viernes, 20 de diciembre de 2019

LISTA DE GENES CODIFICADORES


El transportador de casete de unión a ATP ABCA1 (miembro 1 de la subfamilia de transportadores humanos ABCA), también conocida como la proteína reguladora del flujo de colesterol (CERP) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ABCA1 [5] Este transportador es un importante regulador del colesterol celular y la homeostasis de los fosfolípidos .


ABCA1
Identificadores
AliasABCA1 , cassette de unión a ATP, subfamilia A (ABC1), miembro 1, Abca1, ABC-1, Abc1, ABC1, CERP, HDLDT1, TGD, subfamilia de cassette de unión a ATP A miembro 1, HDLCQTL13, HPALP1
ID externosOMIM: 600046 MGI: 99607 HomoloGene: 21130 GeneCards: ABCA1
esconderUbicación del gen (humano)
Cromosoma 9 (humano)
Chr.Cromosoma 9 (humano) [1]
Cromosoma 9 (humano)
Ubicación genómica para ABCA1
Ubicación genómica para ABCA1
Banda9q31.1comienzo104.781.006 pb [1]
Fin104,928,155 pb [1]





Enfermedad de Tánger editar ]

Se descubrió que una mutación en la proteína ABCA1 es responsable de causar la enfermedad de Tánger por varios grupos en 1998. El grupo de Gerd Schmitz en Alemania [6] y el grupo de Michael Hayden en Columbia Británica [7] estaban usando técnicas genéticas estándar y ADN de pedigríes familiares. para localizar la mutación El grupo de Richard Lawn en CV Therapeutics en Palo Alto, California, utilizó microarrays de ADNc, que eran relativamente nuevos en ese momento, para evaluar los perfiles de expresión génica a partir de líneas celulares creadas a partir de individuos normales y afectados. [8] Mostraron líneas celulares de pacientes con enfermedad de Tánger, mostraron regulación diferencial del gen ABCA1. La secuenciación posterior del gen identificó las mutaciones. Este grupo recibió un premio de la American Heart Association por su descubrimiento. [9] La enfermedad de Tánger se ha identificado en casi 100 pacientes en todo el mundo, y los pacientes tienen una amplia gama de fenotipos bioquímicos y clínicos, ya que se han identificado más de 100 mutaciones diferentes en ABCA1 que resultan en la enfermedad. [10]

Función editar ]

La proteína asociada a la membrana codificada por este gen es un miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC) . Las proteínas ABC transportan diversas moléculas a través de membranas extra e intracelulares. Los genes ABC se dividen en siete subfamilias distintas (ABCA, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Esta proteína es miembro de la subfamilia ABCA. Los miembros de la subfamilia ABCA comprenden la única subfamilia ABC principal que se encuentra exclusivamente en eucariotas multicelulares. Con el colesterol como sustrato, esta proteína funciona como una bomba de salida de colesterol en la vía de eliminación de lípidos celulares. [11] [12]
Si bien la estructura 3D completa de ABCA1 sigue siendo relativamente desconocida, ha habido alguna determinación del término c. El terminal c ABCA1 contiene un dominio PDZ , responsable de mediar las interacciones proteína-proteína, así como un motivo VFVNFA esencial para la actividad del flujo de lípidos. [10]

Rol fisiológico editar ]

ABCA1 media el flujo de salida de colesterol y fosfolípidos a apolipoproteínas pobres en lípidos (apo-A1 y apoE), que luego forman lipoproteínas nacientes de alta densidad (HDL). También media el transporte de lípidos entre Golgi y la membrana celular . Dado que esta proteína se necesita en todo el cuerpo, se expresa de manera ubicua como una proteína de 220 kDa . Está presente en mayores cantidades en los tejidos que transportan o están involucrados en el recambio de lípidos como el hígado, el intestino delgado y el tejido adiposo. [13]
Los factores que actúan sobre la expresión del transportador ABCA1 o su modificación postraduccional también son moléculas que participan en su función posterior, como los ácidos grasos , el colesterol y también las citocinas y el AMPc . [14] También se informa que otros metabolitos endógenos más poco relacionados con las funciones ABCA1 influyen en la expresión de este transportador, incluida la glucosa y la bilirrubina . [15] [16]
Las interacciones entre miembros de la familia apolipoproteína y ABCA1 activan múltiples vías de señalización, incluyendo la JAK-STAT , PKA y PKC vías [17]
Se ha informado que la sobreexpresión de ABCA1 induce resistencia a la curcumina antioxidante diarilheptanoide antiinflamatoria [18] La regulación a la baja de ABCA1 en los macrófagos senescentes altera la capacidad de la célula para eliminar el colesterol de su citoplasma, lo que lleva a las células a promover la aterogénesis patológica (engrosamiento / endurecimiento de los vasos sanguíneos) que "desempeña un papel central en enfermedades comunes asociadas con la edad, como la aterosclerosis, cáncer y degeneración macular " [19] Los modelos de ratones con AMD inactivados tratados con agonistas que aumentan ABCA1 en la pérdida de función y los experimentos de ganancia de función demostraron el papel protector de elevar ABCA1 en la regulación de la angiogénesis en enfermedades oculares. Se utilizaron datos humanos de pacientes y controles para demostrar la traducción de los hallazgos de ratones en enfermedades humanas. [20]

Importancia clínica editar ]

Las mutaciones en este gen se han asociado con la enfermedad de Tánger y la deficiencia familiar de lipoproteínas de alta densidad . Se ha demostrado que ABCA1 se reduce en la enfermedad de Tánger, que presenta deficiencias fisiológicas de HDL. [21] [22] La expresión génica de los leucocitos ABCA1 está regulada positivamente en mujeres posmenopáusicas que reciben terapia de reemplazo hormonal (HRP) . [23]

Mapa de ruta interactiva editar ]

Haga clic en los genes, proteínas y metabolitos a continuación para vincular a los artículos respectivos. [§ 1]
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Camino de estatinas editar
  1. ^ El mapa de ruta interactiva se puede editar en WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430" .

















El miembro 2 de la subfamilia A del casete de unión a ATP es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ABCA2 [5] [6]
La proteína asociada a la membrana codificada por este gen es un miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC). Las proteínas ABC transportan diversas moléculas a través de membranas extra e intracelulares. Los genes ABC se dividen en siete subfamilias distintas (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Esta proteína es miembro de la subfamilia ABC1. Los miembros de la subfamilia ABC1 comprenden la única subfamilia ABC principal que se encuentra exclusivamente en eucariotas multicelulares. Esta proteína se expresa altamente en el tejido cerebral y puede desempeñar un papel en el metabolismo de los lípidos de los macrófagos y el desarrollo neuronal. Se han encontrado dos variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas para este gen.

ABCA2
Identificadores
AliasABCA2 , cassette de unión a ATP, subfamilia A (ABC1), miembro 2, AI413825, Abc2, D2H0S1474E, mKIAA1062, cassette de unión a ATP subfamilia A miembro 2
ID externosOMIM: 600047 MGI: 99606 HomoloGene: 55590 GeneCards: ABCA2
ocultar laubicación del gen (humano)
Cromosoma 9 (humano)
Chr.Cromosoma 9 (humano) [1]
Cromosoma 9 (humano)
Ubicación genómica para ABCA2
Ubicación genómica para ABCA2
Banda9q34.3comienzo137,007,234 pb [1]
Fin137,028,922 pb















El miembro 3 de la subfamilia A del casete de unión a ATP es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ABCA3 [5] [6]
La proteína asociada a la membrana codificada por este gen es un miembro de la superfamilia de transportadores de casete de unión a ATP (ABC). Las proteínas ABC transportan diversas moléculas a través de membranas extra e intracelulares. Los genes ABC se dividen en siete subfamilias distintas (ABC1, MDR / TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). Esta proteína es miembro de la subfamilia ABC1. Los miembros de la subfamilia ABC1 comprenden la única subfamilia ABC principal que se encuentra exclusivamente en eucariotas multicelulares. El transportador completo codificado por este gen puede estar involucrado en el desarrollo de resistencia a los xenobióticos y la envoltura durante la muerte celular programada. 

ABCA3
Identificadores
AliasABCA3 , casete de unión a ATP, subfamilia A (ABC1), miembro 3, ABC-C, ABC3, EST111653, LBM180, SMDP3, casete de unión a ATP subfamilia A miembro 3
ID externosOMIM: 601615 MGI: 1351617 HomoloGene: 37437 GeneCards: ABCA3
ocultar laubicación del gen (humano)
Cromosoma 16 (humano)
Chr.Cromosoma 16 (humano) [1]
Cromosoma 16 (humano)
Ubicación genómica para ABCA3
Ubicación genómica para ABCA3
Banda16p13.3comienzo2.275.881 pb [1]
Fin2.340.746 pb [1]
ocultar elpatrón de expresión de ARN
PBB GE ABCA3 204343 en fs.png
Más datos de expresión de referencia



Importancia clínica editar ]

Las mutaciones en ABCA3 están asociadas al síndrome de catarata-microcórnea . [7]

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