva de interacción sexual similar a los sistemas de transformación bacteriana más bien estudiados que están asociados con la transferencia de ADN específica de la especie entre células que conduce a la reparación recombinacional homóloga del daño del ADN [ver Transformación (genética) ].
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