sábado, 24 de octubre de 2015

Genética

Genomas secuenciados

Candida albicans es un hongo diploide asexual (forma de levadura).2 3 saprófito de lafamilia de los Sacaromicetos.
Normalmente se encuentra en la cavidad oral, en el tracto gastrointestinal y en la vagina. Está envuelta en un rol relevante en la digestión de los azúcares mediante un proceso de fermentación.

Sinonimia y binomios obsoletos

  • Oidium albicans C.P.Robin, (1853)
  • Saccharomyces albicans (C.P.Robin) Reess, (1877)
  • Dematium albicans (C.P.Robin) Laurent{?}, (1889)
  • Monilia albicans (C.P.Robin) Zopf, (1890)
  • Parasaccharomyces albicans (C.P.Robin) Mello & L.G.Fern. (1918)
  • Myceloblastanon albicans (C.P.Robin) M.Ota4 (1927)
  • Mycotorula albicans (C.P.Robin) Langeron & Talice5 (1932)
  • Syringospora albicans (C.P.Robin) C.W.Dodge, (1935)
  • Procandida albicans (C.P.Robin) E.K.Novák & Zsolt6 (1961)

Patologías conocidas

Candida albicans puede asumir patogeneidad provocando la candidiasis; en ese caso se presenta como una afección vaginal (vaginitis), de la cavidad oral (muguet), delintestino o de la piel.
En un físico debilitado, inmunodeprimido o convaleciente de un larga cura antibiótica, la Candida se multiplica en modo anómalo y, atraviesa el intestino, para entrar al torrente sanguíneo, donde libera sus propias toxinas provocando la candidemia. Este fenómeno da lugar a algunos síntomas abdominales: mala digestión, gases e hichazón, molestias intestinales (estreñimiento o diarrea), intolerancia alimentaria, irritabilidad, insomnio, pérdida de la memoria, dolores de cabeza y depresión.
La candidosis induce también una disminución de la absorción de las sustancias nutritivas por lo que se podría producir un estado de malnutrición.

Genoma

Uno de los más interesantes hechos del genoma de C. albicans es la ocurrencia de rearreglos numéricos y estructurales cromosomales, como medio de generar diversidad genética, dando longitudes de cromosomas con polimorfismo (contracción / expansión de repeticiones), translocaciones recíprocas, borrados cromosómicostrisomía de cromosomas individuales. Estas alteraciones del cariotipo lideran cambios en el fenotipo, que es una estrategia de adaptación de esta levadura. Estos mecanismos genéticos serán mejor interpretados con el análisis completo del genoma de C. albicans.
Su genoma en la "raza SC5314" fue secuenciado en la en:Stanford DNA Sequencing and Technology Center.7 8 El genoma de la cepa WO1 fue secuenciado por el Instituto Broad de MIT y Harvard.9
El secuenciado del genoma de C. albicans y subsecuentemente de los genomas de varias otras médicamente relevantes especies de Candida ha cambiado profundamente e irreversiblemente los modos de estudiar las spp. de Candida.3 El secuenciado genómico de C. albicans fue lanzado en octubre de 1996. Y así durante 10 años, culminando con el lanzamiento del agrupamiento del diploide 19, que provee una versión haploide del genoma, acompañado de datos de regiones alélicas en el genoma.3 Otra refinada conjunción 20 con ocho ensambles de cromosomas de C. albicans ha sido lanzado en 2006. Otras secuenicas genómicas de Candida se están desarrollando para: C. glabrataC. dubliniensisC. parapsilosisC. guilliermondiiC. lusitaniae, y C. tropicalis.3
El genoma de C. albicans es altamente dinámico y esta variabilidad ha sido usada ventajosamente en estudios epidemiológicos moleculares de C. albicans y estudios de población en esta especie. Un descubrimiento remarcable que ha sido llevado en la secuenciación del genoma es la presencia de un ciclo parasexual en C. albicans. Este ciclo parasexual está bajo el control de loci de masculinidad, y permuta entre fenotipos blanco y opaco. Investigando el rol que el proceso de apareamiento juega en la dinámica de las poblaciones de C. albicans o en otros aspectos de la biología y la patogeneidad de C. albicans representa un importante foco para futuros estudios.3

Tratamientos

(Ver candidiasis) según la extensión de la infección y el estado general del paciente se decide un tratamiento tópico o sistémico. Así tópicamente se puede emplear cotrimazol al 1 por ciento, miconazol, ketoconazol, sertoconazol, terbinafina o naftilina. Los tratamientos sistémicos más frecuentemente empleados son itraconazol o fluconazol. El pronóstico es bueno siendo curativos tanto los tratamientos tópicos como sistémicos. Pero si los factores predisponentes de estas micosis no se corrigen es posible otra nueva infección.






Carsonella ruddii (Candidatus) es una proteobacteria gamma endosimbionte. Tiene elgenoma más pequeño de todas las bacterias caracterizadas.1 Es un endosimbionte que está presente en todas las especies de Psyllida, unos insectos chupadores de savia.2 3La endosimbiosis se produce en una estructura especializada que se conoce con el nombre de bacterioma.
El genoma de C. ruddii consiste en un cromosoma circular de 159.662 pares de bases. El genoma tiene una alta densidad de código (97%) con muchos genes solapados y de pequeña longitud. El número de genes predicho es 182, también el más bajo conocido. En comparación, Nanoarchaeum equitans, que tiene el genoma más pequeño conocido entre los organismos de vida libre, tiene un genoma de 490.885 nucleótidos. Numerosos genes considerados esenciales para la vida están ausentes, lo que sugiere que la especie ha alcanzado un status próximo al de orgánulo.

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