sábado, 24 de octubre de 2015

Genética

Genomas secuenciados

El orangután de Sumatra (Pongo abelii) es una de las dos especies existentes de orangutanes, la más rara. Viven sólo en la isla indonesa de Sumatra. Se diferencian de la otra especie de orangután más que nada en su tamaño, siendo esta especie más pequeña.
Los orangutanes tienen 48 cromosomas diploides.3 El genoma del orangután de Sumatra fue secuenciado en enero 2011, sobre la base de una hembra en cautividad llamada «Susie».4 Desde la secuenciación del genoma de los seres humanos y de loschimpancés, los orangutanes de Sumatra se han convertido en la tercera especie de homínido5 en tener su genoma secuenciado.4 6
Los investigadores también publicaron menos copias completas de diez orangutanes salvajes, cinco de Borneo y cinco de Sumatra. Se encontró que la diversidad genéticafue menor en los orangutanes de Borneo (Pongo pygmaeus) que en los de Sumatra (Pongo abelii), a pesar de que en Borneo hay entre seis y siete veces más orangutanes que Sumatra. La comparación ha demostrado que estas dos especies divergieron hace unos 400 000 años, más recientemente de lo que se pensaba. También se encontró que el genoma del orangután ha evolucionado mucho más lentamente que el del chimpancé y el de los humano.









Propionibacterium acnes es un bacilo Gram-positivo, de crecimiento relativamente lento, no esporulado yanaerobio estricto, aunque se cree que posee aerotolerancia. Se halla en la biota normal de la piel y es catalogado como actor secundario en la infección dérmica. Está vinculado al acné, puede causar blefaritis crónica y es el principal causante de endoftalmitis postquirúrgicas crónicas. Su genoma ha sido secuenciado, poniendo de manifiesto varios genes que podrían generar las enzimas degradantes de la piel y las proteínas inmunogénicas (que activan el sistema inmune).
La bacteria es en gran parte comensal y está presente en la piel de la mayoría de las personas alimentándose de losácidos grasos del sebo secretado por los poros desde las glándulas sebáceas. También puede encontrarse en todo elaparato digestivo del ser humano y de muchos otros animales. Su nombre se deriva de la capacidad de la bacteria de generar ácido propiónico.

Papel en patologías

Cuando un poro de la piel se bloquea, esta bacteria anaerobia prolifera y segrega sustancias químicas que rompen la pared del poro, derramando bacterias como el Staphylococcus aureus en la piel y originando una lesión de acné (foliculitis). También se la ha encontrado en úlceras de córnea. En contadas ocasiones se han reportado daños en las válvulas del corazón ocasionando endocarditis y también infecciones de las articulaciones (artritis séptica). Además, Propionibacterium se han encontrado en los puntos de inserción de ventriculostomia y en las suturas subcutáneas de pacientes que han sido sometidos a craneotomía.

Sensibilidad antibiótica

P. acnes es sensible al peróxido de benzoilo, al grupo de la tetraciclina, otros antibióticos y muchos preparados antibacterianos. Sin embargo, son frecuentes las cepas resistentes a la tetraciclina. La clindamicina es también de uso frecuente. Recientemente se ha mostrado que P. acnes es sensible a algunos macrólidos como la azitromicina, que tiene un amplio espectro de acción. Normalmente se prescriben 500 mg por vía oral, tres veces por semana durante 4 a 6 semanas. La azitromicina exhibe un efecto post-antibiótico concentrándose en el tejido pulmonar durante aproximadamente cinco días. De hecho, debe utilizarse alguna crema o pomada antibacteriana durante el tratamiento, lo que da un buen efecto local. Otro antibiótico es el nadifloxacino del grupo de los llamados 4-fluoroquinolonas tales como ciprofloxacinoofloxacino y levofloxacino. Tiene acción contra P. acnes y algunos otros microorganismos que pueden tomar parte en una poli-infección.







Saccharopolyspora erythraea, anteriormente conocido como Streptomyces erythraeus,1 es una especie de bacteria del orden Actinomycetes, dentro del géneroSaccharopolyspora.
Saccharopolyspora erythraea es conocido por la producción del antibiótico macrólidoeritromicina. El Citocromo P450 eryF (CYP107A1) original de la bacteria es el responsable de la biosintesis del antibiótico por la hidroxilación de C6 del macrólido 6-deoxieritronolida B.
El genoma secuenciado de la Saccharopolyspora erythraea comprende 8.212.805 pares de bases, las cuales codifican 7264 genes. El genoma es circular, como el de losActinomycetales patógenos Mycobacterium tuberculosis y Corynebacterium diphtheriae, a diferencia de los cromosomas lineales del Streptomyces coelicolor A3 y el estrechamente relacionado Streptomyces avermitilis. El genoma del S. erythraea contiene al menos 25 grupos de genes para la producción de metabolitos secundarios conocidos o predichos para conferir resistencia a un rango de antibióticos comunes y muchas series de genes duplicados para soportar su estilo de vida saprofito. La disponibilidad de la secuencia genómica del S. erythraea proveera mejor entendimiento de su biología y facilitara el desarrollo racional de cepas que mejoren la producción de antibioticos de importancia clínica.


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