Apuntes de Botánica

Sistemática. Grandes Grupos. Amebozoos (Amoebozoa)

Mixomicetos Craterium minutum

Mixomicetos Ceratiomyxa fruticulosa

Mixomicetos Arcyria affinis

Características

• Eucariotas.
• Organismos ameboides que pueden desplazarse por pseudópodos, por medio de flujo interno de citoplasma.
• Unicelulares la mayoría o desarrollan plasmodios.
• Holocárpicos.
• Pueden presentar flagelos.
• Viven en medios húmedos, suelo o son acuáticos.
• Pueden ser simbióticos o parásitos.
• Nutrición elemental por fagocitosis
• Incluyen: mixomicetos (mohos mucilaginosos) y la mayor parte de las amebas.

La Sistemática Molecular (Filogenética Molecular) es la que utiliza fundamentalmente la información de las secuencias de los ácidos nucleicos ADN o ARN para inferir relaciones de parentesco entre los organismos.

La sistemática molecular trata de establecer relaciones en base a las mutaciones de las secuencias del ADN.
Cuando estas variaciones (caracteres) son compartidas entre dos organismos se entiende que están emparentados.
Sin embargo hay que tener encuenta que la semejanza puede deberse a otros fenómenos como reversiones o convergencia:

• En las reversiones un carácter modificado vuelve a su estado original.
• En las convergencias organismos no emparentados comparten el mismo carácter, a menudo por la misma presión evolutiva o paralelismos (homoplasia, órganos análogos y homólogos).

Tipos de secuencias utilizadas
El ADN aparece en los eucariotas en el núcleo, las mitocondrias y los cloroplastos. Su herencia es diferente:

• ADN nuclear: se hereda normalmente de forma biparental. El más utilizado es el ADN que codifica para ARN ribosomal.
• ADN mitocondrial y cloroplastidial: se hereda por parte de uno solo de los progenitories, generalmente por parte de la madre ya que a menudo estos orgánulos se transfieren a través de los óvulos. El ADN de los cloroplastos es muy estable y no se reordena con mucha frecuencia, por lo que es más utilizado en los análisis moleculares.

La mayor parte de los estudios de sistemática molecular se han realizado sobre el ADN que codifica el ARN ribosomal y el ADN del cloroplasto.

• ADN ribosomal
  Es el ADN que codifica para ARN ribosomal o "ARNr".
  El ARN ribosomal primero fue secuenciado directamente, sin referencia a los genes que lo codificaban, debido al alto número de copias presente en cada célula, lo que hacía fácil su extracción y secuenciación.
• ADN cloroplastidial.
  • Gen rbcL.
    Este gen codifica para la subunidad grande de la enzima RuBisCO.
    El gen fue elegido porque es prácticamente universal en todo el reino de las plantas.
    Muchos sistemáticos de plantas han hecho un esfuerzo comunitario para generar una gran base de datos de secuencias del gen del cloroplasto llamado rbcL. (La subunidad pequeña de la RubisCO está condificada por un gen del ADN nuclear rbcS)
  • Otros genes cloroplastídicos
    La tasa de mutaciones de rbcL es baja, por lo que se han utilizado otros genes del cloroplasto: ndhF, rpoA, rpoC2, matK, atpB, atp1, atp2, matR, etc.

Técnicas básicas para obtener información molecular

• Mapeo por sitios de restricción:
  Utilizando enzimas de restricción (endonucleasas) se corta el ADN por sitios con una secuencia conocida, los trozos de ADN separado se analizan de forma independiente según su tamaño. Los fragmentos separados se analizan mediante electroforesis.
• Secuenciación del ADN:
  Se determina la secuencia de nucleótidos de la cadena de ADN (Adenina, Timina, Citosina, Guanina), para realizarlo se necesita una cantidad importante de material genético que se obtiene por PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa), sin embargo puede introducir errores y se debe trabajar con las dos cadenas de ADN complementarias.

Blastocladiomycota Allomyces

Ascomycota Morchella vulgaris

Basidiomycota Cantharellus cibarius

Características

• Eucariotas.
• Unicelulares o pluricelulares.
• Heterótrofos, saprótrofos o parásitos.
• Forman un clado monofilético.
• Cuando está presente el flagelo único es opistoconto.
• Presencia de quitina cuando hay pared celular.
• Incluyen organismos unicelulares, los hongos verdaderos (Fungi) y animales verdaderos

Embriófitos Polypodium cambricum

Algas verdes Caulerpa prolifera

Algas rojas Nemalion helminthoides

Glaucofitos Glaucocystis

Características

• Eucariotas.
• Pluricelulares en su mayoría, pero también algunos unicelulares.
• Plastidios rodeados por dos membranas, que parecen proceder a partir de endosimbiosis primaria de cianofitas.
• Clorofilas a y generalmente b.
• Células sin centríolos
• Mitocondrias con crestas planas.
• Incluyen: plantas verdes -embriófitos, algas verdes (Chlorophyta, Charophyta)-, algas rojas (Rhodophyta), Glaucophyta.

Haptofitas Prymnesium	Criptofitas Cryptomonas	Dinofíceas Gonyaulax
Diatomeas	Xantofíceas Tribonema	Feofitas Desmarestia
Oomicetos Phytophthora	Hifoquitridiomicetos Rhizidiomyces apophysatus	Labirintulomicetos Thraustochytrium

Caracerísticas

Eucariotas.

Unicelulares o pluricelulares.

Autótrofos en su mayor parte, con clorofila a y c.

Plastos originados por una endosimbiosis secundaria de alguna rodofita, generalmente tienen tilacoides agrupados de tres en tres (también denomiados Chromophyta).

Pared celular de celulosa.

Flagelos generalmente heterocontos y pleurocontos.

Incluyen: además de los radiolarios, foraminíferos y ameboflagelados, estudiados clásicamente por los zóologos (Rhizaria), tres grandes grupos estudiados fundamentalmente por los botánicos:

• Hacrobia: algas haptofitas y criptofitas
• Alvelolados (Alveolate): dinoflagelados y otros ciliados
• Stramenopiles
• autótrofos: algas diatomeas, crisofíceas, xantofíceas, eustigmatofíceas y feofítas
• heterótrofos: mohos acuáticos (oomicetos, hifoquitridiomicetos y labirintulomicetos)

Euglena

Phacus triqueter

Colacium arbuscula

Características

• Eucariotas.
• Unicelulares, protistas.
• Autótrofos y heterótrofos, simbiontes y parásitos.
• Mitocondrias clásicas ausentes o mitocondrias con crestas generalmente discoidales, menos a menudo tubulares o planas.
• Generalmente 2, 4 o más flagelos.
• Aparato digestivo ventral que aparece con frecuencia.
• Incluye las euglenas, y otros grupos como los parásitos Trypanosoma (enfermedad del sueño), Trichomonas (triconomiasis).