los virus : Nidovirales es un orden de virus que infectan a vertebrados. Presentan un genoma de ARN monocatenario de sentido positivo, por lo que se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Comprende la familia Coronaviridae1 2 y los génerosArterivirus3 y Okavirus, cada uno en su propia familia.
Este orden contiene el virus con el genoma ARN no segmentando más largo conocido: el virus de la hepatitis del ratón (MHV) que tiene un genoma de 31,5 kb. El genoma el virus presenta la misma estructura que el ARNm eucariota. Por tanto, el virus puede utilizar algunas proteínas de la célula huésped durante la replicación y expresión genética que se produce en elcitoplasma. A diferencia de muchos otros virus, el virión no contiene ninguna polimerasa puesto que su genoma puede leerse directamente cuando entra por primera vez en la célula huésped como si fuese ARNm.
En este grupo de virus, las proteínas estructurales se expresan separadamente de las no estructurales. Las proteínas estructurales se codifican en la región 3' del genoma y se expresan a partir de un conjunto ARNm subgenómico. Los virus codifican una proteasa principal y entre una y tres proteasas accesorias que están principalmente involucradas en la expresión de los genes replicasa. Estas proteasas también son responsables de la activación/desactivación de proteínas específicas en el instante correcto del ciclo vital del virus y así garantizar que la replicación se produce en el momento oportuno. Todavía hay un gran número de proteínas que han sido identificadas en los genomas de los nidovirales pero cuya función todavía se desconoce.
Los Orthomyxoviridae son una familia de virus RNA que infectan a los vertebrados. Incluyen a los virus causantes de la gripe.Se caracteriza por presentar envuelta y ser isométrico, con la siguiente morfología (del interior al exterior):
- Ribonucleoproteínas (8 segmentos en tipos A y B, 7 en C)
- ARN-Pol dependiente de ARN
- Proteína NS2
- Proteína de la matriz
- Glicoproteínas de membrana: Hemaglutinina (HA) y Neuraminidasa (NA)
La hemaglutinina (HA) es un trímero formado por tres polipéptidos cada uno de los cuales tiene una secuencia señal. Tras ella, aparece un dominio rico en sitios de glicosilación, y finalmente, una zona hidrófoba: el péptido fusogénico, que va a ser el responsable de la fusión de la membrana vírica con la celular para permitir la entrada a la célula. Por último, otra zona con la que se ancla a la membrana.
Se caracteriza por tener varios puentes disulfuro internos responsables de la estructura. Para que la proteína sea funcional, debe producirse un corte justo antes del péptido fusogénico. Si no se produce este corte, la proteína es afuncional y el virus no puede infectar. Las dos partes cortadas de la molécula siguen unidas por puentes disulfuro.
La neuraminidasa (NA) es un tetrámero formado por pequeños polipéptidos con una región de anclaje a membrana y una región globular funcional. Las zonas más expuestas funcionan en el reconocimiento del hospedador, pero también como determinantes antigénicos.El genoma está fragmentado en 8 moléculas (7 en el InfluenzavirusC): Las 6 primeras codifican una proteína cada una. Las 2 últimas, codifican dos proteínas cada una.
El fragmento 7 codifica la proteína de la matriz y una segunda proteína capaz de funcionar como canal iónico en la membrana (M2).
El fragmento 8 codifica 8 proteínas que mejoran la efectividad de la infección. Algunas zonas del genoma se aparean para ganar resistencia contra ARNasas celulares. Todos los fragmentos están unidos a nucleoproteínas. En el interior de la partícula, además, está la ARN-Pol, que es un complejo de tres proteínas codificadas por los fragmentos 1, 2 y 3.
El ARN del virus, sólo funciona como molde para la ARN-Pol si está unido a las nucleoproteínas. Se producen dos procesos de polimerización: Formación de ARNm y formación de ARN (+) como intermediario replicativo.
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